RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640501.1

PNKP-231, Transcript of polynucleotide kinase 3'-phosphatase, human

TSL 5

Gene PNKP, Length 151 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PNKP-231	ENST00000640501	CCDC179	H3BU77	68 aa		5.14	□□□□□ -1.59
PNKP-231	ENST00000640501	PANO1	I0J062	215 aa		5.14	□□□□□ -1.59
PNKP-231	ENST00000640501	TRAV7	A0A075B6U4	112 aa		5.13	□□□□□ -1.59
PNKP-231	ENST00000640501	ZNF861P	O60384	105 aa		5.13	□□□□□ -1.59
PNKP-231	ENST00000640501	SS18L2	Q9UHA2	77 aa		5.13	□□□□□ -1.59
PNKP-231	ENST00000640501	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		5.13	□□□□□ -1.59
PNKP-231	ENST00000640501	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		5.13	□□□□□ -1.59
PNKP-231	ENST00000640501	LINC00483	Q53H64	154 aa		5.12	□□□□□ -1.59
PNKP-231	ENST00000640501	SCX	Q7RTU7	201 aa		5.12	□□□□□ -1.59
PNKP-231	ENST00000640501	KRTAP11-1	Q8IUC1	163 aa		5.12	□□□□□ -1.59
PNKP-231	ENST00000640501	FBN3	Q75N90	2809 aa		5.11	□□□□□ -1.59
PNKP-231	ENST00000640501		J3KT08	172 aa		5.11	□□□□□ -1.59
PNKP-231	ENST00000640501	PRKDC	P78527	4128 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
PNKP-231	ENST00000640501	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		5.11	□□□□□ -1.59
PNKP-231	ENST00000640501	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
PNKP-231	ENST00000640501		A0A087WSZ3	146 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PNKP-231	ENST00000640501	IGKV4-1	P06312	121 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PNKP-231	ENST00000640501	LYST	Q99698	3801 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PNKP-231	ENST00000640501	IGLV7-43	P04211	117 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PNKP-231	ENST00000640501	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PNKP-231	ENST00000640501	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PNKP-231	ENST00000640501	NDUFB1	O75438	58 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PNKP-231	ENST00000640501	NDUFC1	O43677	76 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PNKP-231	ENST00000640501	TG	P01266	2768 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PNKP-231	ENST00000640501	DNAH10	Q8IVF4	4471 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PNKP-231	ENST00000640501	STARD9	Q9P2P6	4700 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PNKP-231	ENST00000640501	TMEM258	P61165	79 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PNKP-231	ENST00000640501	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PNKP-231	ENST00000640501	HCG22	E2RYF7	251 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PNKP-231	ENST00000640501	DSCR10	P59022	87 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PNKP-231	ENST00000640501	KRTAP10-2	P60368	255 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PNKP-231	ENST00000640501		Q6ZSA8	131 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PNKP-231	ENST00000640501		Q8N9L7	120 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PNKP-231	ENST00000640501		A8MWP4	228 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PNKP-231	ENST00000640501		K7EQZ3	153 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PNKP-231	ENST00000640501	CDK2AP2	O75956	126 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PNKP-231	ENST00000640501	CD164	Q04900	197 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PNKP-231	ENST00000640501	SSBP3-AS1	Q7Z2R9	100 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PNKP-231	ENST00000640501	C20orf197	Q8N268	126 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PNKP-231	ENST00000640501	LCE6A	A0A183	80 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PNKP-231	ENST00000640501	KLKP1	Q107X0	134 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PNKP-231	ENST00000640501	MOBP	Q13875	183 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PNKP-231	ENST00000640501	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PNKP-231	ENST00000640501	LINC00472	Q9H8W2	130 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PNKP-231	ENST00000640501	ALMS1	Q8TCU4	4167 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PNKP-231	ENST00000640501	DNHD1	Q96M86	4753 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PNKP-231	ENST00000640501	ATP5E	P56381	51 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
PNKP-231	ENST00000640501	C5orf47	Q569G3	176 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PNKP-231	ENST00000640501	PRR15	Q8IV56	129 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PNKP-231	ENST00000640501	OCR1	Q9BZK8	76 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PNKP-231	ENST00000640501		A0A0G2JQZ4	141 aa		5	□□□□□ -1.61
