RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482558.5

SNX13-208, Transcript of sorting nexin 13, human

TSL 2

Gene SNX13, Length 1,139 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNX13-208	ENST00000482558		Q6ZQY7	126 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNX13-208	ENST00000482558	CAMK2N1	Q7Z7J9	78 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNX13-208	ENST00000482558	ATOX1	O00244	68 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNX13-208	ENST00000482558	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNX13-208	ENST00000482558	B9D2	Q9BPU9	175 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNX13-208	ENST00000482558	LINC00846	Q9NV44	126 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNX13-208	ENST00000482558	ZNF706	Q9Y5V0	76 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNX13-208	ENST00000482558	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNX13-208	ENST00000482558	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNX13-208	ENST00000482558		Q6ZQT0	140 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX13-208	ENST00000482558	COL6A5	A8TX70	2615 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNX13-208	ENST00000482558	FAM236A	A0A1B0GUQ0	79 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNX13-208	ENST00000482558	FAM236B	A0A1B0GV22	79 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNX13-208	ENST00000482558	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SNX13-208	ENST00000482558	FBN1	P35555	2871 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SNX13-208	ENST00000482558	ANK2	Q01484	3957 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNX13-208	ENST00000482558	TRBV7-4	A0A0J9YYF1	115 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNX13-208	ENST00000482558	NUPR2	A6NF83	97 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNX13-208	ENST00000482558	BCE1	O60756	84 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNX13-208	ENST00000482558	HIST1H4A	P62805	103 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNX13-208	ENST00000482558	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNX13-208	ENST00000482558	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNX13-208	ENST00000482558	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNX13-208	ENST00000482558	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNX13-208	ENST00000482558	ETDC	A0A1B0GVM5	59 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNX13-208	ENST00000482558		J3KT08	172 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNX13-208	ENST00000482558	UQCRQ	O14949	82 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNX13-208	ENST00000482558	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNX13-208	ENST00000482558	SPRR1A	P35321	89 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNX13-208	ENST00000482558		Q8N377	158 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNX13-208	ENST00000482558	APLN	Q9ULZ1	77 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNX13-208	ENST00000482558	PSCA	O43653	123 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNX13-208	ENST00000482558		Q6ZRX8	168 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNX13-208	ENST00000482558	NOTCH1	P46531	2555 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNX13-208	ENST00000482558	TENM3	Q9P273	2699 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SNX13-208	ENST00000482558	KRTAP16-1	A8MUX0	517 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNX13-208	ENST00000482558	C16orf90	A8MZG2	172 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNX13-208	ENST00000482558	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNX13-208	ENST00000482558	LINC00313	P59037	77 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNX13-208	ENST00000482558	C3orf22	Q8N5N4	141 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNX13-208	ENST00000482558	NBEAL1	Q6ZS30	2694 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNX13-208	ENST00000482558	IGLV5-48	A0A075B6I7	105 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNX13-208	ENST00000482558	IGKV3D-7	A0A0C4DH55	119 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNX13-208	ENST00000482558	COX7C	P15954	63 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNX13-208	ENST00000482558	UBE2A	P49459	152 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNX13-208	ENST00000482558	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SNX13-208	ENST00000482558	MT3	P25713	68 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNX13-208	ENST00000482558	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
SNX13-208	ENST00000482558	SERP2	Q8N6R1	65 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNX13-208	ENST00000482558	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNX13-208	ENST00000482558	CCDC179	H3BU77	68 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNX13-208	ENST00000482558	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNX13-208	ENST00000482558	CRYGA	P11844	174 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNX13-208	ENST00000482558	HAMP	P81172	84 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNX13-208	ENST00000482558	C9orf153	Q5TBE3	101 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNX13-208	ENST00000482558		F8WEM9	126 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNX13-208	ENST00000482558	UBE2B	P63146	152 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNX13-208	ENST00000482558	NREP	Q16612	68 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNX13-208	ENST00000482558	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNX13-208	ENST00000482558	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNX13-208	ENST00000482558	FAM168B	A1KXE4	195 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNX13-208	ENST00000482558		A8MUN3	132 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNX13-208	ENST00000482558		Q9BRP9	147 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNX13-208	ENST00000482558	DYNC2H1	Q8NCM8	4307 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SNX13-208	ENST00000482558		A0A096LNI7	61 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNX13-208	ENST00000482558	DEFB105A	Q8NG35	78 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNX13-208	ENST00000482558	C8orf17	Q9NRJ1	99 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNX13-208	ENST00000482558	TRAV7	A0A075B6U4	112 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNX13-208	ENST00000482558	C1orf137	Q5JT78	98 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNX13-208	ENST00000482558	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNX13-208	ENST00000482558	SPRR4	Q96PI1	79 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNX13-208	ENST00000482558	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNX13-208	ENST00000482558		A0A087WVE0	104 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNX13-208	ENST00000482558	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNX13-208	ENST00000482558	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNX13-208	ENST00000482558	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNX13-208	ENST00000482558	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNX13-208	ENST00000482558	BPY2	O14599	106 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNX13-208	ENST00000482558	SPRR1B	P22528	89 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNX13-208	ENST00000482558		A0A1W2PNN7	141 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SNX13-208	ENST00000482558		M0R2N4	97 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SNX13-208	ENST00000482558	ERC2-IT1	O76042	136 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SNX13-208	ENST00000482558	TMEM258	P61165	79 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SNX13-208	ENST00000482558		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SNX13-208	ENST00000482558	SCX	Q7RTU7	201 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SNX13-208	ENST00000482558	IGLV2-33	A0A075B6J2	118 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SNX13-208	ENST00000482558	NDUFAF8	A1L188	74 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SNX13-208	ENST00000482558		A0A1B0GVX0	72 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNX13-208	ENST00000482558	NDUFC1	O43677	76 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNX13-208	ENST00000482558	KRTAP5-9	P26371	169 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNX13-208	ENST00000482558	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SNX13-208	ENST00000482558	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNX13-208	ENST00000482558	ST20-AS1	Q8NBB2	130 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SNX13-208	ENST00000482558		A0A1W2PNM2	257 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNX13-208	ENST00000482558	LUZP6	Q538Z0	58 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SNX13-208	ENST00000482558		A0A087WTM6	91 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNX13-208	ENST00000482558	C3orf84	H3BNL1	204 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNX13-208	ENST00000482558	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNX13-208	ENST00000482558	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SNX13-208	ENST00000482558	DPH3	Q96FX2	82 aa		4.74	□□□□□ -1.65

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