RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590422.1

CTIF-208, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-208ENST00000590422 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.76□□□□□ -1.33
CTIF-208ENST00000590422 TAX1BP3O14907 124 aa6.76□□□□□ -1.33
CTIF-208ENST00000590422 VAMP3Q15836 100 aa6.76□□□□□ -1.33
CTIF-208ENST00000590422 Q8N377 158 aa6.76□□□□□ -1.33
CTIF-208ENST00000590422 Q9BRP9 147 aa6.76□□□□□ -1.33
CTIF-208ENST00000590422 PSMB2P49721 201 aa6.75□□□□□ -1.33
CTIF-208ENST00000590422 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.75□□□□□ -1.33
CTIF-208ENST00000590422 H0YGX0 51 aa6.74□□□□□ -1.33
CTIF-208ENST00000590422 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
CTIF-208ENST00000590422 COX6CP09669 75 aa6.73□□□□□ -1.33
CTIF-208ENST00000590422 LINC00575Q6W349 94 aa6.73□□□□□ -1.33
CTIF-208ENST00000590422 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa6.73□□□□□ -1.33
CTIF-208ENST00000590422 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.72□□□□□ -1.33
CTIF-208ENST00000590422 C9orf118A6NHY6 69 aa6.72□□□□□ -1.33
CTIF-208ENST00000590422 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CTIF-208ENST00000590422 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
CTIF-208ENST00000590422 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
CTIF-208ENST00000590422 H3BUT2 72 aa6.71□□□□□ -1.34
CTIF-208ENST00000590422 SCGB1C2P0DMR2 95 aa6.71□□□□□ -1.34
CTIF-208ENST00000590422 FAM218AQ96MZ4 157 aa6.71□□□□□ -1.34
CTIF-208ENST00000590422 SLC25A20O43772 301 aa6.7□□□□□ -1.34
CTIF-208ENST00000590422 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa6.7□□□□□ -1.34
CTIF-208ENST00000590422 CLEC2BQ92478 149 aa6.7□□□□□ -1.34
CTIF-208ENST00000590422 hADV29S1A0JD25 119 aa6.69□□□□□ -1.34
CTIF-208ENST00000590422 XP32Q5T750 250 aa6.69□□□□□ -1.34
CTIF-208ENST00000590422 SVIPQ8NHG7 77 aa6.69□□□□□ -1.34
CTIF-208ENST00000590422 A0A1B0GX51 115 aa6.68□□□□□ -1.34
CTIF-208ENST00000590422 A0A1W2PPM0 123 aa6.68□□□□□ -1.34
CTIF-208ENST00000590422 LCE2CQ5TA81 110 aa6.68□□□□□ -1.34
CTIF-208ENST00000590422 C9orf153Q5TBE3 101 aa6.68□□□□□ -1.34
CTIF-208ENST00000590422 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.68□□□□□ -1.34
CTIF-208ENST00000590422 LST1O00453 97 aa6.67□□□□□ -1.34
CTIF-208ENST00000590422 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CTIF-208ENST00000590422 LYRM7Q5U5X0 104 aa6.67□□□□□ -1.34
CTIF-208ENST00000590422 SNCGO76070 127 aa6.66□□□□□ -1.34
CTIF-208ENST00000590422 TCL1BO95988 128 aa6.66□□□□□ -1.34
CTIF-208ENST00000590422 FABP2P12104 132 aa6.66□□□□□ -1.34
CTIF-208ENST00000590422 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa6.66□□□□□ -1.34
CTIF-208ENST00000590422 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CTIF-208ENST00000590422 TRACP01848 142 aa6.65□□□□□ -1.34
CTIF-208ENST00000590422 Q6ZQY7 126 aa6.65□□□□□ -1.34
CTIF-208ENST00000590422 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa6.64□□□□□ -1.35
CTIF-208ENST00000590422 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa6.64□□□□□ -1.35
CTIF-208ENST00000590422 SPRR1BP22528 89 aa6.64□□□□□ -1.35
CTIF-208ENST00000590422 ATXN8Q156A1 80 aa6.64□□□□□ -1.35
CTIF-208ENST00000590422 DNAL4O96015 105 aa6.62□□□□□ -1.35
CTIF-208ENST00000590422 DEFB105AQ8NG35 78 aa6.62□□□□□ -1.35
CTIF-208ENST00000590422 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa6.61□□□□□ -1.35
CTIF-208ENST00000590422 OCIAD2Q56VL3 154 aa6.61□□□□□ -1.35
