RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486889.1

CTPS1-210, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTPS1, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-210ENST00000486889 LINC00483Q53H64 154 aa5.86□□□□□ -1.47
CTPS1-210ENST00000486889 C9orf153Q5TBE3 101 aa5.86□□□□□ -1.47
CTPS1-210ENST00000486889 TYMSOSQ8TAI1 123 aa5.86□□□□□ -1.47
CTPS1-210ENST00000486889 LINC01600Q96MT4 127 aa5.86□□□□□ -1.47
CTPS1-210ENST00000486889 SPRR1BP22528 89 aa5.85□□□□□ -1.47
CTPS1-210ENST00000486889 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa5.85□□□□□ -1.47
CTPS1-210ENST00000486889 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
CTPS1-210ENST00000486889 SPCS1Q9Y6A9 102 aa5.85□□□□□ -1.47
CTPS1-210ENST00000486889 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa5.84□□□□□ -1.47
CTPS1-210ENST00000486889 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa5.84□□□□□ -1.47
CTPS1-210ENST00000486889 APOBP04114 4563 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
CTPS1-210ENST00000486889 TCL1BO95988 128 aa5.83□□□□□ -1.48
CTPS1-210ENST00000486889 Q8NBF4 154 aa5.83□□□□□ -1.48
CTPS1-210ENST00000486889 FAM218AQ96MZ4 157 aa5.83□□□□□ -1.48
CTPS1-210ENST00000486889 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
CTPS1-210ENST00000486889 BAALC-AS2P0C853 105 aa5.82□□□□□ -1.48
CTPS1-210ENST00000486889 UBE2V1Q13404 147 aa5.82□□□□□ -1.48
CTPS1-210ENST00000486889 Q6JHZ5 121 aa5.82□□□□□ -1.48
CTPS1-210ENST00000486889 SPAG11AQ6PDA7 123 aa5.82□□□□□ -1.48
CTPS1-210ENST00000486889 DNAH8Q96JB1 4490 aa5.81□□□□□ -1.48
CTPS1-210ENST00000486889 C9JAW5 83 aa5.81□□□□□ -1.48
CTPS1-210ENST00000486889 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa5.81□□□□□ -1.48
CTPS1-210ENST00000486889 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa5.81□□□□□ -1.48
CTPS1-210ENST00000486889 Q8N377 158 aa5.81□□□□□ -1.48
CTPS1-210ENST00000486889 H3BT86 120 aa5.8□□□□□ -1.48
CTPS1-210ENST00000486889 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
CTPS1-210ENST00000486889 MOBPQ13875 183 aa5.8□□□□□ -1.48
CTPS1-210ENST00000486889 PRR26Q8N8Z3 221 aa5.8□□□□□ -1.48
CTPS1-210ENST00000486889 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
CTPS1-210ENST00000486889 H3BMG7 143 aa5.79□□□□□ -1.48
CTPS1-210ENST00000486889 ANKRD29Q8N6D5 301 aa5.79□□□□□ -1.48
CTPS1-210ENST00000486889 DSCR8Q96T75 97 aa5.79□□□□□ -1.48
CTPS1-210ENST00000486889 ANAPC11Q9NYG5 84 aa5.79□□□□□ -1.48
CTPS1-210ENST00000486889 K7EP34 96 aa5.78□□□□□ -1.48
CTPS1-210ENST00000486889 A0A087X002 238 aa5.77□□□□□ -1.49
CTPS1-210ENST00000486889 PDE6GP18545 87 aa5.77□□□□□ -1.49
CTPS1-210ENST00000486889 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
CTPS1-210ENST00000486889 RBM3P98179 157 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
CTPS1-210ENST00000486889 LINC00304Q8N9R0 145 aa5.77□□□□□ -1.49
CTPS1-210ENST00000486889 F8W1H4 67 aa5.76□□□□□ -1.49
CTPS1-210ENST00000486889 SPINK1P00995 79 aa5.76□□□□□ -1.49
CTPS1-210ENST00000486889 C3orf22Q8N5N4 141 aa5.76□□□□□ -1.49
CTPS1-210ENST00000486889 LIMD2Q9BT23 127 aa5.76□□□□□ -1.49
CTPS1-210ENST00000486889 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa5.75□□□□□ -1.49
CTPS1-210ENST00000486889 CD164Q04900 197 aa5.75□□□□□ -1.49
CTPS1-210ENST00000486889 SMIM29Q86T20 159 aa5.75□□□□□ -1.49
CTPS1-210ENST00000486889 KRTAP10-8P60410 259 aa5.74□□□□□ -1.49
CTPS1-210ENST00000486889 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa5.74□□□□□ -1.49
