RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487548.2

SENP6-210, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 2

Gene SENP6, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-210ENST00000487548 VPS13CQ709C8 3753 aa-1.38□□□□□ -2.63
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SENP6-210ENST00000487548 D6R8Y8 96 aa-1.39□□□□□ -2.63
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SENP6-210ENST00000487548 CCDC58Q4VC31 144 aa-1.39□□□□□ -2.63
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SENP6-210ENST00000487548 MEIG1Q5JSS6 88 aa-1.44□□□□□ -2.64
SENP6-210ENST00000487548 MINOS1Q5TGZ0 78 aa-1.44□□□□□ -2.64
SENP6-210ENST00000487548 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP-1.44□□□□□ -2.64
SENP6-210ENST00000487548 DPH3P1Q9H4G8 78 aa-1.44□□□□□ -2.64
SENP6-210ENST00000487548 SZT2Q5T011 3432 aa-1.44□□□□□ -2.64
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SENP6-210ENST00000487548 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa-1.44□□□□□ -2.64
SENP6-210ENST00000487548 EP400Q96L91 3159 aa-1.45□□□□□ -2.64
SENP6-210ENST00000487548 CHD1O14646 1710 aa-1.45□□□□□ -2.64
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SENP6-210ENST00000487548 ARPC4P59998 168 aa-1.45□□□□□ -2.64
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SENP6-210ENST00000487548 TRAV21A0A0B4J279 112 aa-1.46□□□□□ -2.64
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SENP6-210ENST00000487548 ATP10BO94823 1461 aa-1.46□□□□□ -2.64
SENP6-210ENST00000487548 CD163L1Q9NR16 1453 aa-1.46□□□□□ -2.64
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SENP6-210ENST00000487548 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP-1.47□□□□□ -2.64
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SENP6-210ENST00000487548 DPY30Q9C005 99 aa-1.47□□□□□ -2.64
SENP6-210ENST00000487548 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa-1.47□□□□□ -2.64
SENP6-210ENST00000487548 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP-1.47□□□□□ -2.65
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SENP6-210ENST00000487548 SARNPP82979 210 aaKnown RBP-1.48□□□□□ -2.65
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