CTIF-208ENST00000590422 SPCS1Q9Y6A9 102 aa6.61□□□□□ -1.35
CTIF-208ENST00000590422 HRCT1Q6UXD1 115 aa6.6□□□□□ -1.35
CTIF-208ENST00000590422 PPDPFLQ8WWR9 84 aa6.6□□□□□ -1.35
CTIF-208ENST00000590422 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.6□□□□□ -1.35
CTIF-208ENST00000590422 MT1HP80294 61 aa6.59□□□□□ -1.35
CTIF-208ENST00000590422 PCOTHQ58A44 107 aa6.59□□□□□ -1.35
CTIF-208ENST00000590422 SMIM29Q86T20 159 aa6.59□□□□□ -1.35
CTIF-208ENST00000590422 ORMDL1Q9P0S3 153 aa6.59□□□□□ -1.35
CTIF-208ENST00000590422 C9orf92A6NGG3 77 aa6.58□□□□□ -1.36
CTIF-208ENST00000590422 H3BMG7 143 aa6.58□□□□□ -1.36
CTIF-208ENST00000590422 K7EP34 96 aa6.58□□□□□ -1.36
CTIF-208ENST00000590422 GHRHP01286 108 aa6.58□□□□□ -1.36
CTIF-208ENST00000590422 H3BQ85 93 aa6.57□□□□□ -1.36
CTIF-208ENST00000590422 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa6.56□□□□□ -1.36
CTIF-208ENST00000590422 C9JAW5 83 aa6.56□□□□□ -1.36
CTIF-208ENST00000590422 BAALC-AS2P0C853 105 aa6.56□□□□□ -1.36
CTIF-208ENST00000590422 LIMD2Q9BT23 127 aa6.56□□□□□ -1.36
CTIF-208ENST00000590422 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa6.56□□□□□ -1.36
CTIF-208ENST00000590422 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa6.55□□□□□ -1.36
CTIF-208ENST00000590422 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CTIF-208ENST00000590422 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa6.54□□□□□ -1.36
CTIF-208ENST00000590422 UBE2V1Q13404 147 aa6.53□□□□□ -1.36
CTIF-208ENST00000590422 A0A1B0GV90 55 aa6.52□□□□□ -1.37
CTIF-208ENST00000590422 H3BT86 120 aa6.52□□□□□ -1.37
CTIF-208ENST00000590422 MTURNQ8N3F0 131 aa6.52□□□□□ -1.37
CTIF-208ENST00000590422 F8WEM9 126 aa6.51□□□□□ -1.37
CTIF-208ENST00000590422 PRO0461Q9UI25 63 aa6.51□□□□□ -1.37
CTIF-208ENST00000590422 A0A0G2JQZ4 141 aa6.5□□□□□ -1.37
CTIF-208ENST00000590422 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CTIF-208ENST00000590422 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CTIF-208ENST00000590422 CD164Q04900 197 aa6.5□□□□□ -1.37
CTIF-208ENST00000590422 ANKRD29Q8N6D5 301 aa6.5□□□□□ -1.37
CTIF-208ENST00000590422 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CTIF-208ENST00000590422 Q5XG85 94 aa6.49□□□□□ -1.37
CTIF-208ENST00000590422 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.47□□□□□ -1.37
CTIF-208ENST00000590422 C1orf195Q5TG92 126 aa6.47□□□□□ -1.37
CTIF-208ENST00000590422 Q6JHZ5 121 aa6.47□□□□□ -1.37
CTIF-208ENST00000590422 A0A1B0GV72 72 aa6.46□□□□□ -1.38
CTIF-208ENST00000590422 F8W1H4 67 aa6.46□□□□□ -1.38
CTIF-208ENST00000590422 IGFL1Q6UW32 110 aa6.46□□□□□ -1.38
CTIF-208ENST00000590422 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CTIF-208ENST00000590422 RBM3P98179 157 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CTIF-208ENST00000590422 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa6.45□□□□□ -1.38
CTIF-208ENST00000590422 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa6.44□□□□□ -1.38
CTIF-208ENST00000590422 RPL37P61927 97 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CTIF-208ENST00000590422 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.43□□□□□ -1.38
CTIF-208ENST00000590422 DSCR8Q96T75 97 aa6.42□□□□□ -1.38
CTIF-208ENST00000590422 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.4□□□□□ -1.38
CTIF-208ENST00000590422 A0A1W2PNM2 257 aa6.4□□□□□ -1.38
CTIF-208ENST00000590422 M0R2T5 61 aa6.4□□□□□ -1.38
CTIF-208ENST00000590422 TEN1Q86WV5 123 aa6.4□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 97 ms