RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524152.5

MSC-AS1-210, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene MSC-AS1, Length 571 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-210ENST00000524152 TCL1BO95988 128 aa5.02□□□□□ -1.61
MSC-AS1-210ENST00000524152 C3orf79P0CE67 100 aa5.02□□□□□ -1.61
MSC-AS1-210ENST00000524152 IFITM1P13164 125 aa5.02□□□□□ -1.61
MSC-AS1-210ENST00000524152 Q6ZVH6 145 aa5.02□□□□□ -1.61
MSC-AS1-210ENST00000524152 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
MSC-AS1-210ENST00000524152 USH2AO75445 5202 aa5□□□□□ -1.61
MSC-AS1-210ENST00000524152 C20orf202A1L168 122 aa5□□□□□ -1.61
MSC-AS1-210ENST00000524152 KRTDAPP60985 99 aa5□□□□□ -1.61
MSC-AS1-210ENST00000524152 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
MSC-AS1-210ENST00000524152 SSPOA2VEC9 5147 aa5□□□□□ -1.61
MSC-AS1-210ENST00000524152 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa4.99□□□□□ -1.61
MSC-AS1-210ENST00000524152 MUSTN1Q8IVN3 82 aa4.99□□□□□ -1.61
MSC-AS1-210ENST00000524152 SMIM11BQ8TCY0 68 aa4.99□□□□□ -1.61
MSC-AS1-210ENST00000524152 F8WEM9 126 aa4.98□□□□□ -1.61
MSC-AS1-210ENST00000524152 S100A6P06703 90 aa4.97□□□□□ -1.61
MSC-AS1-210ENST00000524152 S100A2P29034 98 aa4.97□□□□□ -1.61
MSC-AS1-210ENST00000524152 PCP2Q8IVA1 136 aa4.97□□□□□ -1.61
MSC-AS1-210ENST00000524152 VAMP3Q15836 100 aa4.96□□□□□ -1.62
MSC-AS1-210ENST00000524152 ATOH7Q8N100 152 aa4.96□□□□□ -1.62
MSC-AS1-210ENST00000524152 Q6JHZ5 121 aa4.95□□□□□ -1.62
MSC-AS1-210ENST00000524152 LINC00575Q6W349 94 aa4.95□□□□□ -1.62
MSC-AS1-210ENST00000524152 HIST3H2BBQ8N257 126 aa4.95□□□□□ -1.62
MSC-AS1-210ENST00000524152 CLEC2BQ92478 149 aa4.95□□□□□ -1.62
MSC-AS1-210ENST00000524152 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa4.94□□□□□ -1.62
MSC-AS1-210ENST00000524152 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa4.94□□□□□ -1.62
MSC-AS1-210ENST00000524152 Q6ZQY7 126 aa4.94□□□□□ -1.62
MSC-AS1-210ENST00000524152 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa4.94□□□□□ -1.62
MSC-AS1-210ENST00000524152 HIST1H2BLQ99880 126 aa4.94□□□□□ -1.62
MSC-AS1-210ENST00000524152 hADV29S1A0JD25 119 aa4.93□□□□□ -1.62
MSC-AS1-210ENST00000524152 IGFL1Q6UW32 110 aa4.93□□□□□ -1.62
MSC-AS1-210ENST00000524152 Q75L30 129 aa4.93□□□□□ -1.62
MSC-AS1-210ENST00000524152 C9orf118A6NHY6 69 aa4.92□□□□□ -1.62
MSC-AS1-210ENST00000524152 HSBP1L1C9JCN9 74 aa4.92□□□□□ -1.62
MSC-AS1-210ENST00000524152 OCIAD2Q56VL3 154 aa4.92□□□□□ -1.62
MSC-AS1-210ENST00000524152 Q6Q795 121 aa4.92□□□□□ -1.62
MSC-AS1-210ENST00000524152 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
MSC-AS1-210ENST00000524152 PPDPFLQ8WWR9 84 aa4.89□□□□□ -1.63
MSC-AS1-210ENST00000524152 LST1O00453 97 aa4.88□□□□□ -1.63
MSC-AS1-210ENST00000524152 H3BUT2 72 aa4.87□□□□□ -1.63
MSC-AS1-210ENST00000524152 SCGB1D1O95968 90 aa4.87□□□□□ -1.63
MSC-AS1-210ENST00000524152 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa4.87□□□□□ -1.63
MSC-AS1-210ENST00000524152 Q96NJ1 140 aa4.87□□□□□ -1.63
MSC-AS1-210ENST00000524152 SNHG12Q9BXW3 62 aa4.87□□□□□ -1.63
MSC-AS1-210ENST00000524152 SS18L2Q9UHA2 77 aa4.86□□□□□ -1.63
MSC-AS1-210ENST00000524152 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
MSC-AS1-210ENST00000524152 DLEU1O43261 78 aa4.85□□□□□ -1.63
MSC-AS1-210ENST00000524152 CFC1P0CG37 223 aa4.85□□□□□ -1.63
MSC-AS1-210ENST00000524152 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa4.85□□□□□ -1.63
MSC-AS1-210ENST00000524152 C12orf57Q99622 126 aa4.85□□□□□ -1.63
