RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 Q8NBF4 154 aa5.87□□□□□ -1.47
EFTUD2-222ENST00000592408 LINC00474Q9P2X8 69 aa5.87□□□□□ -1.47
EFTUD2-222ENST00000592408 A0A096LNI7 61 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-222ENST00000592408 C3orf84H3BNL1 204 aa5.85□□□□□ -1.47
EFTUD2-222ENST00000592408 SCXQ7RTU7 201 aa5.85□□□□□ -1.47
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa5.85□□□□□ -1.47
EFTUD2-222ENST00000592408 FBN3Q75N90 2809 aa5.85□□□□□ -1.47
EFTUD2-222ENST00000592408 TENM3Q9P273 2699 aa5.85□□□□□ -1.47
EFTUD2-222ENST00000592408 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa5.84□□□□□ -1.47
EFTUD2-222ENST00000592408 NDUFC1O43677 76 aa5.84□□□□□ -1.47
EFTUD2-222ENST00000592408 ERC2-IT1O76042 136 aa5.84□□□□□ -1.47
EFTUD2-222ENST00000592408 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
EFTUD2-222ENST00000592408 C20orf197Q8N268 126 aa5.84□□□□□ -1.47
EFTUD2-222ENST00000592408 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa5.84□□□□□ -1.47
EFTUD2-222ENST00000592408 LINC00476Q8WZB0 136 aa5.84□□□□□ -1.47
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa5.84□□□□□ -1.47
EFTUD2-222ENST00000592408 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa5.83□□□□□ -1.48
EFTUD2-222ENST00000592408 H0Y9J4 135 aa5.83□□□□□ -1.48
EFTUD2-222ENST00000592408 IGKV4-1P06312 121 aa5.83□□□□□ -1.48
EFTUD2-222ENST00000592408 SPRR4Q96PI1 79 aa5.83□□□□□ -1.48
EFTUD2-222ENST00000592408 A0A1W2PNM2 257 aa5.82□□□□□ -1.48
EFTUD2-222ENST00000592408 KLKP1Q107X0 134 aa5.82□□□□□ -1.48
EFTUD2-222ENST00000592408 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa5.82□□□□□ -1.48
EFTUD2-222ENST00000592408 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa5.81□□□□□ -1.48
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM236CP0DP71 79 aa5.81□□□□□ -1.48
EFTUD2-222ENST00000592408 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
EFTUD2-222ENST00000592408 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
EFTUD2-222ENST00000592408 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa5.8□□□□□ -1.48
EFTUD2-222ENST00000592408 UBE2AP49459 152 aa5.8□□□□□ -1.48
EFTUD2-222ENST00000592408 C9orf163Q8N9P6 203 aa5.8□□□□□ -1.48
EFTUD2-222ENST00000592408 HIGD2AQ9BW72 106 aa5.8□□□□□ -1.48
EFTUD2-222ENST00000592408 DNAH1Q9P2D7 4330 aa5.79□□□□□ -1.48
EFTUD2-222ENST00000592408 A0A1W2PNN7 141 aa5.79□□□□□ -1.48
EFTUD2-222ENST00000592408 PRLHP81277 87 aa5.79□□□□□ -1.48
EFTUD2-222ENST00000592408 CYSTM1Q9H1C7 97 aa5.79□□□□□ -1.48
EFTUD2-222ENST00000592408 SMIM29Q86T20 159 aa5.78□□□□□ -1.48
EFTUD2-222ENST00000592408 NOTCH1P46531 2555 aa5.78□□□□□ -1.48
EFTUD2-222ENST00000592408 LRCOL1A6NCL2 159 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-222ENST00000592408 SPRR1BP22528 89 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-222ENST00000592408 DPH3Q96FX2 82 aa5.77□□□□□ -1.49
EFTUD2-222ENST00000592408 IGFL1Q6UW32 110 aa5.76□□□□□ -1.49
EFTUD2-222ENST00000592408 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
EFTUD2-222ENST00000592408 Q8N9L7 120 aa5.76□□□□□ -1.49
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM254Q8TBM7 123 aa5.76□□□□□ -1.49
EFTUD2-222ENST00000592408 EPM2AB3EWF7 344 aa5.75□□□□□ -1.49
EFTUD2-222ENST00000592408 H7BZZ5 65 aa5.75□□□□□ -1.49
EFTUD2-222ENST00000592408 CHTF8P0CG12 524 aa5.75□□□□□ -1.49
EFTUD2-222ENST00000592408 OCR1Q9BZK8 76 aa5.75□□□□□ -1.49
EFTUD2-222ENST00000592408 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
