RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489650.1

PTPRN-217, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRN, Length 571 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-217ENST00000489650 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
PTPRN-217ENST00000489650 A0A0B4J2C4 111 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRN-217ENST00000489650 CFC1BP0CG36 223 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRN-217ENST00000489650 VAMP3Q15836 100 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRN-217ENST00000489650 CFC1P0CG37 223 aa10□□□□□ -0.81
PTPRN-217ENST00000489650 FXYD2P54710 66 aa10□□□□□ -0.81
PTPRN-217ENST00000489650 PRO1854Q9UHT4 67 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRN-217ENST00000489650 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRN-217ENST00000489650 LORP23490 312 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
PTPRN-217ENST00000489650 LIMD2Q9BT23 127 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRN-217ENST00000489650 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
PTPRN-217ENST00000489650 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
PTPRN-217ENST00000489650 Q1RN00 199 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRN-217ENST00000489650 C6orf99Q4VX62 202 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRN-217ENST00000489650 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRN-217ENST00000489650 A0A1B0GWB2 263 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRN-217ENST00000489650 COX7BP24311 80 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRN-217ENST00000489650 SMIM11BQ8TCY0 68 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRN-217ENST00000489650 H7C2G1 150 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRN-217ENST00000489650 SNCGO76070 127 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRN-217ENST00000489650 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRN-217ENST00000489650 SPRR1BP22528 89 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRN-217ENST00000489650 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
PTPRN-217ENST00000489650 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
PTPRN-217ENST00000489650 M0R2T5 61 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRN-217ENST00000489650 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRN-217ENST00000489650 COX6CP09669 75 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRN-217ENST00000489650 H0YGX0 51 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRN-217ENST00000489650 PSMB2P49721 201 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRN-217ENST00000489650 DEFB105AQ8NG35 78 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRN-217ENST00000489650 K7ERJ3 54 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRN-217ENST00000489650 BATFQ16520 125 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRN-217ENST00000489650 CD164Q04900 197 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRN-217ENST00000489650 COX6B2Q6YFQ2 88 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRN-217ENST00000489650 A0A0G2JQZ4 141 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRN-217ENST00000489650 hADV29S1A0JD25 119 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRN-217ENST00000489650 SCGB1C2P0DMR2 95 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRN-217ENST00000489650 C1orf195Q5TG92 126 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRN-217ENST00000489650 LINC00575Q6W349 94 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRN-217ENST00000489650 A0A1B0GX51 115 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRN-217ENST00000489650 PCP4L1A6NKN8 68 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRN-217ENST00000489650 GHRHP01286 108 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRN-217ENST00000489650 RPL37P61927 97 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
PTPRN-217ENST00000489650 TRIAP1O43715 76 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRN-217ENST00000489650 LYRM7Q5U5X0 104 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRN-217ENST00000489650 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRN-217ENST00000489650 OCIAD2Q56VL3 154 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRN-217ENST00000489650 Q5XG85 94 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRN-217ENST00000489650 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
PTPRN-217ENST00000489650 SMIM29Q86T20 159 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRN-217ENST00000489650 DNAL4O96015 105 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRN-217ENST00000489650 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRN-217ENST00000489650 SNHG12Q9BXW3 62 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRN-217ENST00000489650 H3BQ85 93 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRN-217ENST00000489650 Q6ZQY7 126 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRN-217ENST00000489650 PPDPFLQ8WWR9 84 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRN-217ENST00000489650 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRN-217ENST00000489650 C9orf118A6NHY6 69 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRN-217ENST00000489650 CLEC2BQ92478 149 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRN-217ENST00000489650 H3BUT2 72 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRN-217ENST00000489650 TRACP01848 142 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRN-217ENST00000489650 ATXN8Q156A1 80 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRN-217ENST00000489650 FAM218AQ96MZ4 157 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRN-217ENST00000489650 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRN-217ENST00000489650 F8WEM9 126 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRN-217ENST00000489650 TAX1BP3O14907 124 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRN-217ENST00000489650 Q6Q795 121 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRN-217ENST00000489650 LST1O00453 97 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRN-217ENST00000489650 FABP2P12104 132 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRN-217ENST00000489650 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
PTPRN-217ENST00000489650 ORMDL1Q9P0S3 153 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRN-217ENST00000489650 TCL1BO95988 128 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRN-217ENST00000489650 A0A1W2PPM0 123 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRN-217ENST00000489650 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRN-217ENST00000489650 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRN-217ENST00000489650 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PTPRN-217ENST00000489650 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
PTPRN-217ENST00000489650 Q6JHZ5 121 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRN-217ENST00000489650 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRN-217ENST00000489650 SSPOA2VEC9 5147 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRN-217ENST00000489650 BAALC-AS2P0C853 105 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRN-217ENST00000489650 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRN-217ENST00000489650 SPCS1Q9Y6A9 102 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRN-217ENST00000489650 UBE2V1Q13404 147 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRN-217ENST00000489650 USH2AO75445 5202 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRN-217ENST00000489650 H3BMG7 143 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRN-217ENST00000489650 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRN-217ENST00000489650 Q75L30 129 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRN-217ENST00000489650 C9JAW5 83 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRN-217ENST00000489650 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRN-217ENST00000489650 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRN-217ENST00000489650 ANKRD29Q8N6D5 301 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRN-217ENST00000489650 IGFL1Q6UW32 110 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRN-217ENST00000489650 H3BT86 120 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRN-217ENST00000489650 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRN-217ENST00000489650 K7EP34 96 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRN-217ENST00000489650 Q96NJ1 140 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRN-217ENST00000489650 RBM3P98179 157 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
PTPRN-217ENST00000489650 DSCR8Q96T75 97 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRN-217ENST00000489650 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa9.42□□□□□ -0.9
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