RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555350.1

LINC00645-201, long intergenic non-protein coding RNA 645, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LINC00645, Length 470 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00645-201ENST00000555350 PDZD2O15018 2839 aa-0.03□□□□□ -2.41
LINC00645-201ENST00000555350 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
LINC00645-201ENST00000555350 ZZEF1O43149 2961 aa-0.03□□□□□ -2.41
LINC00645-201ENST00000555350 ENHOQ6UWT2 76 aa-0.03□□□□□ -2.41
LINC00645-201ENST00000555350 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
LINC00645-201ENST00000555350 DMXL1Q9Y485 3027 aa-0.03□□□□□ -2.41
LINC00645-201ENST00000555350 UGGT2Q9NYU1 1516 aa-0.04□□□□□ -2.42
LINC00645-201ENST00000555350 SPTBN4Q9H254 2564 aa-0.04□□□□□ -2.42
LINC00645-201ENST00000555350 ANKARQ7Z5J8 1434 aa-0.04□□□□□ -2.42
LINC00645-201ENST00000555350 WIZO95785 1651 aa-0.05□□□□□ -2.42
LINC00645-201ENST00000555350 KALRNO60229 2985 aa-0.05□□□□□ -2.42
LINC00645-201ENST00000555350 DIP2AQ14689 1571 aa-0.05□□□□□ -2.42
LINC00645-201ENST00000555350 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
LINC00645-201ENST00000555350 LCE6AA0A183 80 aa-0.05□□□□□ -2.42
LINC00645-201ENST00000555350 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa-0.05□□□□□ -2.42
LINC00645-201ENST00000555350 LMTK2Q8IWU2 1503 aa-0.05□□□□□ -2.42
LINC00645-201ENST00000555350 CREBBPQ92793 2442 aa-0.05□□□□□ -2.42
LINC00645-201ENST00000555350 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa-0.06□□□□□ -2.42
LINC00645-201ENST00000555350 ITSN1Q15811 1721 aa-0.06□□□□□ -2.42
LINC00645-201ENST00000555350 CUBNO60494 3623 aa-0.06□□□□□ -2.42
LINC00645-201ENST00000555350 CD163L1Q9NR16 1453 aa-0.06□□□□□ -2.42
LINC00645-201ENST00000555350 SCRIBQ14160 1630 aa-0.06□□□□□ -2.42
LINC00645-201ENST00000555350 LRP1BQ9NZR2 4599 aa-0.07□□□□□ -2.42
LINC00645-201ENST00000555350 CRIP1P50238 77 aa-0.07□□□□□ -2.42
LINC00645-201ENST00000555350 COX6B2Q6YFQ2 88 aa-0.07□□□□□ -2.42
LINC00645-201ENST00000555350 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
LINC00645-201ENST00000555350 H0YGG7 62 aa-0.08□□□□□ -2.42
LINC00645-201ENST00000555350 DEFB130BP0DP73 79 aa-0.08□□□□□ -2.42
LINC00645-201ENST00000555350 DEFB130AP0DP74 79 aa-0.08□□□□□ -2.42
LINC00645-201ENST00000555350 SMCO4Q9NRQ5 59 aa-0.08□□□□□ -2.42
LINC00645-201ENST00000555350 GNG13Q9P2W3 67 aa-0.08□□□□□ -2.42
LINC00645-201ENST00000555350 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa-0.08□□□□□ -2.42
LINC00645-201ENST00000555350 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
LINC00645-201ENST00000555350 PTPN23Q9H3S7 1636 aa-0.09□□□□□ -2.42
LINC00645-201ENST00000555350 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
LINC00645-201ENST00000555350 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
LINC00645-201ENST00000555350 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa-0.09□□□□□ -2.42
LINC00645-201ENST00000555350 C3orf79P0CE67 100 aa-0.09□□□□□ -2.42
LINC00645-201ENST00000555350 IAPPP10997 89 aa-0.09□□□□□ -2.42
LINC00645-201ENST00000555350 SPRR2BP35325 72 aa-0.09□□□□□ -2.42
LINC00645-201ENST00000555350 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa-0.09□□□□□ -2.42
LINC00645-201ENST00000555350 ABCA9Q8IUA7 1624 aa-0.09□□□□□ -2.42
LINC00645-201ENST00000555350 MADDQ8WXG6 1647 aa-0.09□□□□□ -2.42
LINC00645-201ENST00000555350 AKAP9Q99996 3911 aa-0.09□□□□□ -2.42
LINC00645-201ENST00000555350 PLXNC1O60486 1568 aa-0.1□□□□□ -2.42
LINC00645-201ENST00000555350 MUC2Q02817 5179 aa-0.1□□□□□ -2.43
LINC00645-201ENST00000555350 PKHD1P08F94 4074 aa-0.1□□□□□ -2.43
LINC00645-201ENST00000555350 HTTP42858 3142 aa-0.11□□□□□ -2.43
LINC00645-201ENST00000555350 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa-0.11□□□□□ -2.43
LINC00645-201ENST00000555350 STAB2Q8WWQ8 2551 aa-0.11□□□□□ -2.43
