RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582232.1

GGA3-211, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene GGA3, Length 598 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-211ENST00000582232 ANAPC11Q9NYG5 84 aa6.83□□□□□ -1.32
GGA3-211ENST00000582232 A0A087X002 238 aa6.82□□□□□ -1.32
GGA3-211ENST00000582232 CRYGAP11844 174 aa6.82□□□□□ -1.32
GGA3-211ENST00000582232 SMIM29Q86T20 159 aa6.82□□□□□ -1.32
GGA3-211ENST00000582232 DEFB105AQ8NG35 78 aa6.82□□□□□ -1.32
GGA3-211ENST00000582232 TNXBP22105 4242 aa6.81□□□□□ -1.32
GGA3-211ENST00000582232 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
GGA3-211ENST00000582232 ORMDL1Q9P0S3 153 aa6.81□□□□□ -1.32
GGA3-211ENST00000582232 KRTAP10-8P60410 259 aa6.8□□□□□ -1.32
GGA3-211ENST00000582232 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa6.8□□□□□ -1.32
GGA3-211ENST00000582232 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa6.8□□□□□ -1.32
GGA3-211ENST00000582232 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa6.79□□□□□ -1.32
GGA3-211ENST00000582232 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.79□□□□□ -1.32
GGA3-211ENST00000582232 SPCS1Q9Y6A9 102 aa6.79□□□□□ -1.32
GGA3-211ENST00000582232 H3BMG7 143 aa6.77□□□□□ -1.33
GGA3-211ENST00000582232 K7EP34 96 aa6.77□□□□□ -1.33
GGA3-211ENST00000582232 BAALC-AS2P0C853 105 aa6.77□□□□□ -1.33
GGA3-211ENST00000582232 MT1HL1P0DM35 61 aa6.77□□□□□ -1.33
GGA3-211ENST00000582232 UBE2V1Q13404 147 aa6.77□□□□□ -1.33
GGA3-211ENST00000582232 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa6.77□□□□□ -1.33
GGA3-211ENST00000582232 C3orf22Q8N5N4 141 aa6.77□□□□□ -1.33
GGA3-211ENST00000582232 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa6.76□□□□□ -1.33
GGA3-211ENST00000582232 TYMSOSQ8TAI1 123 aa6.76□□□□□ -1.33
GGA3-211ENST00000582232 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.75□□□□□ -1.33
GGA3-211ENST00000582232 C9JAW5 83 aa6.75□□□□□ -1.33
GGA3-211ENST00000582232 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
GGA3-211ENST00000582232 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa6.75□□□□□ -1.33
GGA3-211ENST00000582232 Q8NBF4 154 aa6.75□□□□□ -1.33
GGA3-211ENST00000582232 F8WEM9 126 aa6.74□□□□□ -1.33
GGA3-211ENST00000582232 MOBPQ13875 183 aa6.74□□□□□ -1.33
GGA3-211ENST00000582232 H3BT86 120 aa6.73□□□□□ -1.33
GGA3-211ENST00000582232 C9orf153Q5TBE3 101 aa6.73□□□□□ -1.33
GGA3-211ENST00000582232 Q6JHZ5 121 aa6.72□□□□□ -1.33
GGA3-211ENST00000582232 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.33
GGA3-211ENST00000582232 ANKRD29Q8N6D5 301 aa6.71□□□□□ -1.34
GGA3-211ENST00000582232 PRO0461Q9UI25 63 aa6.7□□□□□ -1.34
GGA3-211ENST00000582232 SPAG11AQ6PDA7 123 aa6.69□□□□□ -1.34
GGA3-211ENST00000582232 LINC00304Q8N9R0 145 aa6.69□□□□□ -1.34
GGA3-211ENST00000582232 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa6.68□□□□□ -1.34
GGA3-211ENST00000582232 J3QL48 77 aa6.68□□□□□ -1.34
GGA3-211ENST00000582232 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
GGA3-211ENST00000582232 CD164Q04900 197 aa6.68□□□□□ -1.34
GGA3-211ENST00000582232 MTURNQ8N3F0 131 aa6.68□□□□□ -1.34
GGA3-211ENST00000582232 A0A1B0GV90 55 aa6.67□□□□□ -1.34
GGA3-211ENST00000582232 F8W1H4 67 aa6.67□□□□□ -1.34
GGA3-211ENST00000582232 RBM3P98179 157 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
GGA3-211ENST00000582232 IGFL1Q6UW32 110 aa6.67□□□□□ -1.34
GGA3-211ENST00000582232 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa6.67□□□□□ -1.34
