RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 F8WEM9 126 aa14.83□□□□□ -0.04
HOXB3-211ENST00000490677 TCL1BO95988 128 aa14.83□□□□□ -0.04
HOXB3-211ENST00000490677 IGFL1Q6UW32 110 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXB3-211ENST00000490677 C12orf57Q99622 126 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXB3-211ENST00000490677 S100A6P06703 90 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXB3-211ENST00000490677 Q6JHZ5 121 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXB3-211ENST00000490677 CLEC2BQ92478 149 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXB3-211ENST00000490677 COX8AP10176 69 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXB3-211ENST00000490677 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXB3-211ENST00000490677 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
HOXB3-211ENST00000490677 OCIAD2Q56VL3 154 aa14.77□□□□□ -0.05
HOXB3-211ENST00000490677 HIST1H4GQ99525 98 aa14.77□□□□□ -0.05
HOXB3-211ENST00000490677 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
HOXB3-211ENST00000490677 SCGB1D1O95968 90 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXB3-211ENST00000490677 DLEU1O43261 78 aa14.74□□□□□ -0.05
HOXB3-211ENST00000490677 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXB3-211ENST00000490677 PPDPFLQ8WWR9 84 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXB3-211ENST00000490677 CFC1BP0CG36 223 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXB3-211ENST00000490677 CFC1P0CG37 223 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXB3-211ENST00000490677 H3BUT2 72 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXB3-211ENST00000490677 LORP23490 312 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
HOXB3-211ENST00000490677 C14orf144Q96I85 54 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXB3-211ENST00000490677 HIGD1BQ9P298 99 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXB3-211ENST00000490677 C2orf91Q6ZV80 131 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXB3-211ENST00000490677 FAM218AQ96MZ4 157 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXB3-211ENST00000490677 SNHG12Q9BXW3 62 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXB3-211ENST00000490677 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
HOXB3-211ENST00000490677 FSIP2Q5CZC0 6907 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXB3-211ENST00000490677 A0A0B4J2C4 111 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXB3-211ENST00000490677 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXB3-211ENST00000490677 PAM16Q9Y3D7 125 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXB3-211ENST00000490677 SPATA45Q537H7 98 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXB3-211ENST00000490677 Q6Q795 121 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXB3-211ENST00000490677 Q75L30 129 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXB3-211ENST00000490677 RAB37Q96AX2 223 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXB3-211ENST00000490677 H0YGX0 51 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXB3-211ENST00000490677 CRCT1Q9UGL9 99 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXB3-211ENST00000490677 LST1O00453 97 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXB3-211ENST00000490677 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
HOXB3-211ENST00000490677 COX6B2Q6YFQ2 88 aa14.48□□□□□ -0.09
HOXB3-211ENST00000490677 CEND1Q8N111 149 aa14.48□□□□□ -0.09
HOXB3-211ENST00000490677 TEN1Q86WV5 123 aa14.47□□□□□ -0.09
HOXB3-211ENST00000490677 VAMP8Q9BV40 100 aa14.47□□□□□ -0.09
HOXB3-211ENST00000490677 Q96NJ1 140 aa14.45□□□□□ -0.1
HOXB3-211ENST00000490677 SS18L2Q9UHA2 77 aa14.45□□□□□ -0.1
HOXB3-211ENST00000490677 FXYD2P54710 66 aa14.43□□□□□ -0.1
