RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	NPC2	P61916	151 aa		2.93	□□□□□ -1.94
EFHC1-223	ENST00000636616	SS18	Q15532	418 aa		2.93	□□□□□ -1.94
EFHC1-223	ENST00000636616	ETDB	Q3ZM63	59 aa		2.93	□□□□□ -1.94
EFHC1-223	ENST00000636616	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		2.93	□□□□□ -1.94
EFHC1-223	ENST00000636616	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		2.93	□□□□□ -1.94
EFHC1-223	ENST00000636616	COX7B2	Q8TF08	81 aa		2.93	□□□□□ -1.94
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	2.93	□□□□□ -1.94
EFHC1-223	ENST00000636616	PRR34	Q9NV39	138 aa		2.93	□□□□□ -1.94
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A096LPF7	62 aa		2.92	□□□□□ -1.94
EFHC1-223	ENST00000636616	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		2.92	□□□□□ -1.94
EFHC1-223	ENST00000636616	ATXN8	Q156A1	80 aa		2.92	□□□□□ -1.94
EFHC1-223	ENST00000636616	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		2.92	□□□□□ -1.94
EFHC1-223	ENST00000636616	BRK1	Q8WUW1	75 aa		2.92	□□□□□ -1.94
EFHC1-223	ENST00000636616	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		2.92	□□□□□ -1.94
EFHC1-223	ENST00000636616	NACA	E9PAV3	2078 aa		2.92	□□□□□ -1.94
EFHC1-223	ENST00000636616	LYST	Q99698	3801 aa		2.91	□□□□□ -1.94
EFHC1-223	ENST00000636616	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		2.91	□□□□□ -1.94
EFHC1-223	ENST00000636616	C5orf38	Q86SI9	138 aa		2.91	□□□□□ -1.94
EFHC1-223	ENST00000636616	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		2.9	□□□□□ -1.94
EFHC1-223	ENST00000636616	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		2.9	□□□□□ -1.94
EFHC1-223	ENST00000636616	HTN3	P15516	51 aa		2.9	□□□□□ -1.94
EFHC1-223	ENST00000636616	LINC00158	P58513	81 aa		2.9	□□□□□ -1.94
EFHC1-223	ENST00000636616	TEN1	Q86WV5	123 aa		2.9	□□□□□ -1.94
EFHC1-223	ENST00000636616	TRAV7	A0A075B6U4	112 aa		2.9	□□□□□ -1.95
EFHC1-223	ENST00000636616	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		2.9	□□□□□ -1.95
EFHC1-223	ENST00000636616	KRTAP5-8	O75690	187 aa		2.9	□□□□□ -1.95
EFHC1-223	ENST00000636616	KRTAP1-4	P0C5Y4	121 aa		2.9	□□□□□ -1.95
EFHC1-223	ENST00000636616	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		2.9	□□□□□ -1.95
EFHC1-223	ENST00000636616	PPDPFL	Q8WWR9	84 aa		2.9	□□□□□ -1.95
EFHC1-223	ENST00000636616	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		2.89	□□□□□ -1.95
EFHC1-223	ENST00000636616	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		2.89	□□□□□ -1.95
EFHC1-223	ENST00000636616	DEFB131B	A0A096LNP1	70 aa		2.89	□□□□□ -1.95
EFHC1-223	ENST00000636616	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		2.89	□□□□□ -1.95
EFHC1-223	ENST00000636616	NUPR2	A6NF83	97 aa		2.89	□□□□□ -1.95
EFHC1-223	ENST00000636616	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	2.89	□□□□□ -1.95
EFHC1-223	ENST00000636616	LELP1	Q5T871	98 aa		2.89	□□□□□ -1.95
EFHC1-223	ENST00000636616	SPINT4	Q6UDR6	99 aa		2.89	□□□□□ -1.95
EFHC1-223	ENST00000636616	C2orf82	Q6UX34	121 aa		2.89	□□□□□ -1.95
EFHC1-223	ENST00000636616	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		2.89	□□□□□ -1.95
EFHC1-223	ENST00000636616	LINC01600	Q96MT4	127 aa		2.89	□□□□□ -1.95
EFHC1-223	ENST00000636616	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	2.88	□□□□□ -1.95
EFHC1-223	ENST00000636616	CCL18	P55774	89 aa		2.88	□□□□□ -1.95
EFHC1-223	ENST00000636616	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		2.88	□□□□□ -1.95
EFHC1-223	ENST00000636616	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		2.88	□□□□□ -1.95
EFHC1-223	ENST00000636616		Q8IZM0	81 aa		2.88	□□□□□ -1.95
EFHC1-223	ENST00000636616		Q8N9L7	120 aa		2.88	□□□□□ -1.95
EFHC1-223	ENST00000636616	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		2.87	□□□□□ -1.95
EFHC1-223	ENST00000636616	CRP	P02741	224 aa		2.87	□□□□□ -1.95
EFHC1-223	ENST00000636616	CRYGA	P11844	174 aa		2.87	□□□□□ -1.95
EFHC1-223	ENST00000636616	COX17	Q14061	63 aa		2.87	□□□□□ -1.95