PNKP-231	ENST00000640501	KRTAP10-1	P60331	282 aa		5	□□□□□ -1.61
PNKP-231	ENST00000640501	TMEM254	Q8TBM7	123 aa		5	□□□□□ -1.61
PNKP-231	ENST00000640501	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		5	□□□□□ -1.61
PNKP-231	ENST00000640501	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		5	□□□□□ -1.61
PNKP-231	ENST00000640501	CASC2	Q6XLA1	102 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PNKP-231	ENST00000640501	MP68	P56378	58 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PNKP-231	ENST00000640501	DEFB116	Q30KQ4	102 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PNKP-231	ENST00000640501	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PNKP-231	ENST00000640501	LIMD2	Q9BT23	127 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PNKP-231	ENST00000640501	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PNKP-231	ENST00000640501	FAM236D	A0A1B0GTK5	79 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PNKP-231	ENST00000640501		H3BPC8	53 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PNKP-231	ENST00000640501	FAM236C	P0DP71	79 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PNKP-231	ENST00000640501	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PNKP-231	ENST00000640501	ASB16-AS1	Q495Z4	193 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PNKP-231	ENST00000640501	C4orf48	Q5BLP8	95 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PNKP-231	ENST00000640501	WFDC13	Q8IUB5	93 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PNKP-231	ENST00000640501	TP53AIP1	Q9HCN2	124 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PNKP-231	ENST00000640501	DNAH2	Q9P225	4427 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PNKP-231	ENST00000640501	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PNKP-231	ENST00000640501	SNURF	Q9Y675	71 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PNKP-231	ENST00000640501	HECTD4	Q9Y4D8	3996 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PNKP-231	ENST00000640501		A0A0U1RQV1	116 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PNKP-231	ENST00000640501		A0A1B0GVX0	72 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PNKP-231	ENST00000640501	hDV103S1	A0JD37	113 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PNKP-231	ENST00000640501	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PNKP-231	ENST00000640501	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PNKP-231	ENST00000640501		H7BZZ5	65 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PNKP-231	ENST00000640501	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PNKP-231	ENST00000640501	C8orf87	E5RJ46	101 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PNKP-231	ENST00000640501		Q5XG85	94 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PNKP-231	ENST00000640501		Q96NJ1	140 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PNKP-231	ENST00000640501	C8orf17	Q9NRJ1	99 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PNKP-231	ENST00000640501	KMT2A	Q03164	3969 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PNKP-231	ENST00000640501	IGHV6-1	A0A0B4J1U7	121 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PNKP-231	ENST00000640501	MMP24-AS1	A0A0U1RRL7	71 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PNKP-231	ENST00000640501	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PNKP-231	ENST00000640501	SPAG11A	Q6PDA7	123 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PNKP-231	ENST00000640501	SERP1	Q9Y6X1	66 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PNKP-231	ENST00000640501	TRAV22	A0A0B4J277	110 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PNKP-231	ENST00000640501		H0Y9P7	68 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PNKP-231	ENST00000640501	SPINK1	P00995	79 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PNKP-231	ENST00000640501	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PNKP-231	ENST00000640501	MRPL34	Q9BQ48	92 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PNKP-231	ENST00000640501	CYSTM1	Q9H1C7	97 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PNKP-231	ENST00000640501		A0A1B0GVY2	172 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PNKP-231	ENST00000640501	NDUFS5	O43920	106 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PNKP-231	ENST00000640501		A0A087X002	238 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PNKP-231	ENST00000640501	RPS29	P62273	56 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63

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