RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560941.5

LINS1-211, Transcript of lines homolog 1, humanhuman

TSL 5

Gene LINS1, Length 588 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINS1-211ENST00000560941 HIST1H4GQ99525 98 aa4.7□□□□□ -1.66
LINS1-211ENST00000560941 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa4.7□□□□□ -1.66
LINS1-211ENST00000560941 TAL2Q16559 108 aa4.69□□□□□ -1.66
LINS1-211ENST00000560941 SPAG11AQ6PDA7 123 aa4.69□□□□□ -1.66
LINS1-211ENST00000560941 VAMP8Q9BV40 100 aa4.69□□□□□ -1.66
LINS1-211ENST00000560941 A0A1B0GWB2 263 aa4.68□□□□□ -1.66
LINS1-211ENST00000560941 Q1RN00 199 aa4.68□□□□□ -1.66
LINS1-211ENST00000560941 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa4.68□□□□□ -1.66
LINS1-211ENST00000560941 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa4.67□□□□□ -1.66
LINS1-211ENST00000560941 DLEU1O43261 78 aa4.67□□□□□ -1.66
LINS1-211ENST00000560941 PYY3Q5JQD4 70 aa4.67□□□□□ -1.66
LINS1-211ENST00000560941 HRCT1Q6UXD1 115 aa4.67□□□□□ -1.66
LINS1-211ENST00000560941 A0A0G2JQZ4 141 aa4.66□□□□□ -1.66
LINS1-211ENST00000560941 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa4.66□□□□□ -1.66
LINS1-211ENST00000560941 H7C2G1 150 aa4.66□□□□□ -1.66
LINS1-211ENST00000560941 SPRR1BP22528 89 aa4.66□□□□□ -1.66
LINS1-211ENST00000560941 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
LINS1-211ENST00000560941 SLC25A34Q6PIV7 304 aa4.66□□□□□ -1.66
LINS1-211ENST00000560941 C2orf91Q6ZV80 131 aa4.66□□□□□ -1.66
LINS1-211ENST00000560941 RNF213Q63HN8 5207 aa4.65□□□□□ -1.66
LINS1-211ENST00000560941 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa4.65□□□□□ -1.67
LINS1-211ENST00000560941 SPINK1P00995 79 aa4.65□□□□□ -1.67
LINS1-211ENST00000560941 CFC1BP0CG36 223 aa4.65□□□□□ -1.67
LINS1-211ENST00000560941 CFC1P0CG37 223 aa4.65□□□□□ -1.67
LINS1-211ENST00000560941 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa4.65□□□□□ -1.67
LINS1-211ENST00000560941 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa4.65□□□□□ -1.67
LINS1-211ENST00000560941 VAMP3Q15836 100 aa4.64□□□□□ -1.67
LINS1-211ENST00000560941 SMIM29Q86T20 159 aa4.64□□□□□ -1.67
LINS1-211ENST00000560941 Q8N377 158 aa4.64□□□□□ -1.67
LINS1-211ENST00000560941 HIGD1BQ9P298 99 aa4.64□□□□□ -1.67
LINS1-211ENST00000560941 CTAG1AP78358 180 aa4.63□□□□□ -1.67
LINS1-211ENST00000560941 LINC00575Q6W349 94 aa4.63□□□□□ -1.67
LINS1-211ENST00000560941 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa4.62□□□□□ -1.67
LINS1-211ENST00000560941 SLC25A20O43772 301 aa4.62□□□□□ -1.67
LINS1-211ENST00000560941 CEND1Q8N111 149 aa4.62□□□□□ -1.67
LINS1-211ENST00000560941 RAB37Q96AX2 223 aa4.62□□□□□ -1.67
LINS1-211ENST00000560941 hADV29S1A0JD25 119 aa4.61□□□□□ -1.67
LINS1-211ENST00000560941 FXYD2P54710 66 aa4.61□□□□□ -1.67
LINS1-211ENST00000560941 Q6ZQY7 126 aa4.61□□□□□ -1.67
LINS1-211ENST00000560941 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
LINS1-211ENST00000560941 TPRXLQ17RH7 258 aa4.6□□□□□ -1.67
LINS1-211ENST00000560941 PRO1933Q9H354 126 aa4.6□□□□□ -1.67
LINS1-211ENST00000560941 A0A0B4J2C4 111 aa4.59□□□□□ -1.67
LINS1-211ENST00000560941 RPS29P62273 56 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
LINS1-211ENST00000560941 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
LINS1-211ENST00000560941 MUC17Q685J3 4493 aa4.58□□□□□ -1.68
LINS1-211ENST00000560941 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa4.58□□□□□ -1.68
