RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530565.5

CTSF-208, Transcript of cathepsin F, humanhuman

TSL 5

Gene CTSF, Length 555 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSF-208ENST00000530565 PRO0461Q9UI25 63 aa5.17□□□□□ -1.58
CTSF-208ENST00000530565 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
CTSF-208ENST00000530565 ANKRD29Q8N6D5 301 aa5.16□□□□□ -1.58
CTSF-208ENST00000530565 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa5.15□□□□□ -1.59
CTSF-208ENST00000530565 BAALC-AS2P0C853 105 aa5.15□□□□□ -1.59
CTSF-208ENST00000530565 HIGD2AQ9BW72 106 aa5.15□□□□□ -1.59
CTSF-208ENST00000530565 ORMDL1Q9P0S3 153 aa5.15□□□□□ -1.59
CTSF-208ENST00000530565 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa5.14□□□□□ -1.59
CTSF-208ENST00000530565 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
CTSF-208ENST00000530565 PPDPFLQ8WWR9 84 aa5.14□□□□□ -1.59
CTSF-208ENST00000530565 SMCR5Q8TEV8 140 aa5.13□□□□□ -1.59
CTSF-208ENST00000530565 Q9BRP9 147 aa5.13□□□□□ -1.59
CTSF-208ENST00000530565 Q6ZQY7 126 aa5.11□□□□□ -1.59
CTSF-208ENST00000530565 TEN1Q86WV5 123 aa5.11□□□□□ -1.59
CTSF-208ENST00000530565 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa5.1□□□□□ -1.59
CTSF-208ENST00000530565 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa5.1□□□□□ -1.59
CTSF-208ENST00000530565 ERC2-IT1O76042 136 aa5.1□□□□□ -1.59
CTSF-208ENST00000530565 KRTAP10-8P60410 259 aa5.1□□□□□ -1.59
CTSF-208ENST00000530565 ETDBQ3ZM63 59 aa5.1□□□□□ -1.59
CTSF-208ENST00000530565 PRR26Q8N8Z3 221 aa5.1□□□□□ -1.59
CTSF-208ENST00000530565 SPRR4Q96PI1 79 aa5.1□□□□□ -1.59
CTSF-208ENST00000530565 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
CTSF-208ENST00000530565 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa5.09□□□□□ -1.59
CTSF-208ENST00000530565 FAM229BQ4G0N7 80 aa5.09□□□□□ -1.59
CTSF-208ENST00000530565 MTURNQ8N3F0 131 aa5.09□□□□□ -1.59
CTSF-208ENST00000530565 ANAPC11Q9NYG5 84 aa5.09□□□□□ -1.59
CTSF-208ENST00000530565 A0A087X002 238 aa5.08□□□□□ -1.6
CTSF-208ENST00000530565 CRYGAP11844 174 aa5.08□□□□□ -1.6
CTSF-208ENST00000530565 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa5.08□□□□□ -1.6
CTSF-208ENST00000530565 J3QR89 54 aa5.07□□□□□ -1.6
CTSF-208ENST00000530565 SPRR1BP22528 89 aa5.07□□□□□ -1.6
CTSF-208ENST00000530565 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
CTSF-208ENST00000530565 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa5.07□□□□□ -1.6
CTSF-208ENST00000530565 Q8N377 158 aa5.07□□□□□ -1.6
CTSF-208ENST00000530565 MUC2Q02817 5179 aa5.07□□□□□ -1.6
CTSF-208ENST00000530565 PDE6GP18545 87 aa5.06□□□□□ -1.6
CTSF-208ENST00000530565 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CTSF-208ENST00000530565 LINC00483Q53H64 154 aa5.06□□□□□ -1.6
CTSF-208ENST00000530565 GAGE2AQ6NT46 116 aa5.06□□□□□ -1.6
CTSF-208ENST00000530565 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa5.06□□□□□ -1.6
CTSF-208ENST00000530565 K7ERU9 68 aa5.05□□□□□ -1.6
CTSF-208ENST00000530565 RBM3P98179 157 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CTSF-208ENST00000530565 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa5.05□□□□□ -1.6
CTSF-208ENST00000530565 DEFB105AQ8NG35 78 aa5.05□□□□□ -1.6
CTSF-208ENST00000530565 TYMSOSQ8TAI1 123 aa5.05□□□□□ -1.6
CTSF-208ENST00000530565 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa5.05□□□□□ -1.6
CTSF-208ENST00000530565 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa5.04□□□□□ -1.6
