RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525711.1

UBASH3B-202, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 4

Gene UBASH3B, Length 572 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-202ENST00000525711 K7ERJ3 54 aa8.06□□□□□ -1.12
UBASH3B-202ENST00000525711 SPRR1BP22528 89 aa8.06□□□□□ -1.12
UBASH3B-202ENST00000525711 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa8.06□□□□□ -1.12
UBASH3B-202ENST00000525711 GAGE2AQ6NT46 116 aa8.06□□□□□ -1.12
UBASH3B-202ENST00000525711 hADV29S1A0JD25 119 aa8.05□□□□□ -1.12
UBASH3B-202ENST00000525711 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa8.05□□□□□ -1.12
UBASH3B-202ENST00000525711 SNCGO76070 127 aa8.03□□□□□ -1.12
UBASH3B-202ENST00000525711 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa8.02□□□□□ -1.13
UBASH3B-202ENST00000525711 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa8.02□□□□□ -1.13
UBASH3B-202ENST00000525711 TRIAP1O43715 76 aa8.02□□□□□ -1.13
UBASH3B-202ENST00000525711 COX6CP09669 75 aa8.02□□□□□ -1.13
UBASH3B-202ENST00000525711 A0A1B0GX51 115 aa8.01□□□□□ -1.13
UBASH3B-202ENST00000525711 PSMB2P49721 201 aa8.01□□□□□ -1.13
UBASH3B-202ENST00000525711 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
UBASH3B-202ENST00000525711 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa8.01□□□□□ -1.13
UBASH3B-202ENST00000525711 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa7.99□□□□□ -1.13
UBASH3B-202ENST00000525711 DEFB105AQ8NG35 78 aa7.99□□□□□ -1.13
UBASH3B-202ENST00000525711 FAM218AQ96MZ4 157 aa7.99□□□□□ -1.13
UBASH3B-202ENST00000525711 Q6ZQY7 126 aa7.98□□□□□ -1.13
UBASH3B-202ENST00000525711 Q8N377 158 aa7.98□□□□□ -1.13
UBASH3B-202ENST00000525711 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa7.98□□□□□ -1.13
UBASH3B-202ENST00000525711 SPINK1P00995 79 aa7.97□□□□□ -1.13
UBASH3B-202ENST00000525711 OCIAD2Q56VL3 154 aa7.97□□□□□ -1.13
UBASH3B-202ENST00000525711 SMIM29Q86T20 159 aa7.97□□□□□ -1.13
UBASH3B-202ENST00000525711 Q8NBF4 154 aa7.97□□□□□ -1.13
UBASH3B-202ENST00000525711 PPDPFLQ8WWR9 84 aa7.97□□□□□ -1.13
UBASH3B-202ENST00000525711 SCGB1C2P0DMR2 95 aa7.96□□□□□ -1.14
UBASH3B-202ENST00000525711 GHRHP01286 108 aa7.95□□□□□ -1.14
UBASH3B-202ENST00000525711 BATFQ16520 125 aa7.95□□□□□ -1.14
UBASH3B-202ENST00000525711 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa7.94□□□□□ -1.14
UBASH3B-202ENST00000525711 CLEC2BQ92478 149 aa7.94□□□□□ -1.14
UBASH3B-202ENST00000525711 MOBPQ13875 183 aa7.92□□□□□ -1.14
UBASH3B-202ENST00000525711 H3BQ85 93 aa7.91□□□□□ -1.14
UBASH3B-202ENST00000525711 LST1O00453 97 aa7.91□□□□□ -1.14
UBASH3B-202ENST00000525711 TRACP01848 142 aa7.91□□□□□ -1.14
UBASH3B-202ENST00000525711 SNHG12Q9BXW3 62 aa7.91□□□□□ -1.14
UBASH3B-202ENST00000525711 PCP4L1A6NKN8 68 aa7.9□□□□□ -1.14
UBASH3B-202ENST00000525711 DNAL4O96015 105 aa7.9□□□□□ -1.14
UBASH3B-202ENST00000525711 C9orf153Q5TBE3 101 aa7.9□□□□□ -1.14
UBASH3B-202ENST00000525711 C9orf118A6NHY6 69 aa7.89□□□□□ -1.15
UBASH3B-202ENST00000525711 TAX1BP3O14907 124 aa7.89□□□□□ -1.15
UBASH3B-202ENST00000525711 RPS29P62273 56 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
UBASH3B-202ENST00000525711 XP32Q5T750 250 aa7.89□□□□□ -1.15
UBASH3B-202ENST00000525711 LCE2CQ5TA81 110 aa7.89□□□□□ -1.15
UBASH3B-202ENST00000525711 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa7.88□□□□□ -1.15
UBASH3B-202ENST00000525711 ORMDL1Q9P0S3 153 aa7.88□□□□□ -1.15
UBASH3B-202ENST00000525711 F8WEM9 126 aa7.87□□□□□ -1.15
UBASH3B-202ENST00000525711 H3BUT2 72 aa7.87□□□□□ -1.15
UBASH3B-202ENST00000525711 MT1HP80294 61 aa7.87□□□□□ -1.15
UBASH3B-202ENST00000525711 LYRM7Q5U5X0 104 aa7.87□□□□□ -1.15
