RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637570.1

DCX-211, Transcript of doublecortin, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene DCX, Length 6,162 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCX-211ENST00000637570 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
DCX-211ENST00000637570 MYO9AB2RTY4 2548 aa3.59□□□□□ -1.83
DCX-211ENST00000637570 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa3.58□□□□□ -1.84
DCX-211ENST00000637570 MTORP42345 2549 aa3.57□□□□□ -1.84
DCX-211ENST00000637570 CEP295Q9C0D2 2601 aa3.56□□□□□ -1.84
DCX-211ENST00000637570 ABCA12Q86UK0 2595 aa3.56□□□□□ -1.84
DCX-211ENST00000637570 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
DCX-211ENST00000637570 A6NN06 94 aa3.56□□□□□ -1.84
DCX-211ENST00000637570 TNP1P09430 55 aa3.55□□□□□ -1.84
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DCX-211ENST00000637570 KRTAP10-2P60368 255 aa3.55□□□□□ -1.84
DCX-211ENST00000637570 CEP350Q5VT06 3117 aa3.54□□□□□ -1.84
DCX-211ENST00000637570 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa3.54□□□□□ -1.84
DCX-211ENST00000637570 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa3.53□□□□□ -1.84
DCX-211ENST00000637570 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa3.53□□□□□ -1.84
DCX-211ENST00000637570 PRR34Q9NV39 138 aa3.53□□□□□ -1.84
DCX-211ENST00000637570 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
DCX-211ENST00000637570 KRTAP1-1Q07627 177 aa3.52□□□□□ -1.85
DCX-211ENST00000637570 A0A096LNT2 108 aa3.52□□□□□ -1.85
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DCX-211ENST00000637570 FREM2Q5SZK8 3169 aa3.5□□□□□ -1.85
DCX-211ENST00000637570 CENPFP49454 3210 aa3.5□□□□□ -1.85
DCX-211ENST00000637570 JMJD1CQ15652 2540 aa3.5□□□□□ -1.85
DCX-211ENST00000637570 KRTAP10-1P60331 282 aa3.5□□□□□ -1.85
DCX-211ENST00000637570 MYO15AQ9UKN7 3530 aa3.49□□□□□ -1.85
DCX-211ENST00000637570 HECTD1Q9ULT8 2610 aa3.49□□□□□ -1.85
DCX-211ENST00000637570 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa3.49□□□□□ -1.85
DCX-211ENST00000637570 XIRP2A4UGR9 3374 aa3.48□□□□□ -1.85
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DCX-211ENST00000637570 REV3LO60673 3130 aa3.46□□□□□ -1.86
DCX-211ENST00000637570 ACANP16112 2415 aa3.46□□□□□ -1.86
DCX-211ENST00000637570 HTTP42858 3142 aa3.43□□□□□ -1.86
DCX-211ENST00000637570 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
DCX-211ENST00000637570 KRTAP12-2P59991 146 aa3.43□□□□□ -1.86
DCX-211ENST00000637570 BPTFQ12830 3046 aa3.42□□□□□ -1.86
DCX-211ENST00000637570 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa3.42□□□□□ -1.86
DCX-211ENST00000637570 POLQO75417 2590 aa3.42□□□□□ -1.86
DCX-211ENST00000637570 CHD9Q3L8U1 2897 aa3.42□□□□□ -1.86
DCX-211ENST00000637570 KRTAP10-10P60014 251 aa3.42□□□□□ -1.86
DCX-211ENST00000637570 DNAH12Q6ZR08 3092 aa3.42□□□□□ -1.86
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DCX-211ENST00000637570 CDH23Q9H251 3354 aa3.4□□□□□ -1.86
DCX-211ENST00000637570 CHD7Q9P2D1 2997 aa3.4□□□□□ -1.87
DCX-211ENST00000637570 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
DCX-211ENST00000637570 SZT2Q5T011 3432 aa3.4□□□□□ -1.87
DCX-211ENST00000637570 LINC00472Q9H8W2 130 aa3.39□□□□□ -1.87
DCX-211ENST00000637570 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa3.38□□□□□ -1.87
DCX-211ENST00000637570 TRANK1O15050 2925 aa3.38□□□□□ -1.87
DCX-211ENST00000637570 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
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DCX-211ENST00000637570 TLN2Q9Y4G6 2542 aa3.34□□□□□ -1.87
DCX-211ENST00000637570 DNAH14Q0VDD8 3507 aa3.33□□□□□ -1.88
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DCX-211ENST00000637570 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa3.31□□□□□ -1.88
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DCX-211ENST00000637570 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa3.3□□□□□ -1.88
DCX-211ENST00000637570 DCHS1Q96JQ0 3298 aa3.29□□□□□ -1.88
DCX-211ENST00000637570 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
DCX-211ENST00000637570 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
DCX-211ENST00000637570 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa3.27□□□□□ -1.89
DCX-211ENST00000637570 CFAP46Q8IYW2 2715 aa3.26□□□□□ -1.89
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DCX-211ENST00000637570 LAMA3Q16787 3333 aa3.25□□□□□ -1.89
DCX-211ENST00000637570 UNC79Q9P2D8 2635 aa3.25□□□□□ -1.89
DCX-211ENST00000637570 C5orf42Q9H799 3197 aa3.25□□□□□ -1.89
DCX-211ENST00000637570 BRCA2P51587 3418 aa3.25□□□□□ -1.89
DCX-211ENST00000637570 MAST4O15021 2626 aa3.25□□□□□ -1.89
DCX-211ENST00000637570 CHD6Q8TD26 2715 aa3.24□□□□□ -1.89
DCX-211ENST00000637570 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
DCX-211ENST00000637570 XP32Q5T750 250 aa3.23□□□□□ -1.89
DCX-211ENST00000637570 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
DCX-211ENST00000637570 USP34Q70CQ2 3546 aa3.22□□□□□ -1.89
DCX-211ENST00000637570 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
DCX-211ENST00000637570 IGSF10Q6WRI0 2623 aa3.21□□□□□ -1.9
DCX-211ENST00000637570 ITPR3Q14573 2671 aa3.2□□□□□ -1.9
DCX-211ENST00000637570 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
DCX-211ENST00000637570 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
DCX-211ENST00000637570 AKAP13Q12802 2813 aa3.19□□□□□ -1.9
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DCX-211ENST00000637570 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa3.17□□□□□ -1.9
DCX-211ENST00000637570 KRTAP10-5P60370 271 aa3.17□□□□□ -1.9
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DCX-211ENST00000637570 WDFY4Q6ZS81 3184 aa3.14□□□□□ -1.91
DCX-211ENST00000637570 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa3.14□□□□□ -1.91
DCX-211ENST00000637570 ZFHX4Q86UP3 3567 aa3.14□□□□□ -1.91
DCX-211ENST00000637570 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
DCX-211ENST00000637570 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
DCX-211ENST00000637570 LOC400499M0QZD8 3231 aa3.13□□□□□ -1.91
DCX-211ENST00000637570 DSPP15924 2871 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
DCX-211ENST00000637570 A0A0C4DFX4 3053 aa3.13□□□□□ -1.91
DCX-211ENST00000637570 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa3.13□□□□□ -1.91
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