RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489630.5

VWA3B-217, Transcript of von Willebrand factor A domain containing 3B, humanhuman

TSL 2

Gene VWA3B, Length 2,575 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3B-217ENST00000489630 DNAH10OSP0CZ25 163 aa6.51□□□□□ -1.37
VWA3B-217ENST00000489630 BAHCC1Q9P281 2608 aa6.51□□□□□ -1.37
VWA3B-217ENST00000489630 Q1T7F1 81 aa6.5□□□□□ -1.37
VWA3B-217ENST00000489630 IGFL1Q6UW32 110 aa6.5□□□□□ -1.37
VWA3B-217ENST00000489630 REG3GQ6UW15 175 aa6.49□□□□□ -1.37
VWA3B-217ENST00000489630 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
VWA3B-217ENST00000489630 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
VWA3B-217ENST00000489630 A0A087WSZ3 146 aa6.48□□□□□ -1.37
VWA3B-217ENST00000489630 PRLHP81277 87 aa6.48□□□□□ -1.37
VWA3B-217ENST00000489630 TRAV22A0A0B4J277 110 aa6.47□□□□□ -1.37
VWA3B-217ENST00000489630 A8MUN3 132 aa6.47□□□□□ -1.37
VWA3B-217ENST00000489630 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa6.47□□□□□ -1.37
VWA3B-217ENST00000489630 ANK2Q01484 3957 aa6.45□□□□□ -1.38
VWA3B-217ENST00000489630 LCA10Q71F78 164 aa6.45□□□□□ -1.38
VWA3B-217ENST00000489630 LINC00208Q96KT6 92 aa6.45□□□□□ -1.38
VWA3B-217ENST00000489630 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
VWA3B-217ENST00000489630 MP68P56378 58 aa6.44□□□□□ -1.38
VWA3B-217ENST00000489630 DNAH1Q9P2D7 4330 aa6.43□□□□□ -1.38
VWA3B-217ENST00000489630 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa6.43□□□□□ -1.38
VWA3B-217ENST00000489630 NDUFB1O75438 58 aa6.42□□□□□ -1.38
VWA3B-217ENST00000489630 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
VWA3B-217ENST00000489630 A0A096LNI7 61 aa6.41□□□□□ -1.38
VWA3B-217ENST00000489630 A8MU10 97 aa6.41□□□□□ -1.38
VWA3B-217ENST00000489630 MDFIQ99750 246 aa6.41□□□□□ -1.38
VWA3B-217ENST00000489630 B9D2Q9BPU9 175 aa6.41□□□□□ -1.38
VWA3B-217ENST00000489630 H0Y9P7 68 aa6.4□□□□□ -1.38
VWA3B-217ENST00000489630 UBE2AP49459 152 aa6.4□□□□□ -1.38
VWA3B-217ENST00000489630 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.4□□□□□ -1.38
VWA3B-217ENST00000489630 MAST4O15021 2626 aa6.4□□□□□ -1.38
VWA3B-217ENST00000489630 CASC2Q6XLA1 102 aa6.4□□□□□ -1.39
VWA3B-217ENST00000489630 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa6.39□□□□□ -1.39
VWA3B-217ENST00000489630 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
VWA3B-217ENST00000489630 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
VWA3B-217ENST00000489630 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa6.38□□□□□ -1.39
VWA3B-217ENST00000489630 A6NN06 94 aa6.37□□□□□ -1.39
VWA3B-217ENST00000489630 Q5VV11 94 aa6.37□□□□□ -1.39
VWA3B-217ENST00000489630 NOTCH1P46531 2555 aa6.37□□□□□ -1.39
VWA3B-217ENST00000489630 A0A0A0MQY5 61 aa6.36□□□□□ -1.39
VWA3B-217ENST00000489630 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa6.36□□□□□ -1.39
VWA3B-217ENST00000489630 C16orf90A8MZG2 172 aa6.35□□□□□ -1.39
VWA3B-217ENST00000489630 CHTF8P0CG12 524 aa6.35□□□□□ -1.39
VWA3B-217ENST00000489630 STAB1Q9NY15 2570 aa6.35□□□□□ -1.39
VWA3B-217ENST00000489630 A8MWP4 228 aa6.34□□□□□ -1.39
VWA3B-217ENST00000489630 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.34□□□□□ -1.39
VWA3B-217ENST00000489630 LINC00472Q9H8W2 130 aa6.34□□□□□ -1.39
VWA3B-217ENST00000489630 DNAH10Q8IVF4 4471 aa6.34□□□□□ -1.39
VWA3B-217ENST00000489630 LINC00313P59037 77 aa6.34□□□□□ -1.39
VWA3B-217ENST00000489630 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
VWA3B-217ENST00000489630 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.34□□□□□ -1.39
VWA3B-217ENST00000489630 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.33□□□□□ -1.4