UBASH3B-202ENST00000525711 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
UBASH3B-202ENST00000525711 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa7.86□□□□□ -1.15
UBASH3B-202ENST00000525711 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa7.86□□□□□ -1.15
UBASH3B-202ENST00000525711 TCL1BO95988 128 aa7.86□□□□□ -1.15
UBASH3B-202ENST00000525711 ATXN8Q156A1 80 aa7.86□□□□□ -1.15
UBASH3B-202ENST00000525711 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa7.86□□□□□ -1.15
UBASH3B-202ENST00000525711 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
UBASH3B-202ENST00000525711 CD164Q04900 197 aa7.85□□□□□ -1.15
UBASH3B-202ENST00000525711 Q6JHZ5 121 aa7.85□□□□□ -1.15
UBASH3B-202ENST00000525711 FABP2P12104 132 aa7.84□□□□□ -1.15
UBASH3B-202ENST00000525711 A0A1W2PPM0 123 aa7.83□□□□□ -1.16
UBASH3B-202ENST00000525711 UBE2V1Q13404 147 aa7.82□□□□□ -1.16
UBASH3B-202ENST00000525711 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa7.82□□□□□ -1.16
UBASH3B-202ENST00000525711 H3BMG7 143 aa7.8□□□□□ -1.16
UBASH3B-202ENST00000525711 BAALC-AS2P0C853 105 aa7.8□□□□□ -1.16
UBASH3B-202ENST00000525711 LORP23490 312 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
UBASH3B-202ENST00000525711 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
UBASH3B-202ENST00000525711 IGFL1Q6UW32 110 aa7.79□□□□□ -1.16
UBASH3B-202ENST00000525711 A0A0G2JQZ4 141 aa7.77□□□□□ -1.17
UBASH3B-202ENST00000525711 M0R2T5 61 aa7.77□□□□□ -1.17
UBASH3B-202ENST00000525711 PCOTHQ58A44 107 aa7.77□□□□□ -1.17
UBASH3B-202ENST00000525711 Q5XG85 94 aa7.77□□□□□ -1.17
UBASH3B-202ENST00000525711 HRCT1Q6UXD1 115 aa7.76□□□□□ -1.17
UBASH3B-202ENST00000525711 ANKRD29Q8N6D5 301 aa7.76□□□□□ -1.17
UBASH3B-202ENST00000525711 Q6Q795 121 aa7.75□□□□□ -1.17
UBASH3B-202ENST00000525711 LIMD2Q9BT23 127 aa7.75□□□□□ -1.17
UBASH3B-202ENST00000525711 C9JAW5 83 aa7.73□□□□□ -1.17
UBASH3B-202ENST00000525711 TEN1Q86WV5 123 aa7.73□□□□□ -1.17
UBASH3B-202ENST00000525711 SPCS1Q9Y6A9 102 aa7.73□□□□□ -1.17
UBASH3B-202ENST00000525711 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa7.72□□□□□ -1.17
UBASH3B-202ENST00000525711 RBM3P98179 157 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
UBASH3B-202ENST00000525711 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa7.7□□□□□ -1.18
UBASH3B-202ENST00000525711 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa7.7□□□□□ -1.18
UBASH3B-202ENST00000525711 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
UBASH3B-202ENST00000525711 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa7.69□□□□□ -1.18
UBASH3B-202ENST00000525711 C9orf92A6NGG3 77 aa7.69□□□□□ -1.18
UBASH3B-202ENST00000525711 H3BT86 120 aa7.69□□□□□ -1.18
UBASH3B-202ENST00000525711 COX6B2Q6YFQ2 88 aa7.69□□□□□ -1.18
UBASH3B-202ENST00000525711 DSCR8Q96T75 97 aa7.69□□□□□ -1.18
UBASH3B-202ENST00000525711 A0A1W2PNM2 257 aa7.68□□□□□ -1.18
UBASH3B-202ENST00000525711 K7EP34 96 aa7.68□□□□□ -1.18
UBASH3B-202ENST00000525711 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa7.67□□□□□ -1.18
UBASH3B-202ENST00000525711 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa7.66□□□□□ -1.18
UBASH3B-202ENST00000525711 A0A1B0GV72 72 aa7.65□□□□□ -1.18
UBASH3B-202ENST00000525711 PDE6GP18545 87 aa7.65□□□□□ -1.18
UBASH3B-202ENST00000525711 C1orf195Q5TG92 126 aa7.65□□□□□ -1.18
UBASH3B-202ENST00000525711 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
UBASH3B-202ENST00000525711 CCKP06307 115 aa7.64□□□□□ -1.19
UBASH3B-202ENST00000525711 SS18L2Q9UHA2 77 aa7.64□□□□□ -1.19
UBASH3B-202ENST00000525711 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa7.63□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.6 ms