RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491233.1

COL6A3-211, Transcript of collagen type VI alpha 3 chain, humanhuman

TSL 3

Gene COL6A3, Length 652 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A3-211ENST00000491233 CFC1BP0CG36 223 aa7.28□□□□□ -1.24
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COL6A3-211ENST00000491233 LINC00575Q6W349 94 aa7.27□□□□□ -1.25
COL6A3-211ENST00000491233 Q6ZQY7 126 aa7.27□□□□□ -1.25
COL6A3-211ENST00000491233 CRCT1Q9UGL9 99 aa7.25□□□□□ -1.25
COL6A3-211ENST00000491233 hADV29S1A0JD25 119 aa7.24□□□□□ -1.25
COL6A3-211ENST00000491233 HSBP1L1C9JCN9 74 aa7.24□□□□□ -1.25
COL6A3-211ENST00000491233 HIST3H2BBQ8N257 126 aa7.24□□□□□ -1.25
COL6A3-211ENST00000491233 CLEC2BQ92478 149 aa7.24□□□□□ -1.25
COL6A3-211ENST00000491233 HIST1H2BLQ99880 126 aa7.24□□□□□ -1.25
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COL6A3-211ENST00000491233 HIST1H4GQ99525 98 aa7.16□□□□□ -1.26
COL6A3-211ENST00000491233 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
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COL6A3-211ENST00000491233 SCGB1D1O95968 90 aa7.12□□□□□ -1.27
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COL6A3-211ENST00000491233 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa7.12□□□□□ -1.27
COL6A3-211ENST00000491233 Q6Q795 121 aa7.09□□□□□ -1.27
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COL6A3-211ENST00000491233 DLEU1O43261 78 aa7.08□□□□□ -1.28
COL6A3-211ENST00000491233 CFC1P0CG37 223 aa7.08□□□□□ -1.28
COL6A3-211ENST00000491233 Q96NJ1 140 aa7.08□□□□□ -1.28
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COL6A3-211ENST00000491233 A0A0B4J2C4 111 aa7.06□□□□□ -1.28
COL6A3-211ENST00000491233 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
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COL6A3-211ENST00000491233 TEN1Q86WV5 123 aa7.05□□□□□ -1.28
COL6A3-211ENST00000491233 C14orf144Q96I85 54 aa7.05□□□□□ -1.28
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COL6A3-211ENST00000491233 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa7.04□□□□□ -1.28
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COL6A3-211ENST00000491233 A0A1B0GV72 72 aa6.94□□□□□ -1.3
COL6A3-211ENST00000491233 DNAL4O96015 105 aa6.92□□□□□ -1.3
COL6A3-211ENST00000491233 IGKV4-1P06312 121 aa6.92□□□□□ -1.3
COL6A3-211ENST00000491233 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa6.91□□□□□ -1.3
COL6A3-211ENST00000491233 ANKRD29Q8N6D5 301 aa6.91□□□□□ -1.3
COL6A3-211ENST00000491233 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.91□□□□□ -1.3
COL6A3-211ENST00000491233 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.9□□□□□ -1.3
COL6A3-211ENST00000491233 LINC00313P59037 77 aa6.9□□□□□ -1.3
COL6A3-211ENST00000491233 ORMDL1Q9P0S3 153 aa6.9□□□□□ -1.3
COL6A3-211ENST00000491233 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa6.88□□□□□ -1.31
COL6A3-211ENST00000491233 K7ERJ3 54 aa6.88□□□□□ -1.31
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COL6A3-211ENST00000491233 PSMB2P49721 201 aa6.88□□□□□ -1.31
COL6A3-211ENST00000491233 HSD52Q0P140 79 aa6.87□□□□□ -1.31
COL6A3-211ENST00000491233 DEFB116Q30KQ4 102 aa6.87□□□□□ -1.31
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COL6A3-211ENST00000491233 LINC00472Q9H8W2 130 aa6.85□□□□□ -1.31
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COL6A3-211ENST00000491233 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa6.83□□□□□ -1.32
COL6A3-211ENST00000491233 COX6CP09669 75 aa6.83□□□□□ -1.32
COL6A3-211ENST00000491233 HRES1P13985 223 aa6.83□□□□□ -1.32
COL6A3-211ENST00000491233 MT2AP02795 61 aa6.82□□□□□ -1.32
COL6A3-211ENST00000491233 MPLKIPQ8TAP9 179 aa6.82□□□□□ -1.32
COL6A3-211ENST00000491233 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa6.82□□□□□ -1.32
COL6A3-211ENST00000491233 UBE2V1Q13404 147 aa6.81□□□□□ -1.32
COL6A3-211ENST00000491233 USH2AO75445 5202 aa6.81□□□□□ -1.32
COL6A3-211ENST00000491233 VPS25Q9BRG1 176 aa6.8□□□□□ -1.32
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