GGA3-211ENST00000582232 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.66□□□□□ -1.34
GGA3-211ENST00000582232 SPINK1P00995 79 aa6.66□□□□□ -1.34
GGA3-211ENST00000582232 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
GGA3-211ENST00000582232 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-211ENST00000582232 Q6Q795 121 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-211ENST00000582232 A0A0G2JQZ4 141 aa6.64□□□□□ -1.35
GGA3-211ENST00000582232 DSCR8Q96T75 97 aa6.64□□□□□ -1.35
GGA3-211ENST00000582232 TEN1Q86WV5 123 aa6.63□□□□□ -1.35
GGA3-211ENST00000582232 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.62□□□□□ -1.35
GGA3-211ENST00000582232 A0A1B0GV72 72 aa6.62□□□□□ -1.35
GGA3-211ENST00000582232 PDE6GP18545 87 aa6.62□□□□□ -1.35
GGA3-211ENST00000582232 A0A1W2PNM2 257 aa6.61□□□□□ -1.35
GGA3-211ENST00000582232 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.61□□□□□ -1.35
GGA3-211ENST00000582232 Q5XG85 94 aa6.61□□□□□ -1.35
GGA3-211ENST00000582232 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa6.6□□□□□ -1.35
GGA3-211ENST00000582232 Q6ZQT0 140 aa6.6□□□□□ -1.35
GGA3-211ENST00000582232 CCKP06307 115 aa6.59□□□□□ -1.35
GGA3-211ENST00000582232 HRCT1Q6UXD1 115 aa6.59□□□□□ -1.35
GGA3-211ENST00000582232 C14orf132Q9NPU4 83 aa6.59□□□□□ -1.35
GGA3-211ENST00000582232 A0A1B0GW54 56 aa6.58□□□□□ -1.36
GGA3-211ENST00000582232 LIMD2Q9BT23 127 aa6.58□□□□□ -1.36
GGA3-211ENST00000582232 HMCN2Q8NDA2 5059 aa6.57□□□□□ -1.36
GGA3-211ENST00000582232 ETDBQ3ZM63 59 aa6.57□□□□□ -1.36
GGA3-211ENST00000582232 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.56□□□□□ -1.36
GGA3-211ENST00000582232 A0A087WSZ3 146 aa6.54□□□□□ -1.36
GGA3-211ENST00000582232 SS18L2Q9UHA2 77 aa6.54□□□□□ -1.36
GGA3-211ENST00000582232 VPS25Q9BRG1 176 aa6.53□□□□□ -1.36
GGA3-211ENST00000582232 UBR4Q5T4S7 5183 aa6.5□□□□□ -1.37
GGA3-211ENST00000582232 C1orf195Q5TG92 126 aa6.5□□□□□ -1.37
GGA3-211ENST00000582232 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
GGA3-211ENST00000582232 RETNLBQ9BQ08 111 aa6.48□□□□□ -1.37
GGA3-211ENST00000582232 Q96NJ1 140 aa6.47□□□□□ -1.37
GGA3-211ENST00000582232 LINC00472Q9H8W2 130 aa6.47□□□□□ -1.37
GGA3-211ENST00000582232 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.43□□□□□ -1.38
GGA3-211ENST00000582232 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa6.43□□□□□ -1.38
GGA3-211ENST00000582232 ACYP1P07311 99 aa6.43□□□□□ -1.38
GGA3-211ENST00000582232 PRR4Q16378 134 aa6.43□□□□□ -1.38
GGA3-211ENST00000582232 NREPQ16612 68 aa6.43□□□□□ -1.38
GGA3-211ENST00000582232 LINC00846Q9NV44 126 aa6.42□□□□□ -1.38
GGA3-211ENST00000582232 J3KT08 172 aa6.41□□□□□ -1.38
GGA3-211ENST00000582232 Q6ZVQ6 151 aa6.4□□□□□ -1.38
GGA3-211ENST00000582232 IGKV4-1P06312 121 aa6.39□□□□□ -1.39
GGA3-211ENST00000582232 TPRXLQ17RH7 258 aa6.39□□□□□ -1.39
GGA3-211ENST00000582232 UBL5Q9BZL1 73 aa6.39□□□□□ -1.39
GGA3-211ENST00000582232 J3QR89 54 aa6.38□□□□□ -1.39
GGA3-211ENST00000582232 DEFB116Q30KQ4 102 aa6.38□□□□□ -1.39
GGA3-211ENST00000582232 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.38□□□□□ -1.39
GGA3-211ENST00000582232 SIGMAR1Q99720 223 aa6.36□□□□□ -1.39
GGA3-211ENST00000582232 LPAP08519 4548 aa6.35□□□□□ -1.39
GGA3-211ENST00000582232 A8MWP4 228 aa6.34□□□□□ -1.39
GGA3-211ENST00000582232 BPY2O14599 106 aa6.34□□□□□ -1.39
GGA3-211ENST00000582232 A0A1B0GVX0 72 aa6.33□□□□□ -1.4
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