HOXB3-211ENST00000490677 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa14.43□□□□□ -0.1
HOXB3-211ENST00000490677 PRO1854Q9UHT4 67 aa14.43□□□□□ -0.1
HOXB3-211ENST00000490677 A0A1B0GX51 115 aa14.42□□□□□ -0.1
HOXB3-211ENST00000490677 M0R2T5 61 aa14.42□□□□□ -0.1
HOXB3-211ENST00000490677 SNCGO76070 127 aa14.42□□□□□ -0.1
HOXB3-211ENST00000490677 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa14.41□□□□□ -0.1
HOXB3-211ENST00000490677 A0A087WSZ3 146 aa14.4□□□□□ -0.1
HOXB3-211ENST00000490677 H3BMG7 143 aa14.39□□□□□ -0.11
HOXB3-211ENST00000490677 A8MUU9 505 aa14.37□□□□□ -0.11
HOXB3-211ENST00000490677 TRIAP1O43715 76 aa14.37□□□□□ -0.11
HOXB3-211ENST00000490677 A0A1W2PNM2 257 aa14.36□□□□□ -0.11
HOXB3-211ENST00000490677 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa14.35□□□□□ -0.11
HOXB3-211ENST00000490677 A6NJY4 79 aa14.35□□□□□ -0.11
HOXB3-211ENST00000490677 FABP2P12104 132 aa14.33□□□□□ -0.12
HOXB3-211ENST00000490677 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
HOXB3-211ENST00000490677 GHRHP01286 108 aa14.28□□□□□ -0.12
HOXB3-211ENST00000490677 PYY3Q5JQD4 70 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXB3-211ENST00000490677 DSCR10P59022 87 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXB3-211ENST00000490677 K7ERJ3 54 aa14.23□□□□□ -0.13
HOXB3-211ENST00000490677 HSD52Q0P140 79 aa14.22□□□□□ -0.13
HOXB3-211ENST00000490677 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa14.2□□□□□ -0.14
HOXB3-211ENST00000490677 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa14.2□□□□□ -0.14
HOXB3-211ENST00000490677 ORMDL1Q9P0S3 153 aa14.2□□□□□ -0.14
HOXB3-211ENST00000490677 ANKRD29Q8N6D5 301 aa14.18□□□□□ -0.14
HOXB3-211ENST00000490677 SIGMAR1Q99720 223 aa14.18□□□□□ -0.14
HOXB3-211ENST00000490677 A0A1B0GV72 72 aa14.16□□□□□ -0.14
HOXB3-211ENST00000490677 DNAL4O96015 105 aa14.15□□□□□ -0.14
HOXB3-211ENST00000490677 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa14.14□□□□□ -0.15
HOXB3-211ENST00000490677 IGKV4-1P06312 121 aa14.13□□□□□ -0.15
HOXB3-211ENST00000490677 PSMB2P49721 201 aa14.13□□□□□ -0.15
HOXB3-211ENST00000490677 LINC00472Q9H8W2 130 aa14.13□□□□□ -0.15
HOXB3-211ENST00000490677 H3BQ85 93 aa14.12□□□□□ -0.15
HOXB3-211ENST00000490677 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa14.11□□□□□ -0.15
HOXB3-211ENST00000490677 LINC00313P59037 77 aa14.11□□□□□ -0.15
HOXB3-211ENST00000490677 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa14.1□□□□□ -0.15
HOXB3-211ENST00000490677 CCKP06307 115 aa14.07□□□□□ -0.16
HOXB3-211ENST00000490677 COX6CP09669 75 aa14.07□□□□□ -0.16
HOXB3-211ENST00000490677 DEFB116Q30KQ4 102 aa14.07□□□□□ -0.16
HOXB3-211ENST00000490677 UBE2V1Q13404 147 aa14.06□□□□□ -0.16
HOXB3-211ENST00000490677 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa14.03□□□□□ -0.16
HOXB3-211ENST00000490677 UQCR10Q9UDW1 63 aa14.03□□□□□ -0.16
HOXB3-211ENST00000490677 TRACP01848 142 aa14.02□□□□□ -0.17
HOXB3-211ENST00000490677 MPLKIPQ8TAP9 179 aa14□□□□□ -0.17
HOXB3-211ENST00000490677 HRES1P13985 223 aa13.96□□□□□ -0.17
HOXB3-211ENST00000490677 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa13.95□□□□□ -0.18
HOXB3-211ENST00000490677 USH2AO75445 5202 aa13.95□□□□□ -0.18
HOXB3-211ENST00000490677 RBM3P98179 157 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
HOXB3-211ENST00000490677 A0A1B0GVX0 72 aa13.89□□□□□ -0.19
HOXB3-211ENST00000490677 VPS25Q9BRG1 176 aa13.88□□□□□ -0.19
HOXB3-211ENST00000490677 SCGB1C2P0DMR2 95 aa13.87□□□□□ -0.19
HOXB3-211ENST00000490677 SSPOA2VEC9 5147 aa13.87□□□□□ -0.19
HOXB3-211ENST00000490677 C8orf87E5RJ46 101 aa13.85□□□□□ -0.19
HOXB3-211ENST00000490677 MT2AP02795 61 aa13.84□□□□□ -0.19
HOXB3-211ENST00000490677 DSCR8Q96T75 97 aa13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.3 ms