RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516122.1

RNU6-871P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 871, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-871P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-871P-201ENST00000516122 J3QR89 54 aa-6.09□□□□□ -3.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 CCDC153Q494R4 210 aa-6.09□□□□□ -3.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 SMIM3Q9BZL3 60 aa-6.09□□□□□ -3.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP-6.1□□□□□ -3.39
RNU6-871P-201ENST00000516122 S100PP25815 95 aa-6.1□□□□□ -3.39
RNU6-871P-201ENST00000516122 S100GP29377 79 aa-6.1□□□□□ -3.39
RNU6-871P-201ENST00000516122 CACFD1Q9UGQ2 172 aa-6.11□□□□□ -3.39
RNU6-871P-201ENST00000516122 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa-6.12□□□□□ -3.39
RNU6-871P-201ENST00000516122 CATR1Q13166 79 aa-6.12□□□□□ -3.39
RNU6-871P-201ENST00000516122 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa-6.12□□□□□ -3.39
RNU6-871P-201ENST00000516122 DOT1LQ8TEK3 1739 aa-6.12□□□□□ -3.39
RNU6-871P-201ENST00000516122 COPS9Q8WXC6 57 aa-6.12□□□□□ -3.39
RNU6-871P-201ENST00000516122 CGREF1Q99674 301 aa-6.12□□□□□ -3.39
RNU6-871P-201ENST00000516122 DPH3P1Q9H4G8 78 aa-6.12□□□□□ -3.39
RNU6-871P-201ENST00000516122 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa-6.13□□□□□ -3.39
RNU6-871P-201ENST00000516122 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP-6.13□□□□□ -3.39
RNU6-871P-201ENST00000516122 CCDC167Q9P0B6 97 aa-6.13□□□□□ -3.39
RNU6-871P-201ENST00000516122 KIF21BO75037 1637 aa-6.14□□□□□ -3.39
RNU6-871P-201ENST00000516122 MED14O60244 1454 aa-6.14□□□□□ -3.39
RNU6-871P-201ENST00000516122 MLH3Q9UHC1 1453 aa-6.14□□□□□ -3.39
RNU6-871P-201ENST00000516122 FHAD1B1AJZ9 1412 aa-6.14□□□□□ -3.39
RNU6-871P-201ENST00000516122 MYH4Q9Y623 1939 aa-6.14□□□□□ -3.39
RNU6-871P-201ENST00000516122 GINS2Q9Y248 185 aa-6.14□□□□□ -3.39
RNU6-871P-201ENST00000516122 CROCC2H7BZ55 1655 aa-6.14□□□□□ -3.39
RNU6-871P-201ENST00000516122 H3BUA1 57 aa-6.15□□□□□ -3.39
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP-6.15□□□□□ -3.39
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMEM218A2RU14 115 aa-6.16□□□□□ -3.4
RNU6-871P-201ENST00000516122 NAP1L6A6NFF2 107 aa-6.16□□□□□ -3.4
RNU6-871P-201ENST00000516122 OOSP1A8MZH6 123 aa-6.16□□□□□ -3.4
RNU6-871P-201ENST00000516122 C1orf54Q8WWF1 131 aa-6.16□□□□□ -3.4
RNU6-871P-201ENST00000516122 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa-6.16□□□□□ -3.4
RNU6-871P-201ENST00000516122 M0R2Z0 102 aa-6.17□□□□□ -3.4
RNU6-871P-201ENST00000516122 COPZ1P61923 177 aa-6.17□□□□□ -3.4
RNU6-871P-201ENST00000516122 SPANXCQ9NY87 97 aa-6.17□□□□□ -3.4
RNU6-871P-201ENST00000516122 CHD1O14646 1710 aa-6.17□□□□□ -3.4
RNU6-871P-201ENST00000516122 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa-6.18□□□□□ -3.4
RNU6-871P-201ENST00000516122 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa-6.18□□□□□ -3.4
RNU6-871P-201ENST00000516122 IQCF6A8MYZ5 107 aa-6.18□□□□□ -3.4
RNU6-871P-201ENST00000516122 ATP10BO94823 1461 aa-6.18□□□□□ -3.4
RNU6-871P-201ENST00000516122 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa-6.18□□□□□ -3.4
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP-6.19□□□□□ -3.4
RNU6-871P-201ENST00000516122 GSKIPQ9P0R6 139 aa-6.19□□□□□ -3.4
RNU6-871P-201ENST00000516122 D6R8Y8 96 aa-6.2□□□□□ -3.4
RNU6-871P-201ENST00000516122 RPS25P62851 125 aaKnown RBP-6.2□□□□□ -3.4
RNU6-871P-201ENST00000516122 PMCHL1Q16048 86 aa-6.2□□□□□ -3.4
RNU6-871P-201ENST00000516122 ALKAL2Q6UX46 152 aa-6.2□□□□□ -3.4
RNU6-871P-201ENST00000516122 MUSTN1Q8IVN3 82 aa-6.2□□□□□ -3.4
RNU6-871P-201ENST00000516122 APOC2P02655 101 aa-6.22□□□□□ -3.41
RNU6-871P-201ENST00000516122 PLIN4Q96Q06 1357 aa-6.22□□□□□ -3.41
RNU6-871P-201ENST00000516122 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP-6.22□□□□□ -3.41