EFTUD2-222ENST00000592408 SERP1Q9Y6X1 66 aa5.74□□□□□ -1.49
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
EFTUD2-222ENST00000592408 SNURFQ9Y675 71 aa5.73□□□□□ -1.49
EFTUD2-222ENST00000592408 HCG22E2RYF7 251 aa5.72□□□□□ -1.49
EFTUD2-222ENST00000592408 SPACA4Q8TDM5 124 aa5.72□□□□□ -1.49
EFTUD2-222ENST00000592408 A0A087WSZ3 146 aa5.71□□□□□ -1.5
EFTUD2-222ENST00000592408 DSCR10P59022 87 aa5.71□□□□□ -1.5
EFTUD2-222ENST00000592408 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-222ENST00000592408 A0A087WTM6 91 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-222ENST00000592408 A0A0U1RQV1 116 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-222ENST00000592408 K7EQZ3 153 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-222ENST00000592408 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-222ENST00000592408 Q75L30 129 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-222ENST00000592408 LCE6AA0A183 80 aa5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-222ENST00000592408 C5orf47Q569G3 176 aa5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-222ENST00000592408 DNAH9Q9NYC9 4486 aa5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-222ENST00000592408 RTL8CO15255 209 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-222ENST00000592408 A8MWP4 228 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-222ENST00000592408 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-222ENST00000592408 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-222ENST00000592408 NDUFB1O75438 58 aa5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-222ENST00000592408 MP68P56378 58 aa5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-222ENST00000592408 LINC00483Q53H64 154 aa5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-222ENST00000592408 STAB2Q8WWQ8 2551 aa5.65□□□□□ -1.51
EFTUD2-222ENST00000592408 C1orf134Q5TEV5 83 aa5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-222ENST00000592408 Q6ZR54 194 aa5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-222ENST00000592408 TGP01266 2768 aa5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-222ENST00000592408 SMIM26A0A096LP01 95 aa5.63□□□□□ -1.51
EFTUD2-222ENST00000592408 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa5.63□□□□□ -1.51
EFTUD2-222ENST00000592408 H3BPC8 53 aa5.63□□□□□ -1.51
EFTUD2-222ENST00000592408 PANO1I0J062 215 aa5.63□□□□□ -1.51
EFTUD2-222ENST00000592408 OXTP01178 125 aa5.63□□□□□ -1.51
EFTUD2-222ENST00000592408 CASC2Q6XLA1 102 aa5.63□□□□□ -1.51
EFTUD2-222ENST00000592408 PRR15Q8IV56 129 aa5.63□□□□□ -1.51
EFTUD2-222ENST00000592408 PLAC8Q9NZF1 115 aa5.63□□□□□ -1.51
EFTUD2-222ENST00000592408 A0A0G2JQZ4 141 aa5.62□□□□□ -1.51
EFTUD2-222ENST00000592408 WFDC13Q8IUB5 93 aa5.62□□□□□ -1.51
EFTUD2-222ENST00000592408 LINC00472Q9H8W2 130 aa5.62□□□□□ -1.51
EFTUD2-222ENST00000592408 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
EFTUD2-222ENST00000592408 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa5.6□□□□□ -1.51
EFTUD2-222ENST00000592408 DEFB116Q30KQ4 102 aa5.6□□□□□ -1.51
EFTUD2-222ENST00000592408 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF861PO60384 105 aa5.59□□□□□ -1.51
EFTUD2-222ENST00000592408 CDK2AP2O75956 126 aa5.59□□□□□ -1.51
EFTUD2-222ENST00000592408 MOBPQ13875 183 aa5.59□□□□□ -1.51
EFTUD2-222ENST00000592408 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa5.59□□□□□ -1.51
EFTUD2-222ENST00000592408 hDV103S1A0JD37 113 aa5.57□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 105.8 ms