RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRD-211ENST00000486161 FAM30AQ9NZY2 134 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRD-211ENST00000486161 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRD-211ENST00000486161 Q8N9L7 120 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRD-211ENST00000486161 CDIP1Q9H305 208 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRD-211ENST00000486161 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRD-211ENST00000486161 CSMD1Q96PZ7 3565 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRD-211ENST00000486161 TRAV7A0A075B6U4 112 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRD-211ENST00000486161 FAM229BQ4G0N7 80 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-211ENST00000486161 hDV103S1A0JD37 113 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-211ENST00000486161 LINC00313P59037 77 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-211ENST00000486161 NDUFC1O43677 76 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRD-211ENST00000486161 SPINK1P00995 79 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRD-211ENST00000486161 ZFHX3Q15911 3703 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRD-211ENST00000486161 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
PTPRD-211ENST00000486161 COX7CP15954 63 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRD-211ENST00000486161 A8MWP4 228 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRD-211ENST00000486161 C8orf87E5RJ46 101 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRD-211ENST00000486161 VWFP04275 2813 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRD-211ENST00000486161 LINC00208Q96KT6 92 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRD-211ENST00000486161 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRD-211ENST00000486161 PRR4Q16378 134 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-211ENST00000486161 A0A0G2JQZ4 141 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-211ENST00000486161 PANO1I0J062 215 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-211ENST00000486161 TENM3Q9P273 2699 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-211ENST00000486161 A0A1W2PNM2 257 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-211ENST00000486161 CD164Q04900 197 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRD-211ENST00000486161 C5orf47Q569G3 176 aa5.08□□□□□ -1.6
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PTPRD-211ENST00000486161 TMEM258P61165 79 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRD-211ENST00000486161 LINC01600Q96MT4 127 aa5.08□□□□□ -1.6
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PTPRD-211ENST00000486161 SPRR1BP22528 89 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRD-211ENST00000486161 SMIM29Q86T20 159 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRD-211ENST00000486161 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRD-211ENST00000486161 RETNLBQ9BQ08 111 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRD-211ENST00000486161 H0Y9P7 68 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRD-211ENST00000486161 PRR26Q8N8Z3 221 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRD-211ENST00000486161 Q5VSD8 79 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRD-211ENST00000486161 Q96NJ1 140 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRD-211ENST00000486161 K7EQZ3 153 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-211ENST00000486161 PRR15Q8IV56 129 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-211ENST00000486161 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRD-211ENST00000486161 A0A1B0GVX0 72 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRD-211ENST00000486161 FAM236CP0DP71 79 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRD-211ENST00000486161 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRD-211ENST00000486161 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM254Q8TBM7 123 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRD-211ENST00000486161 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
PTPRD-211ENST00000486161 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa5.03□□□□□ -1.6
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PTPRD-211ENST00000486161 IGKV2-30P06310 120 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRD-211ENST00000486161 C8orf17Q9NRJ1 99 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRD-211ENST00000486161 C1orf64Q8NEQ6 169 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRD-211ENST00000486161 V9GYY9 64 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRD-211ENST00000486161 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa5.02□□□□□ -1.61
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PTPRD-211ENST00000486161 C9orf92A6NGG3 77 aa4.98□□□□□ -1.61
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PTPRD-211ENST00000486161 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa4.96□□□□□ -1.62
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PTPRD-211ENST00000486161 Q6ZSA8 131 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRD-211ENST00000486161 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRD-211ENST00000486161 C7orf65Q6ZTY9 151 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRD-211ENST00000486161 A0A087X002 238 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRD-211ENST00000486161 PRR15LQ9BU68 103 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRD-211ENST00000486161 SERP1Q9Y6X1 66 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRD-211ENST00000486161 TGP01266 2768 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRD-211ENST00000486161 LINC00472Q9H8W2 130 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRD-211ENST00000486161 Q8N1X5 172 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRD-211ENST00000486161 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRD-211ENST00000486161 ACYP2P14621 99 aa4.88□□□□□ -1.63
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PTPRD-211ENST00000486161 MPLKIPQ8TAP9 179 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-211ENST00000486161 OXTP01178 125 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-211ENST00000486161 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-211ENST00000486161 FBN3Q75N90 2809 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-211ENST00000486161 COX6B2Q6YFQ2 88 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-211ENST00000486161 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-211ENST00000486161 AKAP9Q99996 3911 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRD-211ENST00000486161 RPS29P62273 56 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.64
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-211ENST00000486161 SMIM26A0A096LP01 95 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-211ENST00000486161 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-211ENST00000486161 KLKP1Q107X0 134 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-211ENST00000486161 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-211ENST00000486161 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
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