RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597198.5

IRF3-217, Transcript of interferon regulatory factor 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene IRF3, Length 1,741 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF3-217ENST00000597198 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa9.59□□□□□ -0.87
IRF3-217ENST00000597198 LINC00575Q6W349 94 aa9.59□□□□□ -0.87
IRF3-217ENST00000597198 COX6CP09669 75 aa9.59□□□□□ -0.87
IRF3-217ENST00000597198 TEN1Q86WV5 123 aa9.59□□□□□ -0.87
IRF3-217ENST00000597198 TRIAP1O43715 76 aa9.58□□□□□ -0.88
IRF3-217ENST00000597198 CRYGAP11844 174 aa9.56□□□□□ -0.88
IRF3-217ENST00000597198 SPRR1BP22528 89 aa9.56□□□□□ -0.88
IRF3-217ENST00000597198 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
IRF3-217ENST00000597198 PPDPFLQ8WWR9 84 aa9.56□□□□□ -0.88
IRF3-217ENST00000597198 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa9.56□□□□□ -0.88
IRF3-217ENST00000597198 GAGE2AQ6NT46 116 aa9.56□□□□□ -0.88
IRF3-217ENST00000597198 FAM218AQ96MZ4 157 aa9.56□□□□□ -0.88
IRF3-217ENST00000597198 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa9.55□□□□□ -0.88
IRF3-217ENST00000597198 SLC25A20O43772 301 aa9.55□□□□□ -0.88
IRF3-217ENST00000597198 C9JAW5 83 aa9.54□□□□□ -0.88
IRF3-217ENST00000597198 hADV29S1A0JD25 119 aa9.53□□□□□ -0.88
IRF3-217ENST00000597198 H0YGX0 51 aa9.53□□□□□ -0.88
IRF3-217ENST00000597198 C3orf22Q8N5N4 141 aa9.53□□□□□ -0.88
IRF3-217ENST00000597198 ANKRD29Q8N6D5 301 aa9.52□□□□□ -0.89
IRF3-217ENST00000597198 SIGMAR1Q99720 223 aa9.51□□□□□ -0.89
IRF3-217ENST00000597198 LST1O00453 97 aa9.5□□□□□ -0.89
IRF3-217ENST00000597198 Q6ZQY7 126 aa9.5□□□□□ -0.89
IRF3-217ENST00000597198 SMIM29Q86T20 159 aa9.49□□□□□ -0.89
IRF3-217ENST00000597198 Q8N377 158 aa9.49□□□□□ -0.89
IRF3-217ENST00000597198 TYMSOSQ8TAI1 123 aa9.49□□□□□ -0.89
IRF3-217ENST00000597198 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa9.48□□□□□ -0.89
IRF3-217ENST00000597198 H3BT86 120 aa9.48□□□□□ -0.89
IRF3-217ENST00000597198 CLEC2BQ92478 149 aa9.48□□□□□ -0.89
IRF3-217ENST00000597198 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
IRF3-217ENST00000597198 A0A1B0GX51 115 aa9.47□□□□□ -0.89
IRF3-217ENST00000597198 DEFB105AQ8NG35 78 aa9.47□□□□□ -0.89
IRF3-217ENST00000597198 SCGB1A1P11684 91 aa9.46□□□□□ -0.89
IRF3-217ENST00000597198 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa9.44□□□□□ -0.9
IRF3-217ENST00000597198 MOBPQ13875 183 aa9.44□□□□□ -0.9
IRF3-217ENST00000597198 CDIP1Q9H305 208 aa9.44□□□□□ -0.9
IRF3-217ENST00000597198 UBR4Q5T4S7 5183 aa9.43□□□□□ -0.9
IRF3-217ENST00000597198 TRACP01848 142 aa9.42□□□□□ -0.9
IRF3-217ENST00000597198 Q8NBF4 154 aa9.41□□□□□ -0.9
IRF3-217ENST00000597198 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa9.41□□□□□ -0.9
IRF3-217ENST00000597198 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa9.4□□□□□ -0.9
IRF3-217ENST00000597198 LINC00304Q8N9R0 145 aa9.4□□□□□ -0.9
IRF3-217ENST00000597198 SNCGO76070 127 aa9.38□□□□□ -0.91
IRF3-217ENST00000597198 C9orf153Q5TBE3 101 aa9.38□□□□□ -0.91
IRF3-217ENST00000597198 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa9.35□□□□□ -0.91
IRF3-217ENST00000597198 DNAL4O96015 105 aa9.34□□□□□ -0.92
IRF3-217ENST00000597198 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa9.33□□□□□ -0.92
IRF3-217ENST00000597198 BAALC-AS2P0C853 105 aa9.33□□□□□ -0.92
IRF3-217ENST00000597198 SPAG11AQ6PDA7 123 aa9.33□□□□□ -0.92
IRF3-217ENST00000597198 ORMDL1Q9P0S3 153 aa9.33□□□□□ -0.92
