RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522466.1

PDGFRB-210, Transcript of platelet derived growth factor receptor beta, humanhuman

TSL 3

Gene PDGFRB, Length 296 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRB-210ENST00000522466 HERVK_113P61574 105 aa3.91□□□□□ -1.78
PDGFRB-210ENST00000522466 LINC00518Q8N0U6 118 aa3.91□□□□□ -1.78
PDGFRB-210ENST00000522466 LINC00308Q8TCZ7 52 aa3.91□□□□□ -1.78
PDGFRB-210ENST00000522466 SPANXCQ9NY87 97 aa3.91□□□□□ -1.78
PDGFRB-210ENST00000522466 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa3.9□□□□□ -1.79
PDGFRB-210ENST00000522466 SPANXDQ9BXN6 97 aa3.9□□□□□ -1.79
PDGFRB-210ENST00000522466 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa3.9□□□□□ -1.79
PDGFRB-210ENST00000522466 TMEM218A2RU14 115 aa3.89□□□□□ -1.79
PDGFRB-210ENST00000522466 F8WEM9 126 aa3.89□□□□□ -1.79
PDGFRB-210ENST00000522466 HRES1P13985 223 aa3.89□□□□□ -1.79
PDGFRB-210ENST00000522466 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
PDGFRB-210ENST00000522466 DSCR10P59022 87 aa3.88□□□□□ -1.79
PDGFRB-210ENST00000522466 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
PDGFRB-210ENST00000522466 LITAFQ99732 161 aa3.88□□□□□ -1.79
PDGFRB-210ENST00000522466 A0A1B0GWB2 263 aa3.87□□□□□ -1.79
PDGFRB-210ENST00000522466 LST1O00453 97 aa3.87□□□□□ -1.79
PDGFRB-210ENST00000522466 SERF1AO75920 110 aa3.87□□□□□ -1.79
PDGFRB-210ENST00000522466 DPM2O94777 84 aa3.87□□□□□ -1.79
PDGFRB-210ENST00000522466 IGKCP01834 107 aa3.87□□□□□ -1.79
PDGFRB-210ENST00000522466 PLNP26678 52 aa3.87□□□□□ -1.79
PDGFRB-210ENST00000522466 MPLKIPQ8TAP9 179 aa3.87□□□□□ -1.79
PDGFRB-210ENST00000522466 HSBP1O75506 76 aa3.86□□□□□ -1.79
PDGFRB-210ENST00000522466 Q6ZVH6 145 aa3.86□□□□□ -1.79
PDGFRB-210ENST00000522466 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa3.86□□□□□ -1.79
PDGFRB-210ENST00000522466 CLEC2BQ92478 149 aa3.86□□□□□ -1.79
PDGFRB-210ENST00000522466 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa3.85□□□□□ -1.79
PDGFRB-210ENST00000522466 LEPROTL1O95214 131 aa3.85□□□□□ -1.79
PDGFRB-210ENST00000522466 A6NDN8 102 aa3.84□□□□□ -1.79
PDGFRB-210ENST00000522466 FABP4P15090 132 aa3.84□□□□□ -1.79
PDGFRB-210ENST00000522466 MDN1Q9NU22 5596 aa3.84□□□□□ -1.79
PDGFRB-210ENST00000522466 E9PLD3 99 aa3.83□□□□□ -1.8
PDGFRB-210ENST00000522466 Q6JHZ5 121 aa3.83□□□□□ -1.8
PDGFRB-210ENST00000522466 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa3.83□□□□□ -1.8
PDGFRB-210ENST00000522466 TTTY13Q9BZ97 58 aa3.83□□□□□ -1.8
PDGFRB-210ENST00000522466 C9orf118A6NHY6 69 aa3.82□□□□□ -1.8
PDGFRB-210ENST00000522466 TIMM17BO60830 172 aa3.82□□□□□ -1.8
PDGFRB-210ENST00000522466 OCIAD2Q56VL3 154 aa3.82□□□□□ -1.8
PDGFRB-210ENST00000522466 CLLU1Q5K131 121 aa3.82□□□□□ -1.8
PDGFRB-210ENST00000522466 UQCC3Q6UW78 93 aa3.82□□□□□ -1.8
PDGFRB-210ENST00000522466 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
PDGFRB-210ENST00000522466 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa3.81□□□□□ -1.8
PDGFRB-210ENST00000522466 ZNF815PA8K554 130 aa3.81□□□□□ -1.8
PDGFRB-210ENST00000522466 H3BUT2 72 aa3.81□□□□□ -1.8
PDGFRB-210ENST00000522466 S100A6P06703 90 aa3.81□□□□□ -1.8
PDGFRB-210ENST00000522466 A4D1N5 150 aa3.8□□□□□ -1.8
PDGFRB-210ENST00000522466 A8MWP4 228 aa3.8□□□□□ -1.8
PDGFRB-210ENST00000522466 Q6ZQY7 126 aa3.8□□□□□ -1.8
PDGFRB-210ENST00000522466 SMIM11BQ8TCY0 68 aa3.8□□□□□ -1.8
PDGFRB-210ENST00000522466 HSPB8Q9UJY1 196 aa3.8□□□□□ -1.8
PDGFRB-210ENST00000522466 A6NN06 94 aa3.78□□□□□ -1.8
PDGFRB-210ENST00000522466 MTURNQ8N3F0 131 aa3.78□□□□□ -1.8
PDGFRB-210ENST00000522466 SIGMAR1Q99720 223 aa3.78□□□□□ -1.8
PDGFRB-210ENST00000522466 COLCA2A8K830 154 aa3.77□□□□□ -1.81
PDGFRB-210ENST00000522466 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa3.77□□□□□ -1.81
PDGFRB-210ENST00000522466 LINC00313P59037 77 aa3.77□□□□□ -1.81
PDGFRB-210ENST00000522466 LINC00575Q6W349 94 aa3.77□□□□□ -1.81
PDGFRB-210ENST00000522466 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa3.77□□□□□ -1.81
PDGFRB-210ENST00000522466 SS18L2Q9UHA2 77 aa3.77□□□□□ -1.81
PDGFRB-210ENST00000522466 KMT2DO14686 5537 aa3.77□□□□□ -1.81
PDGFRB-210ENST00000522466 hADV29S1A0JD25 119 aa3.76□□□□□ -1.81
PDGFRB-210ENST00000522466 MUSTN1Q8IVN3 82 aa3.76□□□□□ -1.81
PDGFRB-210ENST00000522466 A0A087WSZ3 146 aa3.75□□□□□ -1.81
PDGFRB-210ENST00000522466 SCGB1D4Q6XE38 83 aa3.75□□□□□ -1.81
PDGFRB-210ENST00000522466 SNHG12Q9BXW3 62 aa3.75□□□□□ -1.81
PDGFRB-210ENST00000522466 APOC3P02656 99 aa3.74□□□□□ -1.81
PDGFRB-210ENST00000522466 VAMP3Q15836 100 aa3.74□□□□□ -1.81
PDGFRB-210ENST00000522466 YPEL4Q96NS1 127 aa3.74□□□□□ -1.81
PDGFRB-210ENST00000522466 TRGC2P03986 189 aa3.73□□□□□ -1.81
PDGFRB-210ENST00000522466 KRTAP5-9P26371 169 aa3.73□□□□□ -1.81
PDGFRB-210ENST00000522466 IGKV4-1P06312 121 aa3.72□□□□□ -1.81
PDGFRB-210ENST00000522466 IFITM1P13164 125 aa3.72□□□□□ -1.81
PDGFRB-210ENST00000522466 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa3.71□□□□□ -1.82
PDGFRB-210ENST00000522466 SPINK7P58062 85 aa3.71□□□□□ -1.82
PDGFRB-210ENST00000522466 DEFB116Q30KQ4 102 aa3.71□□□□□ -1.82
PDGFRB-210ENST00000522466 TEN1Q86WV5 123 aa3.71□□□□□ -1.82
PDGFRB-210ENST00000522466 COPS9Q8WXC6 57 aa3.71□□□□□ -1.82
PDGFRB-210ENST00000522466 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa3.7□□□□□ -1.82
PDGFRB-210ENST00000522466 SNAPINO95295 136 aa3.7□□□□□ -1.82
PDGFRB-210ENST00000522466 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
PDGFRB-210ENST00000522466 WFDC13Q8IUB5 93 aa3.7□□□□□ -1.82
PDGFRB-210ENST00000522466 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa3.69□□□□□ -1.82
PDGFRB-210ENST00000522466 A0A1W2PNM2 257 aa3.69□□□□□ -1.82
PDGFRB-210ENST00000522466 SCGB1D1O95968 90 aa3.69□□□□□ -1.82
PDGFRB-210ENST00000522466 LINC01545Q5VT33 79 aa3.68□□□□□ -1.82
PDGFRB-210ENST00000522466 MT1BP07438 61 aa3.67□□□□□ -1.82
PDGFRB-210ENST00000522466 SVBPQ8N300 66 aa3.67□□□□□ -1.82
PDGFRB-210ENST00000522466 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
PDGFRB-210ENST00000522466 PPDPFLQ8WWR9 84 aa3.67□□□□□ -1.82
PDGFRB-210ENST00000522466 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
PDGFRB-210ENST00000522466 PET117Q6UWS5 81 aa3.65□□□□□ -1.83
PDGFRB-210ENST00000522466 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
PDGFRB-210ENST00000522466 A0A1B0GV72 72 aa3.64□□□□□ -1.83
PDGFRB-210ENST00000522466 H3BMG7 143 aa3.64□□□□□ -1.83
PDGFRB-210ENST00000522466 SPRR2EP22531 72 aa3.64□□□□□ -1.83
PDGFRB-210ENST00000522466 SPRR2BP35325 72 aa3.64□□□□□ -1.83
PDGFRB-210ENST00000522466 SPRR2AP35326 72 aa3.64□□□□□ -1.83
PDGFRB-210ENST00000522466 KRTAP10-5P60370 271 aa3.64□□□□□ -1.83
PDGFRB-210ENST00000522466 ATOH7Q8N100 152 aa3.64□□□□□ -1.83
PDGFRB-210ENST00000522466 C12orf57Q99622 126 aa3.64□□□□□ -1.83
PDGFRB-210ENST00000522466 C3orf79P0CE67 100 aa3.63□□□□□ -1.83
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