RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503687.2

RABGEF1-211, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 4,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-211ENST00000503687 WIPF1O43516 503 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-211ENST00000503687 NUPR2A6NF83 97 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-211ENST00000503687 H0Y9P7 68 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-211ENST00000503687 BCE1O60756 84 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-211ENST00000503687 KLKP1Q107X0 134 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-211ENST00000503687 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-211ENST00000503687 ANAPC11Q9NYG5 84 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-211ENST00000503687 TLX1NBP0CAT3 122 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGEF1-211ENST00000503687 SPTSSBQ8NFR3 76 aa8.15□□□□□ -1.1
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RABGEF1-211ENST00000503687 A6NED7 52 aa8.03□□□□□ -1.12
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RABGEF1-211ENST00000503687 A8MWP4 228 aa8.01□□□□□ -1.13
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RABGEF1-211ENST00000503687 A8MUN3 132 aa7.96□□□□□ -1.14
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RABGEF1-211ENST00000503687 LINC00472Q9H8W2 130 aa7.8□□□□□ -1.16
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RABGEF1-211ENST00000503687 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-211ENST00000503687 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-211ENST00000503687 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
RABGEF1-211ENST00000503687 CD164Q04900 197 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-211ENST00000503687 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGEF1-211ENST00000503687 A0A1B0GU69 56 aa7.66□□□□□ -1.18
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