LINS1-211ENST00000560941 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa4.58□□□□□ -1.68
LINS1-211ENST00000560941 FAM218AQ96MZ4 157 aa4.58□□□□□ -1.68
LINS1-211ENST00000560941 K7ERJ3 54 aa4.57□□□□□ -1.68
LINS1-211ENST00000560941 PRO1854Q9UHT4 67 aa4.57□□□□□ -1.68
LINS1-211ENST00000560941 F8WEM9 126 aa4.56□□□□□ -1.68
LINS1-211ENST00000560941 HSD52Q0P140 79 aa4.56□□□□□ -1.68
LINS1-211ENST00000560941 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
LINS1-211ENST00000560941 LIMD2Q9BT23 127 aa4.56□□□□□ -1.68
LINS1-211ENST00000560941 CD164Q04900 197 aa4.55□□□□□ -1.68
LINS1-211ENST00000560941 SNHG12Q9BXW3 62 aa4.55□□□□□ -1.68
LINS1-211ENST00000560941 UQCR10Q9UDW1 63 aa4.55□□□□□ -1.68
LINS1-211ENST00000560941 C9orf92A6NGG3 77 aa4.54□□□□□ -1.68
LINS1-211ENST00000560941 H0YGX0 51 aa4.54□□□□□ -1.68
LINS1-211ENST00000560941 H3BUT2 72 aa4.54□□□□□ -1.68
LINS1-211ENST00000560941 TRIAP1O43715 76 aa4.54□□□□□ -1.68
LINS1-211ENST00000560941 OCIAD2Q56VL3 154 aa4.54□□□□□ -1.68
LINS1-211ENST00000560941 IGFL1Q6UW32 110 aa4.54□□□□□ -1.68
LINS1-211ENST00000560941 CLEC2BQ92478 149 aa4.54□□□□□ -1.68
LINS1-211ENST00000560941 MUC2Q02817 5179 aa4.53□□□□□ -1.68
LINS1-211ENST00000560941 LCE1EQ5T753 118 aa4.53□□□□□ -1.68
LINS1-211ENST00000560941 PSMB2P49721 201 aa4.52□□□□□ -1.69
LINS1-211ENST00000560941 C1orf195Q5TG92 126 aa4.52□□□□□ -1.69
LINS1-211ENST00000560941 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa4.51□□□□□ -1.69
LINS1-211ENST00000560941 SNCGO76070 127 aa4.51□□□□□ -1.69
LINS1-211ENST00000560941 FABP2P12104 132 aa4.51□□□□□ -1.69
LINS1-211ENST00000560941 Q6JHZ5 121 aa4.51□□□□□ -1.69
LINS1-211ENST00000560941 A0A1B0GV72 72 aa4.5□□□□□ -1.69
LINS1-211ENST00000560941 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
LINS1-211ENST00000560941 Q5XG85 94 aa4.5□□□□□ -1.69
LINS1-211ENST00000560941 PPDPFLQ8WWR9 84 aa4.5□□□□□ -1.69
LINS1-211ENST00000560941 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa4.5□□□□□ -1.69
LINS1-211ENST00000560941 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa4.49□□□□□ -1.69
LINS1-211ENST00000560941 IGKV2-30P06310 120 aa4.49□□□□□ -1.69
LINS1-211ENST00000560941 A0A1B0GX51 115 aa4.48□□□□□ -1.69
LINS1-211ENST00000560941 H3BMG7 143 aa4.48□□□□□ -1.69
LINS1-211ENST00000560941 TCL1BO95988 128 aa4.48□□□□□ -1.69
LINS1-211ENST00000560941 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa4.48□□□□□ -1.69
LINS1-211ENST00000560941 COX6CP09669 75 aa4.47□□□□□ -1.69
LINS1-211ENST00000560941 SCGB1C2P0DMR2 95 aa4.47□□□□□ -1.69
LINS1-211ENST00000560941 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
LINS1-211ENST00000560941 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa4.46□□□□□ -1.7
LINS1-211ENST00000560941 DNAL4O96015 105 aa4.46□□□□□ -1.7
LINS1-211ENST00000560941 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
LINS1-211ENST00000560941 ORMDL1Q9P0S3 153 aa4.46□□□□□ -1.7
LINS1-211ENST00000560941 FAT4Q6V0I7 4981 aa4.45□□□□□ -1.7
LINS1-211ENST00000560941 SMIM6P0DI80 62 aa4.45□□□□□ -1.7
LINS1-211ENST00000560941 PCOTHQ58A44 107 aa4.45□□□□□ -1.7
LINS1-211ENST00000560941 A0A087WSZ3 146 aa4.44□□□□□ -1.7
LINS1-211ENST00000560941 A0A1W2PNM2 257 aa4.44□□□□□ -1.7
LINS1-211ENST00000560941 A0A0U1RQV1 116 aa4.43□□□□□ -1.7
LINS1-211ENST00000560941 LST1O00453 97 aa4.43□□□□□ -1.7
LINS1-211ENST00000560941 TEN1Q86WV5 123 aa4.43□□□□□ -1.7
LINS1-211ENST00000560941 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa4.42□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms