RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567690.5

CCNDBP1-212, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 936 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-212ENST00000567690 PRLHP81277 87 aa4.24□□□□□ -1.73
CCNDBP1-212ENST00000567690 LINC00643Q86TS7 51 aa4.24□□□□□ -1.73
CCNDBP1-212ENST00000567690 TYMSOSQ8TAI1 123 aa4.24□□□□□ -1.73
CCNDBP1-212ENST00000567690 IMUPQ9GZP8 106 aa4.24□□□□□ -1.73
CCNDBP1-212ENST00000567690 CRYGAP11844 174 aa4.23□□□□□ -1.73
CCNDBP1-212ENST00000567690 OR13C6PQ8NH95 151 aa4.23□□□□□ -1.73
CCNDBP1-212ENST00000567690 RETNLBQ9BQ08 111 aa4.23□□□□□ -1.73
CCNDBP1-212ENST00000567690 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa4.22□□□□□ -1.73
CCNDBP1-212ENST00000567690 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa4.22□□□□□ -1.73
CCNDBP1-212ENST00000567690 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa4.22□□□□□ -1.73
CCNDBP1-212ENST00000567690 A0A1B0GX51 115 aa4.21□□□□□ -1.74
CCNDBP1-212ENST00000567690 NDUFC2O95298 119 aa4.21□□□□□ -1.74
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CCNDBP1-212ENST00000567690 COX17Q14061 63 aa4.21□□□□□ -1.74
CCNDBP1-212ENST00000567690 GAGE2AQ6NT46 116 aa4.21□□□□□ -1.74
CCNDBP1-212ENST00000567690 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa4.21□□□□□ -1.74
CCNDBP1-212ENST00000567690 Q8NDZ9 215 aa4.21□□□□□ -1.74
CCNDBP1-212ENST00000567690 SMCR5Q8TEV8 140 aa4.2□□□□□ -1.74
CCNDBP1-212ENST00000567690 TMEM126AQ9H061 195 aa4.2□□□□□ -1.74
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CCNDBP1-212ENST00000567690 B5MCH6 92 aa4.19□□□□□ -1.74
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CCNDBP1-212ENST00000567690 LINC00304Q8N9R0 145 aa4.19□□□□□ -1.74
CCNDBP1-212ENST00000567690 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa4.19□□□□□ -1.74
CCNDBP1-212ENST00000567690 HIGD2AQ9BW72 106 aa4.19□□□□□ -1.74
CCNDBP1-212ENST00000567690 LPAP08519 4548 aa4.19□□□□□ -1.74
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CCNDBP1-212ENST00000567690 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa4.18□□□□□ -1.74
CCNDBP1-212ENST00000567690 M0R378 163 aa4.18□□□□□ -1.74
CCNDBP1-212ENST00000567690 C3orf22Q8N5N4 141 aa4.18□□□□□ -1.74
CCNDBP1-212ENST00000567690 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa4.17□□□□□ -1.74
CCNDBP1-212ENST00000567690 NCR3O14931 201 aa4.17□□□□□ -1.74
CCNDBP1-212ENST00000567690 FAM229BQ4G0N7 80 aa4.17□□□□□ -1.74
CCNDBP1-212ENST00000567690 Q6JHZ5 121 aa4.17□□□□□ -1.74
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CCNDBP1-212ENST00000567690 SS18L2Q9UHA2 77 aa4.17□□□□□ -1.74
CCNDBP1-212ENST00000567690 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa4.16□□□□□ -1.74
CCNDBP1-212ENST00000567690 CCKP06307 115 aa4.16□□□□□ -1.74
CCNDBP1-212ENST00000567690 S100A7L2Q5SY68 101 aa4.16□□□□□ -1.74
CCNDBP1-212ENST00000567690 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa4.14□□□□□ -1.75
CCNDBP1-212ENST00000567690 ATOX1O00244 68 aa4.14□□□□□ -1.75
CCNDBP1-212ENST00000567690 UQCRQO14949 82 aa4.14□□□□□ -1.75
CCNDBP1-212ENST00000567690 C6orf99Q4VX62 202 aa4.14□□□□□ -1.75
CCNDBP1-212ENST00000567690 LINC00846Q9NV44 126 aa4.14□□□□□ -1.75
CCNDBP1-212ENST00000567690 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa4.13□□□□□ -1.75
CCNDBP1-212ENST00000567690 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa4.13□□□□□ -1.75
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CCNDBP1-212ENST00000567690 H3BQ85 93 aa4.13□□□□□ -1.75
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CCNDBP1-212ENST00000567690 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
CCNDBP1-212ENST00000567690 C9orf153Q5TBE3 101 aa4.13□□□□□ -1.75
CCNDBP1-212ENST00000567690 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa4.13□□□□□ -1.75
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CCNDBP1-212ENST00000567690 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa4.1□□□□□ -1.75
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CCNDBP1-212ENST00000567690 KCNQ1DNQ9H478 68 aa4.09□□□□□ -1.75
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CCNDBP1-212ENST00000567690 MOBPQ13875 183 aa4.08□□□□□ -1.76
CCNDBP1-212ENST00000567690 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
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CCNDBP1-212ENST00000567690 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
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CCNDBP1-212ENST00000567690 LINC00483Q53H64 154 aa4.05□□□□□ -1.76
CCNDBP1-212ENST00000567690 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
CCNDBP1-212ENST00000567690 Q6ZRX8 168 aa4.05□□□□□ -1.76
CCNDBP1-212ENST00000567690 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
CCNDBP1-212ENST00000567690 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa4.05□□□□□ -1.76
CCNDBP1-212ENST00000567690 Q6ZVQ6 151 aa4.04□□□□□ -1.76
CCNDBP1-212ENST00000567690 SVIPQ8NHG7 77 aa4.04□□□□□ -1.76
CCNDBP1-212ENST00000567690 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa4.03□□□□□ -1.76
CCNDBP1-212ENST00000567690 SPINK1P00995 79 aa4.03□□□□□ -1.76
CCNDBP1-212ENST00000567690 TMEM258P61165 79 aa4.03□□□□□ -1.76
CCNDBP1-212ENST00000567690 CXCL6P80162 114 aa4.03□□□□□ -1.76
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