RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263233.8

SYP-201, Transcript of synaptophysin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYP, Length 2,498 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-201ENST00000263233 CDK2AP2O75956 126 aa8.89□□□□□ -0.99
SYP-201ENST00000263233 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa8.88□□□□□ -0.99
SYP-201ENST00000263233 LCA10Q71F78 164 aa8.88□□□□□ -0.99
SYP-201ENST00000263233 A0A087WTM6 91 aa8.87□□□□□ -0.99
SYP-201ENST00000263233 A6NED7 52 aa8.86□□□□□ -0.99
SYP-201ENST00000263233 SPAG11AQ6PDA7 123 aa8.86□□□□□ -0.99
SYP-201ENST00000263233 NUPR2A6NF83 97 aa8.86□□□□□ -0.99
SYP-201ENST00000263233 HRES1P13985 223 aa8.86□□□□□ -0.99
SYP-201ENST00000263233 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa8.86□□□□□ -0.99
SYP-201ENST00000263233 PLAC8Q9NZF1 115 aa8.85□□□□□ -0.99
SYP-201ENST00000263233 DNAH8Q96JB1 4490 aa8.85□□□□□ -0.99
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SYP-201ENST00000263233 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa8.8□□□□□ -1
SYP-201ENST00000263233 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa8.8□□□□□ -1
SYP-201ENST00000263233 Q5W150 140 aa8.79□□□□□ -1
SYP-201ENST00000263233 VPS13DQ5THJ4 4388 aa8.79□□□□□ -1
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SYP-201ENST00000263233 HYDINQ4G0P3 5121 aa8.79□□□□□ -1
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SYP-201ENST00000263233 DNAH17Q9UFH2 4485 aa8.73□□□□□ -1.01
SYP-201ENST00000263233 A6NN06 94 aa8.73□□□□□ -1.01
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SYP-201ENST00000263233 IGLV7-43P04211 117 aa8.72□□□□□ -1.01
SYP-201ENST00000263233 PRR26Q8N8Z3 221 aa8.72□□□□□ -1.01
SYP-201ENST00000263233 C8orf87E5RJ46 101 aa8.66□□□□□ -1.02
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SYP-201ENST00000263233 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa8.65□□□□□ -1.02
SYP-201ENST00000263233 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa8.64□□□□□ -1.03
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SYP-201ENST00000263233 DMAC1Q96GE9 116 aa8.62□□□□□ -1.03
SYP-201ENST00000263233 LINC00313P59037 77 aa8.61□□□□□ -1.03
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SYP-201ENST00000263233 FAM229AH3BQW9 127 aa8.58□□□□□ -1.04
SYP-201ENST00000263233 IGKV2-30P06310 120 aa8.56□□□□□ -1.04
SYP-201ENST00000263233 C7orf65Q6ZTY9 151 aa8.56□□□□□ -1.04
SYP-201ENST00000263233 SACSQ9NZJ4 4579 aa8.55□□□□□ -1.04
SYP-201ENST00000263233 DNAH6Q9C0G6 4158 aa8.55□□□□□ -1.04
SYP-201ENST00000263233 DNAH11Q96DT5 4516 aa8.55□□□□□ -1.04
SYP-201ENST00000263233 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa8.54□□□□□ -1.04
SYP-201ENST00000263233 LY6G6CO95867 125 aa8.53□□□□□ -1.04
SYP-201ENST00000263233 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa8.52□□□□□ -1.05
SYP-201ENST00000263233 KRTAP10-2P60368 255 aa8.5□□□□□ -1.05
SYP-201ENST00000263233 DNAH5Q8TE73 4624 aa8.5□□□□□ -1.05
SYP-201ENST00000263233 A0A1B0GU69 56 aa8.48□□□□□ -1.05
SYP-201ENST00000263233 PKHD1P08F94 4074 aa8.46□□□□□ -1.06
SYP-201ENST00000263233 FAT2Q9NYQ8 4349 aa8.45□□□□□ -1.06
SYP-201ENST00000263233 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa8.42□□□□□ -1.06
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SYP-201ENST00000263233 SPATA8Q6RVD6 105 aa8.41□□□□□ -1.06
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SYP-201ENST00000263233 LRP1BQ9NZR2 4599 aa8.4□□□□□ -1.06
SYP-201ENST00000263233 RYR3Q15413 4870 aa8.4□□□□□ -1.06
SYP-201ENST00000263233 Q6ZSA8 131 aa8.4□□□□□ -1.07
SYP-201ENST00000263233 KRTAP10-1P60331 282 aa8.39□□□□□ -1.07
SYP-201ENST00000263233 RYR2Q92736 4967 aa8.38□□□□□ -1.07
SYP-201ENST00000263233 MIR22HGQ0VDD5 57 aa8.36□□□□□ -1.07
SYP-201ENST00000263233 UQCR11O14957 56 aa8.35□□□□□ -1.07
SYP-201ENST00000263233 PRAC1Q96KF2 57 aa8.34□□□□□ -1.07
SYP-201ENST00000263233 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
SYP-201ENST00000263233 ADM2Q7Z4H4 148 aa8.32□□□□□ -1.08
SYP-201ENST00000263233 C4orf48Q5BLP8 95 aa8.3□□□□□ -1.08
SYP-201ENST00000263233 TYMSOSQ8TAI1 123 aa8.28□□□□□ -1.08
SYP-201ENST00000263233 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa8.28□□□□□ -1.08
SYP-201ENST00000263233 SPINK1P00995 79 aa8.27□□□□□ -1.09
SYP-201ENST00000263233 Q8N1X5 172 aa8.25□□□□□ -1.09
SYP-201ENST00000263233 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
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SYP-201ENST00000263233 LINC01554Q52M75 96 aa8.16□□□□□ -1.1
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SYP-201ENST00000263233 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
SYP-201ENST00000263233 FAT1Q14517 4588 aa8.12□□□□□ -1.11
SYP-201ENST00000263233 C9orf92A6NGG3 77 aa8.07□□□□□ -1.12
SYP-201ENST00000263233 A8MUU9 505 aa8.07□□□□□ -1.12
SYP-201ENST00000263233 CSAG1Q6PB30 78 aa8.07□□□□□ -1.12
SYP-201ENST00000263233 H0YAA0 97 aa8.06□□□□□ -1.12
SYP-201ENST00000263233 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa8.06□□□□□ -1.12
SYP-201ENST00000263233 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa8.06□□□□□ -1.12
SYP-201ENST00000263233 APOBP04114 4563 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
SYP-201ENST00000263233 KIAA1109Q2LD37 5005 aa8□□□□□ -1.13
SYP-201ENST00000263233 H3BS24 57 aa8□□□□□ -1.13
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SYP-201ENST00000263233 A0A1B0GVY2 172 aa7.98□□□□□ -1.13
SYP-201ENST00000263233 A0A1B0GU33 70 aa7.98□□□□□ -1.13
SYP-201ENST00000263233 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa7.97□□□□□ -1.13
SYP-201ENST00000263233 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa7.95□□□□□ -1.14
SYP-201ENST00000263233 HSPG2P98160 4391 aa7.93□□□□□ -1.14
SYP-201ENST00000263233 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa7.92□□□□□ -1.14
SYP-201ENST00000263233 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
SYP-201ENST00000263233 COX6B2Q6YFQ2 88 aa7.87□□□□□ -1.15
SYP-201ENST00000263233 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
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