EFHC1-223	ENST00000636616	CLEC2B	Q92478	149 aa		2.87	□□□□□ -1.95
EFHC1-223	ENST00000636616		R4GN34	69 aa		2.87	□□□□□ -1.95
EFHC1-223	ENST00000636616	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		2.87	□□□□□ -1.95
EFHC1-223	ENST00000636616	KMT2A	Q03164	3969 aa		2.87	□□□□□ -1.95
EFHC1-223	ENST00000636616		H0YGX0	51 aa		2.86	□□□□□ -1.95
EFHC1-223	ENST00000636616	KLK12	Q9UKR0	248 aa		2.86	□□□□□ -1.95
EFHC1-223	ENST00000636616	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		2.86	□□□□□ -1.95
EFHC1-223	ENST00000636616	IGKV2D-28	P01615	120 aa		2.86	□□□□□ -1.95
EFHC1-223	ENST00000636616	TRAC	P01848	142 aa		2.86	□□□□□ -1.95
EFHC1-223	ENST00000636616	BAALC-AS2	P0C853	105 aa		2.86	□□□□□ -1.95
EFHC1-223	ENST00000636616	C7orf65	Q6ZTY9	151 aa		2.86	□□□□□ -1.95
EFHC1-223	ENST00000636616	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		2.86	□□□□□ -1.95
EFHC1-223	ENST00000636616	APLN	Q9ULZ1	77 aa		2.86	□□□□□ -1.95
EFHC1-223	ENST00000636616	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		2.85	□□□□□ -1.95
EFHC1-223	ENST00000636616	TEX49	A0A1B0GTD5	131 aa		2.85	□□□□□ -1.95
EFHC1-223	ENST00000636616	ENHO	Q6UWT2	76 aa		2.85	□□□□□ -1.95
EFHC1-223	ENST00000636616	SMIM11B	Q8TCY0	68 aa		2.85	□□□□□ -1.95
EFHC1-223	ENST00000636616	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		2.84	□□□□□ -1.95
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM236A	A0A1B0GUQ0	79 aa		2.84	□□□□□ -1.95
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM236B	A0A1B0GV22	79 aa		2.84	□□□□□ -1.95
EFHC1-223	ENST00000636616	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	2.84	□□□□□ -1.95
EFHC1-223	ENST00000636616	SPAG11B	Q08648	103 aa		2.84	□□□□□ -1.95
EFHC1-223	ENST00000636616	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		2.84	□□□□□ -1.95
EFHC1-223	ENST00000636616	DIRC1	Q969H9	104 aa		2.84	□□□□□ -1.95
EFHC1-223	ENST00000636616	DNAH2	Q9P225	4427 aa		2.83	□□□□□ -1.96
EFHC1-223	ENST00000636616	SNCG	O76070	127 aa		2.83	□□□□□ -1.96
EFHC1-223	ENST00000636616	DNAL4	O96015	105 aa		2.83	□□□□□ -1.96
EFHC1-223	ENST00000636616	ESRG	Q1W209	222 aa		2.83	□□□□□ -1.96
EFHC1-223	ENST00000636616	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	2.83	□□□□□ -1.96
EFHC1-223	ENST00000636616	RYR2	Q92736	4967 aa		2.83	□□□□□ -1.96
EFHC1-223	ENST00000636616	ACYP1	P07311	99 aa		2.82	□□□□□ -1.96
EFHC1-223	ENST00000636616		Q6ZQT0	140 aa		2.82	□□□□□ -1.96
EFHC1-223	ENST00000636616	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		2.82	□□□□□ -1.96
EFHC1-223	ENST00000636616	RYR3	Q15413	4870 aa		2.82	□□□□□ -1.96
EFHC1-223	ENST00000636616	ALMS1	Q8TCU4	4167 aa		2.82	□□□□□ -1.96
EFHC1-223	ENST00000636616	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	2.82	□□□□□ -1.96
EFHC1-223	ENST00000636616	MT-ATP8	P03928	68 aa		2.82	□□□□□ -1.96
EFHC1-223	ENST00000636616	MOBP	Q13875	183 aa		2.82	□□□□□ -1.96
EFHC1-223	ENST00000636616	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		2.82	□□□□□ -1.96
EFHC1-223	ENST00000636616	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		2.82	□□□□□ -1.96
EFHC1-223	ENST00000636616	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		2.82	□□□□□ -1.96
EFHC1-223	ENST00000636616		A8MU10	97 aa		2.81	□□□□□ -1.96
EFHC1-223	ENST00000636616	UQCRQ	O14949	82 aa		2.81	□□□□□ -1.96
EFHC1-223	ENST00000636616	HIGD2A	Q9BW72	106 aa		2.81	□□□□□ -1.96
EFHC1-223	ENST00000636616	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		2.81	□□□□□ -1.96
EFHC1-223	ENST00000636616	DNAH10	Q8IVF4	4471 aa		2.8	□□□□□ -1.96
EFHC1-223	ENST00000636616	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		2.8	□□□□□ -1.96
EFHC1-223	ENST00000636616	NCR3	O14931	201 aa		2.8	□□□□□ -1.96
EFHC1-223	ENST00000636616	HRES1	P13985	223 aa		2.8	□□□□□ -1.96
EFHC1-223	ENST00000636616	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		2.8	□□□□□ -1.96

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