CTPS1-210ENST00000486889 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa5.74□□□□□ -1.49
CTPS1-210ENST00000486889 RPS29P62273 56 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
CTPS1-210ENST00000486889 TEN1Q86WV5 123 aa5.72□□□□□ -1.49
CTPS1-210ENST00000486889 SS18L2Q9UHA2 77 aa5.72□□□□□ -1.49
CTPS1-210ENST00000486889 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
CTPS1-210ENST00000486889 A0A1B0GW54 56 aa5.7□□□□□ -1.5
CTPS1-210ENST00000486889 IGFL1Q6UW32 110 aa5.7□□□□□ -1.5
CTPS1-210ENST00000486889 FAT1Q14517 4588 aa5.7□□□□□ -1.5
CTPS1-210ENST00000486889 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
CTPS1-210ENST00000486889 A0A1B0GV72 72 aa5.69□□□□□ -1.5
CTPS1-210ENST00000486889 CCKP06307 115 aa5.69□□□□□ -1.5
CTPS1-210ENST00000486889 HRCT1Q6UXD1 115 aa5.69□□□□□ -1.5
CTPS1-210ENST00000486889 VPS25Q9BRG1 176 aa5.69□□□□□ -1.5
CTPS1-210ENST00000486889 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa5.68□□□□□ -1.5
CTPS1-210ENST00000486889 Q6Q795 121 aa5.68□□□□□ -1.5
CTPS1-210ENST00000486889 MTURNQ8N3F0 131 aa5.68□□□□□ -1.5
CTPS1-210ENST00000486889 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa5.67□□□□□ -1.5
CTPS1-210ENST00000486889 MT1HL1P0DM35 61 aa5.67□□□□□ -1.5
CTPS1-210ENST00000486889 HERC1Q15751 4861 aa5.66□□□□□ -1.5
CTPS1-210ENST00000486889 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa5.66□□□□□ -1.5
CTPS1-210ENST00000486889 A0A1B0GV90 55 aa5.66□□□□□ -1.5
CTPS1-210ENST00000486889 C14orf132Q9NPU4 83 aa5.66□□□□□ -1.5
CTPS1-210ENST00000486889 Q5XG85 94 aa5.64□□□□□ -1.51
CTPS1-210ENST00000486889 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa5.64□□□□□ -1.51
CTPS1-210ENST00000486889 Q6ZQT0 140 aa5.63□□□□□ -1.51
CTPS1-210ENST00000486889 PRO0461Q9UI25 63 aa5.63□□□□□ -1.51
CTPS1-210ENST00000486889 A0A087WSZ3 146 aa5.62□□□□□ -1.51
CTPS1-210ENST00000486889 J3QR89 54 aa5.62□□□□□ -1.51
CTPS1-210ENST00000486889 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
CTPS1-210ENST00000486889 MYCBP2O75592 4640 aa5.61□□□□□ -1.51
CTPS1-210ENST00000486889 ETDBQ3ZM63 59 aa5.61□□□□□ -1.51
CTPS1-210ENST00000486889 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa5.61□□□□□ -1.51
CTPS1-210ENST00000486889 A0A1W2PNM2 257 aa5.6□□□□□ -1.51
CTPS1-210ENST00000486889 PRR4Q16378 134 aa5.6□□□□□ -1.51
CTPS1-210ENST00000486889 A0A0G2JQZ4 141 aa5.59□□□□□ -1.51
CTPS1-210ENST00000486889 J3KT08 172 aa5.59□□□□□ -1.51
CTPS1-210ENST00000486889 ACYP1P07311 99 aa5.59□□□□□ -1.51
CTPS1-210ENST00000486889 NREPQ16612 68 aa5.59□□□□□ -1.51
CTPS1-210ENST00000486889 UBL5Q9BZL1 73 aa5.59□□□□□ -1.51
CTPS1-210ENST00000486889 NDUFB1O75438 58 aa5.56□□□□□ -1.52
CTPS1-210ENST00000486889 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa5.55□□□□□ -1.52
CTPS1-210ENST00000486889 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa5.55□□□□□ -1.52
CTPS1-210ENST00000486889 SIGMAR1Q99720 223 aa5.54□□□□□ -1.52
CTPS1-210ENST00000486889 RETNLBQ9BQ08 111 aa5.54□□□□□ -1.52
CTPS1-210ENST00000486889 IGKV4-1P06312 121 aa5.53□□□□□ -1.52
CTPS1-210ENST00000486889 C1orf195Q5TG92 126 aa5.53□□□□□ -1.52
CTPS1-210ENST00000486889 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa5.52□□□□□ -1.53
CTPS1-210ENST00000486889 BPY2O14599 106 aa5.51□□□□□ -1.53
CTPS1-210ENST00000486889 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
CTPS1-210ENST00000486889 K7ERU9 68 aa5.49□□□□□ -1.53
CTPS1-210ENST00000486889 TPRXLQ17RH7 258 aa5.49□□□□□ -1.53
CTPS1-210ENST00000486889 LINC00472Q9H8W2 130 aa5.49□□□□□ -1.53
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