RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496549.5

CRNKL1-205, Transcript of crooked neck pre-mRNA splicing factor 1, human

TSL 1 (best)

Gene CRNKL1, Length 4,093 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CRNKL1-205	ENST00000496549	CSAG1	Q6PB30	78 aa		5.33	□□□□□ -1.56
CRNKL1-205	ENST00000496549	FLNA	P21333	2647 aa	Known RBP	5.33	□□□□□ -1.56
CRNKL1-205	ENST00000496549		K7ERS5	55 aa		5.33	□□□□□ -1.56
CRNKL1-205	ENST00000496549	DEFB4A	O15263	64 aa		5.32	□□□□□ -1.56
CRNKL1-205	ENST00000496549	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	5.31	□□□□□ -1.56	2e-6	■■□□□ 12.2
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZAN	Q9Y493	2812 aa		5.31	□□□□□ -1.56
CRNKL1-205	ENST00000496549		A0A096LNI7	61 aa		5.31	□□□□□ -1.56
CRNKL1-205	ENST00000496549	REG3G	Q6UW15	175 aa		5.3	□□□□□ -1.56
CRNKL1-205	ENST00000496549	HIVEP1	P15822	2718 aa		5.3	□□□□□ -1.56
CRNKL1-205	ENST00000496549	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	5.29	□□□□□ -1.56
CRNKL1-205	ENST00000496549	DEFB131B	A0A096LNP1	70 aa		5.29	□□□□□ -1.56
CRNKL1-205	ENST00000496549		Q6YL49	198 aa		5.29	□□□□□ -1.56
CRNKL1-205	ENST00000496549	KRTAP10-9	P60411	292 aa		5.29	□□□□□ -1.56
CRNKL1-205	ENST00000496549	ADM2	Q7Z4H4	148 aa		5.29	□□□□□ -1.56
CRNKL1-205	ENST00000496549	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		5.28	□□□□□ -1.56
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGFL1	Q6UW32	110 aa		5.28	□□□□□ -1.56
CRNKL1-205	ENST00000496549	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		5.28	□□□□□ -1.56
CRNKL1-205	ENST00000496549	DEFB135	Q30KP9	77 aa		5.28	□□□□□ -1.56
CRNKL1-205	ENST00000496549		A0A087X002	238 aa		5.27	□□□□□ -1.57
CRNKL1-205	ENST00000496549	MAPK1IP1L	Q8NDC0	245 aa		5.27	□□□□□ -1.57
CRNKL1-205	ENST00000496549	HIVEP2	P31629	2446 aa		5.27	□□□□□ -1.57
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGHV6-1	A0A0B4J1U7	121 aa		5.27	□□□□□ -1.57
CRNKL1-205	ENST00000496549	ATR	Q13535	2644 aa		5.26	□□□□□ -1.57
CRNKL1-205	ENST00000496549	HRES1	P13985	223 aa		5.26	□□□□□ -1.57
CRNKL1-205	ENST00000496549	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
CRNKL1-205	ENST00000496549	PDZD2	O15018	2839 aa		5.25	□□□□□ -1.57
CRNKL1-205	ENST00000496549	SVEP1	Q4LDE5	3571 aa		5.24	□□□□□ -1.57
CRNKL1-205	ENST00000496549		A0A1W2PPR1	153 aa		5.24	□□□□□ -1.57
CRNKL1-205	ENST00000496549	VPS13C	Q709C8	3753 aa		5.24	□□□□□ -1.57
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		5.23	□□□□□ -1.57
CRNKL1-205	ENST00000496549	PRR34	Q9NV39	138 aa		5.23	□□□□□ -1.57
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		5.23	□□□□□ -1.57
CRNKL1-205	ENST00000496549		A0A0G2JQZ4	141 aa		5.21	□□□□□ -1.57
CRNKL1-205	ENST00000496549		A0A1W2PNN7	141 aa		5.21	□□□□□ -1.57
CRNKL1-205	ENST00000496549	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.57
CRNKL1-205	ENST00000496549	PRLH	P81277	87 aa		5.21	□□□□□ -1.57
CRNKL1-205	ENST00000496549	SPINT4	Q6UDR6	99 aa		5.21	□□□□□ -1.58
CRNKL1-205	ENST00000496549	TNP2	Q05952	138 aa		5.21	□□□□□ -1.58
CRNKL1-205	ENST00000496549	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		5.21	□□□□□ -1.58
CRNKL1-205	ENST00000496549	MRPL34	Q9BQ48	92 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
CRNKL1-205	ENST00000496549	STAB1	Q9NY15	2570 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGLV8-61	A0A075B6I0	122 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CRNKL1-205	ENST00000496549	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
CRNKL1-205	ENST00000496549	C8orf17	Q9NRJ1	99 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CRNKL1-205	ENST00000496549	COL6A5	A8TX70	2615 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CRNKL1-205	ENST00000496549	SPATA8	Q6RVD6	105 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF469	Q96JG9	3925 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
CRNKL1-205	ENST00000496549	SMR3A	Q99954	134 aa		5.17	□□□□□ -1.58
CRNKL1-205	ENST00000496549	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		5.17	□□□□□ -1.58