MSC-AS1-210ENST00000524152 A8MUU9 505 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-210ENST00000524152 COX8AP10176 69 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-210ENST00000524152 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-210ENST00000524152 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa4.82□□□□□ -1.64
MSC-AS1-210ENST00000524152 HIST1H4GQ99525 98 aa4.82□□□□□ -1.64
MSC-AS1-210ENST00000524152 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
MSC-AS1-210ENST00000524152 TEN1Q86WV5 123 aa4.81□□□□□ -1.64
MSC-AS1-210ENST00000524152 A0A087WSZ3 146 aa4.8□□□□□ -1.64
MSC-AS1-210ENST00000524152 SNCGO76070 127 aa4.8□□□□□ -1.64
MSC-AS1-210ENST00000524152 HIGD1BQ9P298 99 aa4.8□□□□□ -1.64
MSC-AS1-210ENST00000524152 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa4.79□□□□□ -1.64
MSC-AS1-210ENST00000524152 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
MSC-AS1-210ENST00000524152 VAMP8Q9BV40 100 aa4.79□□□□□ -1.64
MSC-AS1-210ENST00000524152 H0YGX0 51 aa4.78□□□□□ -1.64
MSC-AS1-210ENST00000524152 DSCR10P59022 87 aa4.78□□□□□ -1.64
MSC-AS1-210ENST00000524152 FAM218AQ96MZ4 157 aa4.78□□□□□ -1.64
MSC-AS1-210ENST00000524152 H3BMG7 143 aa4.77□□□□□ -1.65
MSC-AS1-210ENST00000524152 SPATA45Q537H7 98 aa4.77□□□□□ -1.65
MSC-AS1-210ENST00000524152 RAB37Q96AX2 223 aa4.77□□□□□ -1.65
MSC-AS1-210ENST00000524152 C14orf144Q96I85 54 aa4.77□□□□□ -1.65
MSC-AS1-210ENST00000524152 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
MSC-AS1-210ENST00000524152 SIGMAR1Q99720 223 aa4.76□□□□□ -1.65
MSC-AS1-210ENST00000524152 PAM16Q9Y3D7 125 aa4.76□□□□□ -1.65
MSC-AS1-210ENST00000524152 A0A0B4J2C4 111 aa4.75□□□□□ -1.65
MSC-AS1-210ENST00000524152 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa4.75□□□□□ -1.65
MSC-AS1-210ENST00000524152 MT2AP02795 61 aa4.75□□□□□ -1.65
MSC-AS1-210ENST00000524152 FAM236CP0DP71 79 aa4.75□□□□□ -1.65
MSC-AS1-210ENST00000524152 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-210ENST00000524152 FABP2P12104 132 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-210ENST00000524152 LINC00313P59037 77 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-210ENST00000524152 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-210ENST00000524152 A0A1B0GX51 115 aa4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-210ENST00000524152 A0A1W2PNM2 257 aa4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-210ENST00000524152 PYY3Q5JQD4 70 aa4.73□□□□□ -1.65
MSC-AS1-210ENST00000524152 IGKV4-1P06312 121 aa4.72□□□□□ -1.65
MSC-AS1-210ENST00000524152 CEND1Q8N111 149 aa4.72□□□□□ -1.65
MSC-AS1-210ENST00000524152 MPLKIPQ8TAP9 179 aa4.72□□□□□ -1.65
MSC-AS1-210ENST00000524152 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa4.72□□□□□ -1.65
MSC-AS1-210ENST00000524152 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa4.71□□□□□ -1.66
MSC-AS1-210ENST00000524152 MT1FP04733 61 aa4.71□□□□□ -1.66
MSC-AS1-210ENST00000524152 C2orf91Q6ZV80 131 aa4.71□□□□□ -1.66
MSC-AS1-210ENST00000524152 PRO1854Q9UHT4 67 aa4.71□□□□□ -1.66
MSC-AS1-210ENST00000524152 HRES1P13985 223 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-210ENST00000524152 ANKRD29Q8N6D5 301 aa4.7□□□□□ -1.66
MSC-AS1-210ENST00000524152 KRTAP10-10P60014 251 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-210ENST00000524152 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-210ENST00000524152 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-210ENST00000524152 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-210ENST00000524152 UQCR10Q9UDW1 63 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-210ENST00000524152 A0A1B0GV72 72 aa4.68□□□□□ -1.66
MSC-AS1-210ENST00000524152 H3BQ85 93 aa4.68□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.6 ms