VWA3B-217ENST00000489630 PRR15LQ9BU68 103 aa6.33□□□□□ -1.4
VWA3B-217ENST00000489630 H0Y9J4 135 aa6.32□□□□□ -1.4
VWA3B-217ENST00000489630 C9orf163Q8N9P6 203 aa6.32□□□□□ -1.4
VWA3B-217ENST00000489630 H3BPC8 53 aa6.31□□□□□ -1.4
VWA3B-217ENST00000489630 CMYA5Q8N3K9 4069 aa6.31□□□□□ -1.4
VWA3B-217ENST00000489630 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.31□□□□□ -1.4
VWA3B-217ENST00000489630 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
VWA3B-217ENST00000489630 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa6.3□□□□□ -1.4
VWA3B-217ENST00000489630 LINC01554Q52M75 96 aa6.3□□□□□ -1.4
VWA3B-217ENST00000489630 COL6A5A8TX70 2615 aa6.29□□□□□ -1.4
VWA3B-217ENST00000489630 SPRR1BP22528 89 aa6.29□□□□□ -1.4
VWA3B-217ENST00000489630 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa6.29□□□□□ -1.4
VWA3B-217ENST00000489630 PCOTHQ58A44 107 aa6.29□□□□□ -1.4
VWA3B-217ENST00000489630 COA5Q86WW8 74 aa6.29□□□□□ -1.4
VWA3B-217ENST00000489630 LIMD2Q9BT23 127 aa6.29□□□□□ -1.4
VWA3B-217ENST00000489630 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa6.28□□□□□ -1.4
VWA3B-217ENST00000489630 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
VWA3B-217ENST00000489630 LYSTQ99698 3801 aa6.27□□□□□ -1.41
VWA3B-217ENST00000489630 CSMD3Q7Z407 3707 aa6.27□□□□□ -1.41
VWA3B-217ENST00000489630 DNAH3Q8TD57 4116 aa6.26□□□□□ -1.41
VWA3B-217ENST00000489630 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.25□□□□□ -1.41
VWA3B-217ENST00000489630 DNAH9Q9NYC9 4486 aa6.25□□□□□ -1.41
VWA3B-217ENST00000489630 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.24□□□□□ -1.41
VWA3B-217ENST00000489630 A6NED7 52 aa6.23□□□□□ -1.41
VWA3B-217ENST00000489630 PANO1I0J062 215 aa6.23□□□□□ -1.41
VWA3B-217ENST00000489630 Q96NJ1 140 aa6.23□□□□□ -1.41
VWA3B-217ENST00000489630 Q75L30 129 aa6.23□□□□□ -1.41
VWA3B-217ENST00000489630 TENM2Q9NT68 2774 aa6.22□□□□□ -1.41
VWA3B-217ENST00000489630 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa6.21□□□□□ -1.42
VWA3B-217ENST00000489630 SPAG11AQ6PDA7 123 aa6.21□□□□□ -1.42
VWA3B-217ENST00000489630 K7EIL1 84 aa6.2□□□□□ -1.42
VWA3B-217ENST00000489630 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa6.2□□□□□ -1.42
VWA3B-217ENST00000489630 COL7A1Q02388 2944 aa6.2□□□□□ -1.42
VWA3B-217ENST00000489630 STAB2Q8WWQ8 2551 aa6.2□□□□□ -1.42
VWA3B-217ENST00000489630 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.2□□□□□ -1.42
VWA3B-217ENST00000489630 C8orf17Q9NRJ1 99 aa6.2□□□□□ -1.42
VWA3B-217ENST00000489630 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.19□□□□□ -1.42
VWA3B-217ENST00000489630 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa6.19□□□□□ -1.42
VWA3B-217ENST00000489630 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
VWA3B-217ENST00000489630 MOBPQ13875 183 aa6.18□□□□□ -1.42
VWA3B-217ENST00000489630 C14orf177Q52M58 125 aa6.18□□□□□ -1.42
VWA3B-217ENST00000489630 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa6.17□□□□□ -1.42
VWA3B-217ENST00000489630 Q6ZR54 194 aa6.17□□□□□ -1.42
VWA3B-217ENST00000489630 A0A087X002 238 aa6.16□□□□□ -1.42
VWA3B-217ENST00000489630 HRES1P13985 223 aa6.16□□□□□ -1.42
VWA3B-217ENST00000489630 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa6.16□□□□□ -1.42
VWA3B-217ENST00000489630 A0A1B0GVX0 72 aa6.15□□□□□ -1.42
VWA3B-217ENST00000489630 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.15□□□□□ -1.42
VWA3B-217ENST00000489630 ANAPC11Q9NYG5 84 aa6.15□□□□□ -1.42
VWA3B-217ENST00000489630 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.15□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.7 ms