IRF3-217ENST00000597198 A0A0G2JQZ4 141 aa9.31□□□□□ -0.92
IRF3-217ENST00000597198 MT-ATP8P03928 68 aa9.31□□□□□ -0.92
IRF3-217ENST00000597198 SPINK1P00995 79 aa9.3□□□□□ -0.92
IRF3-217ENST00000597198 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
IRF3-217ENST00000597198 GHRHP01286 108 aa9.29□□□□□ -0.92
IRF3-217ENST00000597198 RPS29P62273 56 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
IRF3-217ENST00000597198 F8WEM9 126 aa9.28□□□□□ -0.92
IRF3-217ENST00000597198 ACYP1P07311 99 aa9.28□□□□□ -0.92
IRF3-217ENST00000597198 SVIPQ8NHG7 77 aa9.28□□□□□ -0.92
IRF3-217ENST00000597198 H3BQ85 93 aa9.28□□□□□ -0.92
IRF3-217ENST00000597198 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa9.28□□□□□ -0.92
IRF3-217ENST00000597198 IGFL1Q6UW32 110 aa9.28□□□□□ -0.92
IRF3-217ENST00000597198 CD164Q04900 197 aa9.27□□□□□ -0.93
IRF3-217ENST00000597198 C4orf48Q5BLP8 95 aa9.26□□□□□ -0.93
IRF3-217ENST00000597198 Q6JHZ5 121 aa9.26□□□□□ -0.93
IRF3-217ENST00000597198 LRP2P98164 4655 aa9.25□□□□□ -0.93
IRF3-217ENST00000597198 Q6Q795 121 aa9.22□□□□□ -0.93
IRF3-217ENST00000597198 HRCT1Q6UXD1 115 aa9.22□□□□□ -0.93
IRF3-217ENST00000597198 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa9.21□□□□□ -0.94
IRF3-217ENST00000597198 RETNLBQ9BQ08 111 aa9.21□□□□□ -0.94
IRF3-217ENST00000597198 A0A1B0GV72 72 aa9.2□□□□□ -0.94
IRF3-217ENST00000597198 Q5XG85 94 aa9.2□□□□□ -0.94
IRF3-217ENST00000597198 LPAP08519 4548 aa9.19□□□□□ -0.94
IRF3-217ENST00000597198 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa9.17□□□□□ -0.94
IRF3-217ENST00000597198 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa9.17□□□□□ -0.94
IRF3-217ENST00000597198 LIMD2Q9BT23 127 aa9.16□□□□□ -0.94
IRF3-217ENST00000597198 A0A1W2PNM2 257 aa9.15□□□□□ -0.94
IRF3-217ENST00000597198 LINC00643Q86TS7 51 aa9.14□□□□□ -0.95
IRF3-217ENST00000597198 IMUPQ9GZP8 106 aa9.14□□□□□ -0.95
IRF3-217ENST00000597198 PRR4Q16378 134 aa9.13□□□□□ -0.95
IRF3-217ENST00000597198 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa9.12□□□□□ -0.95
IRF3-217ENST00000597198 RBM3P98179 157 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
IRF3-217ENST00000597198 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
IRF3-217ENST00000597198 RNF213Q63HN8 5207 aa9.11□□□□□ -0.95
IRF3-217ENST00000597198 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa9.11□□□□□ -0.95
IRF3-217ENST00000597198 C14orf132Q9NPU4 83 aa9.1□□□□□ -0.95
IRF3-217ENST00000597198 ANAPC13Q9BS18 74 aa9.09□□□□□ -0.95
IRF3-217ENST00000597198 C1orf195Q5TG92 126 aa9.08□□□□□ -0.96
IRF3-217ENST00000597198 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa9.07□□□□□ -0.96
IRF3-217ENST00000597198 CCKP06307 115 aa9.07□□□□□ -0.96
IRF3-217ENST00000597198 DSCR8Q96T75 97 aa9.07□□□□□ -0.96
IRF3-217ENST00000597198 A0A087WSZ3 146 aa9.06□□□□□ -0.96
IRF3-217ENST00000597198 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa9.06□□□□□ -0.96
IRF3-217ENST00000597198 TPRXLQ17RH7 258 aa9.05□□□□□ -0.96
IRF3-217ENST00000597198 Q6ZQT0 140 aa9.05□□□□□ -0.96
IRF3-217ENST00000597198 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa9.02□□□□□ -0.96
IRF3-217ENST00000597198 Q96NJ1 140 aa9.02□□□□□ -0.96
IRF3-217ENST00000597198 LINC00846Q9NV44 126 aa9.02□□□□□ -0.97
IRF3-217ENST00000597198 SS18L2Q9UHA2 77 aa9.02□□□□□ -0.97
IRF3-217ENST00000597198 PDE6GP18545 87 aa9□□□□□ -0.97
IRF3-217ENST00000597198 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa8.95□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.7 ms