CRNKL1-205	ENST00000496549	MMP24-AS1	A0A0U1RRL7	71 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CRNKL1-205	ENST00000496549	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CRNKL1-205	ENST00000496549	RTL8C	O15255	209 aa		5.15	□□□□□ -1.58
CRNKL1-205	ENST00000496549	ROMO1	P60602	79 aa		5.15	□□□□□ -1.58
CRNKL1-205	ENST00000496549	SSBP3-AS1	Q7Z2R9	100 aa		5.15	□□□□□ -1.58
CRNKL1-205	ENST00000496549	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		5.15	□□□□□ -1.58
CRNKL1-205	ENST00000496549		X6R8D5	127 aa		5.15	□□□□□ -1.58
CRNKL1-205	ENST00000496549	NF1	P21359	2839 aa		5.15	□□□□□ -1.58
CRNKL1-205	ENST00000496549	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	5.15	□□□□□ -1.58
CRNKL1-205	ENST00000496549		Q6ZR54	194 aa		5.15	□□□□□ -1.59
CRNKL1-205	ENST00000496549	C15orf56	Q8N910	161 aa		5.15	□□□□□ -1.59
CRNKL1-205	ENST00000496549		A0A0A0MQY5	61 aa		5.14	□□□□□ -1.59
CRNKL1-205	ENST00000496549	FAM168B	A1KXE4	195 aa		5.13	□□□□□ -1.59
CRNKL1-205	ENST00000496549	NBEAL1	Q6ZS30	2694 aa		5.13	□□□□□ -1.59
CRNKL1-205	ENST00000496549		A0A1B0GVX0	72 aa		5.12	□□□□□ -1.59
CRNKL1-205	ENST00000496549	SPINK1	P00995	79 aa		5.12	□□□□□ -1.59
CRNKL1-205	ENST00000496549	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		5.12	□□□□□ -1.59
CRNKL1-205	ENST00000496549	SPRR1A	P35321	89 aa		5.12	□□□□□ -1.59
CRNKL1-205	ENST00000496549	DEFB113	Q30KQ7	82 aa		5.11	□□□□□ -1.59
CRNKL1-205	ENST00000496549	LINC00472	Q9H8W2	130 aa		5.11	□□□□□ -1.59
CRNKL1-205	ENST00000496549	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CRNKL1-205	ENST00000496549	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		5.09	□□□□□ -1.6
CRNKL1-205	ENST00000496549	AKAP9	Q99996	3911 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CRNKL1-205	ENST00000496549	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CRNKL1-205	ENST00000496549	MXRA5	Q9NR99	2828 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CRNKL1-205	ENST00000496549	DMAC1	Q96GE9	116 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CRNKL1-205	ENST00000496549	FAM229A	H3BQW9	127 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CRNKL1-205	ENST00000496549	KRTAP16-1	A8MUX0	517 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CRNKL1-205	ENST00000496549	C14orf177	Q52M58	125 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CRNKL1-205	ENST00000496549	INAFM1	C9JVW0	142 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CRNKL1-205	ENST00000496549	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CRNKL1-205	ENST00000496549		H3BNG1	76 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGKV2-30	P06310	120 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CRNKL1-205	ENST00000496549	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CRNKL1-205	ENST00000496549	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGLV7-43	P04211	117 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CRNKL1-205	ENST00000496549	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF861P	O60384	105 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CRNKL1-205	ENST00000496549	CUBN	O60494	3623 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CRNKL1-205	ENST00000496549	FBN1	P35555	2871 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
CRNKL1-205	ENST00000496549	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CRNKL1-205	ENST00000496549	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CRNKL1-205	ENST00000496549	NOTCH1	P46531	2555 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CRNKL1-205	ENST00000496549	SPRR1B	P22528	89 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CRNKL1-205	ENST00000496549	TENM1	Q9UKZ4	2725 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CRNKL1-205	ENST00000496549	LY6G6C	O95867	125 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CRNKL1-205	ENST00000496549	NUPR2	A6NF83	97 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CRNKL1-205	ENST00000496549	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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