RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509535.5

RACK1-222, Transcript of receptor for activated C kinase 1, human

TSL 3

Gene RACK1, Length 456 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RACK1-222	ENST00000509535	ASB16-AS1	Q495Z4	193 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RACK1-222	ENST00000509535	ST20-AS1	Q8NBB2	130 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RACK1-222	ENST00000509535	SLC25A20	O43772	301 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RACK1-222	ENST00000509535		Q1RN00	199 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RACK1-222	ENST00000509535	LCE2C	Q5TA81	110 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RACK1-222	ENST00000509535	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RACK1-222	ENST00000509535	FAM218A	Q96MZ4	157 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RACK1-222	ENST00000509535	TEX49	A0A1B0GTD5	131 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RACK1-222	ENST00000509535	UNQ6493/PRO21345	Q6UXR8	122 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RACK1-222	ENST00000509535	SMIM29	Q86T20	159 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RACK1-222	ENST00000509535		Q8N377	158 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RACK1-222	ENST00000509535	COX6C	P09669	75 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RACK1-222	ENST00000509535		Q6ZQY7	126 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RACK1-222	ENST00000509535	LINC00304	Q8N9R0	145 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RACK1-222	ENST00000509535	SNHG12	Q9BXW3	62 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RACK1-222	ENST00000509535	PSMB2	P49721	201 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RACK1-222	ENST00000509535	MT1H	P80294	61 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RACK1-222	ENST00000509535	SSBP3-AS1	Q7Z2R9	100 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RACK1-222	ENST00000509535	C3orf22	Q8N5N4	141 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RACK1-222	ENST00000509535	PPDPFL	Q8WWR9	84 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RACK1-222	ENST00000509535	TAX1BP3	O14907	124 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RACK1-222	ENST00000509535	SNCG	O76070	127 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RACK1-222	ENST00000509535	LOR	P23490	312 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RACK1-222	ENST00000509535	OCIAD2	Q56VL3	154 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RACK1-222	ENST00000509535	CLEC2B	Q92478	149 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RACK1-222	ENST00000509535	C9orf118	A6NHY6	69 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RACK1-222	ENST00000509535	LST1	O00453	97 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RACK1-222	ENST00000509535	TRAC	P01848	142 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RACK1-222	ENST00000509535	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RACK1-222	ENST00000509535	BATF	Q16520	125 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RACK1-222	ENST00000509535	DEFB105A	Q8NG35	78 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RACK1-222	ENST00000509535	LAMTOR3	Q9UHA4	124 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RACK1-222	ENST00000509535	IGLV8-61	A0A075B6I0	122 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RACK1-222	ENST00000509535	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RACK1-222	ENST00000509535	SCGB1C2	P0DMR2	95 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RACK1-222	ENST00000509535	KRTAP13-3	Q3SY46	172 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RACK1-222	ENST00000509535		Q8NBF4	154 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RACK1-222	ENST00000509535	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RACK1-222	ENST00000509535	PCP4L1	A6NKN8	68 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RACK1-222	ENST00000509535		H3BQ85	93 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RACK1-222	ENST00000509535		H3BUT2	72 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RACK1-222	ENST00000509535	TCL1B	O95988	128 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RACK1-222	ENST00000509535	GHRH	P01286	108 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RACK1-222	ENST00000509535	MOBP	Q13875	183 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RACK1-222	ENST00000509535	KRTAP19-2	Q3LHN2	52 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RACK1-222	ENST00000509535	COL5A1-AS1	Q5SY13	56 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RACK1-222	ENST00000509535	SPAG11A	Q6PDA7	123 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RACK1-222	ENST00000509535	NAA38	Q9BRA0	125 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RACK1-222	ENST00000509535	TRBV20-1	A0A075B6N2	111 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RACK1-222	ENST00000509535		A0A1W2PPM0	123 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RACK1-222	ENST00000509535	DNAL4	O96015	105 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RACK1-222	ENST00000509535	RPS29	P62273	56 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RACK1-222	ENST00000509535	ATXN8	Q156A1	80 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RACK1-222	ENST00000509535	LYRM7	Q5U5X0	104 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RACK1-222	ENST00000509535	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RACK1-222	ENST00000509535	ORMDL1	Q9P0S3	153 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RACK1-222	ENST00000509535	TMEM256-PLSCR3	K7ERE1	68 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RACK1-222	ENST00000509535	SPINK1	P00995	79 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RACK1-222	ENST00000509535	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RACK1-222	ENST00000509535	CD164	Q04900	197 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RACK1-222	ENST00000509535	UBE2V1	Q13404	147 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RACK1-222	ENST00000509535	C9orf153	Q5TBE3	101 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RACK1-222	ENST00000509535		Q6JHZ5	121 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RACK1-222	ENST00000509535		F8WEM9	126 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RACK1-222	ENST00000509535	BAALC-AS2	P0C853	105 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RACK1-222	ENST00000509535	FABP2	P12104	132 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RACK1-222	ENST00000509535	IGFL1	Q6UW32	110 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RACK1-222	ENST00000509535	C4orf48	Q5BLP8	95 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RACK1-222	ENST00000509535		Q5XG85	94 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RACK1-222	ENST00000509535		A0A0G2JQZ4	141 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RACK1-222	ENST00000509535		H3BMG7	143 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RACK1-222	ENST00000509535		M0R2T5	61 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RACK1-222	ENST00000509535	SSPO	A2VEC9	5147 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RACK1-222	ENST00000509535		Q6Q795	121 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RACK1-222	ENST00000509535		C9JAW5	83 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RACK1-222	ENST00000509535	ANKRD29	Q8N6D5	301 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RACK1-222	ENST00000509535	OBSCN-AS1	Q96MR7	158 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RACK1-222	ENST00000509535	SPCS1	Q9Y6A9	102 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RACK1-222	ENST00000509535	FCGBP	Q9Y6R7	5405 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RACK1-222	ENST00000509535	TRBV7-4	A0A0J9YYF1	115 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RACK1-222	ENST00000509535		H3BT86	120 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RACK1-222	ENST00000509535	TEN1	Q86WV5	123 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RACK1-222	ENST00000509535	USH2A	O75445	5202 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RACK1-222	ENST00000509535	FLG	P20930	4061 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
RACK1-222	ENST00000509535	TRBV7-7	A0A0K0K1E9	115 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RACK1-222	ENST00000509535		A0A1W2PNM2	257 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RACK1-222	ENST00000509535	JMJD7-PLA2G4B	H0Y9G9	81 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RACK1-222	ENST00000509535		K7EP34	96 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RACK1-222	ENST00000509535	RBM3	P98179	157 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
RACK1-222	ENST00000509535	XP32	Q5T750	250 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RACK1-222	ENST00000509535	LIMD2	Q9BT23	127 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RACK1-222	ENST00000509535	PRO0461	Q9UI25	63 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RACK1-222	ENST00000509535	SMCP	P49901	116 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
RACK1-222	ENST00000509535	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RACK1-222	ENST00000509535	LOC110117498	A0A087WWA1	95 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RACK1-222	ENST00000509535	GTF2H5	Q6ZYL4	71 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RACK1-222	ENST00000509535	C1orf195	Q5TG92	126 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RACK1-222	ENST00000509535		Q6ZQT0	140 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RACK1-222	ENST00000509535	DSCR8	Q96T75	97 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RACK1-222	ENST00000509535		A0A1B0GW54	56 aa		4.67	□□□□□ -1.66

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 113.5 ms