RNU6-871P-201ENST00000516122 ABCC2Q92887 1545 aa-6.23□□□□□ -3.41
RNU6-871P-201ENST00000516122 HSPB11Q9Y547 144 aa-6.23□□□□□ -3.41
RNU6-871P-201ENST00000516122 ITSN1Q15811 1721 aa-6.23□□□□□ -3.41
RNU6-871P-201ENST00000516122 NRXN1Q9ULB1 1477 aa-6.23□□□□□ -3.41
RNU6-871P-201ENST00000516122 TRAV21A0A0B4J279 112 aa-6.24□□□□□ -3.41
RNU6-871P-201ENST00000516122 DR1Q01658 176 aa-6.24□□□□□ -3.41
RNU6-871P-201ENST00000516122 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa-6.24□□□□□ -3.41
RNU6-871P-201ENST00000516122 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP-6.25□□□□□ -3.41
RNU6-871P-201ENST00000516122 LTN1O94822 1766 aa-6.26□□□□□ -3.41
RNU6-871P-201ENST00000516122 HMGN3Q15651 99 aa-6.26□□□□□ -3.41
RNU6-871P-201ENST00000516122 CCDC58Q4VC31 144 aa-6.26□□□□□ -3.41
RNU6-871P-201ENST00000516122 CD163L1Q9NR16 1453 aa-6.27□□□□□ -3.41
RNU6-871P-201ENST00000516122 USP34Q70CQ2 3546 aa-6.27□□□□□ -3.41
RNU6-871P-201ENST00000516122 A0A1B0GV72 72 aa-6.27□□□□□ -3.41
RNU6-871P-201ENST00000516122 G0S2P27469 103 aa-6.28□□□□□ -3.41
RNU6-871P-201ENST00000516122 A0A1B0GUT8 65 aa-6.29□□□□□ -3.42
RNU6-871P-201ENST00000516122 DDA1Q9BW61 102 aa-6.29□□□□□ -3.42
RNU6-871P-201ENST00000516122 SFTA3P0C7M3 94 aa-6.3□□□□□ -3.42
RNU6-871P-201ENST00000516122 MEIG1Q5JSS6 88 aa-6.3□□□□□ -3.42
RNU6-871P-201ENST00000516122 DIP2BQ9P265 1576 aa-6.31□□□□□ -3.42
RNU6-871P-201ENST00000516122 TSTD1Q8NFU3 115 aa-6.31□□□□□ -3.42
RNU6-871P-201ENST00000516122 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa-6.32□□□□□ -3.42
RNU6-871P-201ENST00000516122 TSTD3H0UI37 97 aa-6.32□□□□□ -3.42
RNU6-871P-201ENST00000516122 LOC400499M0QZD8 3231 aa-6.33□□□□□ -3.42
RNU6-871P-201ENST00000516122 NCOA2Q15596 1464 aa-6.34□□□□□ -3.42
RNU6-871P-201ENST00000516122 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa-6.34□□□□□ -3.42
RNU6-871P-201ENST00000516122 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP-6.34□□□□□ -3.42
RNU6-871P-201ENST00000516122 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa-6.34□□□□□ -3.42
RNU6-871P-201ENST00000516122 GNG10P50151 68 aa-6.34□□□□□ -3.42
RNU6-871P-201ENST00000516122 MINOS1Q5TGZ0 78 aa-6.34□□□□□ -3.42
RNU6-871P-201ENST00000516122 UNC80Q8N2C7 3258 aa-6.34□□□□□ -3.42
RNU6-871P-201ENST00000516122 UBR1Q8IWV7 1749 aa-6.35□□□□□ -3.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 hADV29S1A0JD25 119 aa-6.35□□□□□ -3.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 UQCRHP07919 91 aa-6.35□□□□□ -3.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 NBEAP1P0C6P0 100 aa-6.35□□□□□ -3.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 CKS1BP61024 79 aa-6.35□□□□□ -3.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP-6.35□□□□□ -3.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 CENPHQ9H3R5 247 aa-6.35□□□□□ -3.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa-6.36□□□□□ -3.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 ETDBQ3ZM63 59 aa-6.36□□□□□ -3.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 CCNB3Q8WWL7 1395 aa-6.36□□□□□ -3.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 MPC2O95563 127 aa-6.37□□□□□ -3.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 SPANXA1Q9NS26 97 aa-6.37□□□□□ -3.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa-6.37□□□□□ -3.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 FOCADQ5VW36 1801 aa-6.38□□□□□ -3.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAM24AA6NFZ4 105 aa-6.38□□□□□ -3.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 NDUFC1O43677 76 aa-6.38□□□□□ -3.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 KRTDAPP60985 99 aa-6.38□□□□□ -3.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 CRIP1P50238 77 aa-6.39□□□□□ -3.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 VCANP13611 3396 aa-6.4□□□□□ -3.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms