RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552294.1

CTDSP2-208, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP2, Length 436 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-208ENST00000552294 C9orf118A6NHY6 69 aa3.26□□□□□ -1.89
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CTDSP2-208ENST00000552294 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa3.26□□□□□ -1.89
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CTDSP2-208ENST00000552294 SPANXCQ9NY87 97 aa3.26□□□□□ -1.89
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CTDSP2-208ENST00000552294 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
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CTDSP2-208ENST00000552294 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa3.12□□□□□ -1.91
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CTDSP2-208ENST00000552294 LINC00313P59037 77 aa3.1□□□□□ -1.91
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CTDSP2-208ENST00000552294 SIGMAR1Q99720 223 aa3.1□□□□□ -1.91
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CTDSP2-208ENST00000552294 C12orf57Q99622 126 aa3.09□□□□□ -1.91
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CTDSP2-208ENST00000552294 HIST2H2BEQ16778 126 aa3.06□□□□□ -1.92
CTDSP2-208ENST00000552294 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
CTDSP2-208ENST00000552294 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
CTDSP2-208ENST00000552294 PET117Q6UWS5 81 aa3.06□□□□□ -1.92
CTDSP2-208ENST00000552294 WFDC13Q8IUB5 93 aa3.06□□□□□ -1.92
CTDSP2-208ENST00000552294 HIST1H2BHQ93079 126 aa3.06□□□□□ -1.92
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