LINC00645-201ENST00000555350 PDCD5O14737 125 aa-0.11□□□□□ -2.43
LINC00645-201ENST00000555350 BPTFQ12830 3046 aa-0.12□□□□□ -2.43
LINC00645-201ENST00000555350 CEP290O15078 2479 aa-0.12□□□□□ -2.43
LINC00645-201ENST00000555350 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa-0.13□□□□□ -2.43
LINC00645-201ENST00000555350 HIVEP1P15822 2718 aa-0.13□□□□□ -2.43
LINC00645-201ENST00000555350 MUC12Q9UKN1 5478 aa-0.13□□□□□ -2.43
LINC00645-201ENST00000555350 CCDC88BA6NC98 1476 aa-0.13□□□□□ -2.43
LINC00645-201ENST00000555350 ATXN8Q156A1 80 aa-0.13□□□□□ -2.43
LINC00645-201ENST00000555350 UBL5Q9BZL1 73 aa-0.13□□□□□ -2.43
LINC00645-201ENST00000555350 FASNP49327 2511 aaKnown RBP-0.13□□□□□ -2.43
LINC00645-201ENST00000555350 DUOX2Q9NRD8 1548 aa-0.13□□□□□ -2.43
LINC00645-201ENST00000555350 SPG11Q96JI7 2443 aa-0.14□□□□□ -2.43
LINC00645-201ENST00000555350 RALGAPBQ86X10 1494 aa-0.14□□□□□ -2.43
LINC00645-201ENST00000555350 H3BNG1 76 aa-0.14□□□□□ -2.43
LINC00645-201ENST00000555350 PKD1P98161 4303 aa-0.14□□□□□ -2.43
LINC00645-201ENST00000555350 HFM1A2PYH4 1435 aa-0.14□□□□□ -2.43
LINC00645-201ENST00000555350 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa-0.14□□□□□ -2.43
LINC00645-201ENST00000555350 DNMBPQ6XZF7 1577 aa-0.15□□□□□ -2.43
LINC00645-201ENST00000555350 TACC2O95359 2948 aa-0.15□□□□□ -2.43
LINC00645-201ENST00000555350 MXRA5Q9NR99 2828 aa-0.15□□□□□ -2.43
LINC00645-201ENST00000555350 DEPDC5O75140 1603 aa-0.15□□□□□ -2.43
LINC00645-201ENST00000555350 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP-0.15□□□□□ -2.43
LINC00645-201ENST00000555350 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa-0.15□□□□□ -2.43
LINC00645-201ENST00000555350 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa-0.15□□□□□ -2.43
LINC00645-201ENST00000555350 DEFB106AQ8N104 65 aa-0.15□□□□□ -2.43
LINC00645-201ENST00000555350 KCNQ1DNQ9H478 68 aa-0.15□□□□□ -2.43
LINC00645-201ENST00000555350 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP-0.15□□□□□ -2.43
LINC00645-201ENST00000555350 SONP18583 2426 aaKnown RBP-0.15□□□□□ -2.43
LINC00645-201ENST00000555350 LAMA5O15230 3695 aa-0.15□□□□□ -2.43
LINC00645-201ENST00000555350 LRRK2Q5S007 2527 aa-0.17□□□□□ -2.44
LINC00645-201ENST00000555350 EPG5Q9HCE0 2579 aa-0.17□□□□□ -2.44
LINC00645-201ENST00000555350 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa-0.17□□□□□ -2.44
LINC00645-201ENST00000555350 LYNX1G3V0Z9 82 aa-0.17□□□□□ -2.44
LINC00645-201ENST00000555350 SFTA3P0C7M3 94 aa-0.17□□□□□ -2.44
LINC00645-201ENST00000555350 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa-0.17□□□□□ -2.44
LINC00645-201ENST00000555350 PKD1L2Q7Z442 2459 aa-0.17□□□□□ -2.44
LINC00645-201ENST00000555350 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP-0.17□□□□□ -2.44
LINC00645-201ENST00000555350 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP-0.18□□□□□ -2.44
LINC00645-201ENST00000555350 DNAH9Q9NYC9 4486 aa-0.19□□□□□ -2.44
LINC00645-201ENST00000555350 MROH1Q8NDA8 1641 aa-0.19□□□□□ -2.44
LINC00645-201ENST00000555350 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa-0.19□□□□□ -2.44
LINC00645-201ENST00000555350 LINC01549A6NIU2 74 aa-0.19□□□□□ -2.44
LINC00645-201ENST00000555350 K7EMI3 77 aa-0.19□□□□□ -2.44
LINC00645-201ENST00000555350 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa-0.19□□□□□ -2.44
LINC00645-201ENST00000555350 NHSQ6T4R5 1651 aa-0.19□□□□□ -2.44
LINC00645-201ENST00000555350 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa-0.2□□□□□ -2.44
LINC00645-201ENST00000555350 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP-0.2□□□□□ -2.44
LINC00645-201ENST00000555350 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP-0.2□□□□□ -2.44
LINC00645-201ENST00000555350 MINOS1Q5TGZ0 78 aa-0.2□□□□□ -2.44
LINC00645-201ENST00000555350 S4R3F8 94 aa-0.2□□□□□ -2.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.2 ms