CTSF-208ENST00000530565 C3orf22Q8N5N4 141 aa5.03□□□□□ -1.6
CTSF-208ENST00000530565 DSCR8Q96T75 97 aa5.03□□□□□ -1.6
CTSF-208ENST00000530565 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa5.02□□□□□ -1.61
CTSF-208ENST00000530565 ACYP1P07311 99 aa5.02□□□□□ -1.61
CTSF-208ENST00000530565 SMIM29Q86T20 159 aa5.02□□□□□ -1.61
CTSF-208ENST00000530565 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa5.01□□□□□ -1.61
CTSF-208ENST00000530565 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa5.01□□□□□ -1.61
CTSF-208ENST00000530565 A0A1B0GW54 56 aa5.01□□□□□ -1.61
CTSF-208ENST00000530565 FAT4Q6V0I7 4981 aa5.01□□□□□ -1.61
CTSF-208ENST00000530565 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa5□□□□□ -1.61
CTSF-208ENST00000530565 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa5□□□□□ -1.61
CTSF-208ENST00000530565 F8WEM9 126 aa5□□□□□ -1.61
CTSF-208ENST00000530565 CCKP06307 115 aa5□□□□□ -1.61
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CTSF-208ENST00000530565 Q6JHZ5 121 aa4.99□□□□□ -1.61
CTSF-208ENST00000530565 LINC00304Q8N9R0 145 aa4.99□□□□□ -1.61
CTSF-208ENST00000530565 C14orf132Q9NPU4 83 aa4.99□□□□□ -1.61
CTSF-208ENST00000530565 C9orf153Q5TBE3 101 aa4.98□□□□□ -1.61
CTSF-208ENST00000530565 Q6ZQT0 140 aa4.98□□□□□ -1.61
CTSF-208ENST00000530565 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa4.98□□□□□ -1.61
CTSF-208ENST00000530565 Q8NBF4 154 aa4.98□□□□□ -1.61
CTSF-208ENST00000530565 SPAG11AQ6PDA7 123 aa4.96□□□□□ -1.62
CTSF-208ENST00000530565 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa4.95□□□□□ -1.62
CTSF-208ENST00000530565 C4orf48Q5BLP8 95 aa4.95□□□□□ -1.62
CTSF-208ENST00000530565 Q6Q795 121 aa4.94□□□□□ -1.62
CTSF-208ENST00000530565 A0A1B0GV72 72 aa4.93□□□□□ -1.62
CTSF-208ENST00000530565 SPINK1P00995 79 aa4.93□□□□□ -1.62
CTSF-208ENST00000530565 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
CTSF-208ENST00000530565 IGFL1Q6UW32 110 aa4.93□□□□□ -1.62
CTSF-208ENST00000530565 VPS25Q9BRG1 176 aa4.93□□□□□ -1.62
CTSF-208ENST00000530565 MUC17Q685J3 4493 aa4.93□□□□□ -1.62
CTSF-208ENST00000530565 A0A1W2PNM2 257 aa4.92□□□□□ -1.62
CTSF-208ENST00000530565 RPS29P62273 56 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
CTSF-208ENST00000530565 CD164Q04900 197 aa4.91□□□□□ -1.62
CTSF-208ENST00000530565 A0A0G2JQZ4 141 aa4.9□□□□□ -1.63
CTSF-208ENST00000530565 HRCT1Q6UXD1 115 aa4.9□□□□□ -1.63
CTSF-208ENST00000530565 LINC00643Q86TS7 51 aa4.9□□□□□ -1.63
CTSF-208ENST00000530565 UBL5Q9BZL1 73 aa4.9□□□□□ -1.63
CTSF-208ENST00000530565 LINC00846Q9NV44 126 aa4.9□□□□□ -1.63
CTSF-208ENST00000530565 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa4.89□□□□□ -1.63
CTSF-208ENST00000530565 CDIP1Q9H305 208 aa4.89□□□□□ -1.63
CTSF-208ENST00000530565 PRR4Q16378 134 aa4.88□□□□□ -1.63
CTSF-208ENST00000530565 SIGMAR1Q99720 223 aa4.88□□□□□ -1.63
CTSF-208ENST00000530565 RETNLBQ9BQ08 111 aa4.88□□□□□ -1.63
CTSF-208ENST00000530565 NREPQ16612 68 aa4.87□□□□□ -1.63
CTSF-208ENST00000530565 LIMD2Q9BT23 127 aa4.86□□□□□ -1.63
CTSF-208ENST00000530565 SS18L2Q9UHA2 77 aa4.86□□□□□ -1.63
CTSF-208ENST00000530565 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa4.85□□□□□ -1.63
CTSF-208ENST00000530565 Q5XG85 94 aa4.85□□□□□ -1.63
CTSF-208ENST00000530565 Q6ZVQ6 151 aa4.85□□□□□ -1.63
CTSF-208ENST00000530565 A0A087WSZ3 146 aa4.84□□□□□ -1.63
CTSF-208ENST00000530565 A0A0U1RQV1 116 aa4.84□□□□□ -1.63
CTSF-208ENST00000530565 CXCL6P80162 114 aa4.84□□□□□ -1.63
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