RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473778.5

C9orf3-214, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf3, Length 2,396 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-214ENST00000473778 A0A1W2PNN7 141 aa6.97□□□□□ -1.29
C9orf3-214ENST00000473778 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa6.97□□□□□ -1.29
C9orf3-214ENST00000473778 TENM2Q9NT68 2774 aa6.97□□□□□ -1.29
C9orf3-214ENST00000473778 Q1T7F1 81 aa6.97□□□□□ -1.29
C9orf3-214ENST00000473778 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
C9orf3-214ENST00000473778 OCR1Q9BZK8 76 aa6.97□□□□□ -1.29
C9orf3-214ENST00000473778 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa6.96□□□□□ -1.29
C9orf3-214ENST00000473778 hDV103S1A0JD37 113 aa6.96□□□□□ -1.29
C9orf3-214ENST00000473778 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.96□□□□□ -1.29
C9orf3-214ENST00000473778 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.96□□□□□ -1.29
C9orf3-214ENST00000473778 C1orf137Q5JT78 98 aa6.96□□□□□ -1.3
C9orf3-214ENST00000473778 MGAM2Q2M2H8 2515 aa6.95□□□□□ -1.3
C9orf3-214ENST00000473778 LRCOL1A6NCL2 159 aa6.95□□□□□ -1.3
C9orf3-214ENST00000473778 SMIM29Q86T20 159 aa6.94□□□□□ -1.3
C9orf3-214ENST00000473778 K7EIL1 84 aa6.94□□□□□ -1.3
C9orf3-214ENST00000473778 Q8NBF4 154 aa6.93□□□□□ -1.3
C9orf3-214ENST00000473778 FAM229AH3BQW9 127 aa6.93□□□□□ -1.3
C9orf3-214ENST00000473778 UBE2BP63146 152 aa6.93□□□□□ -1.3
C9orf3-214ENST00000473778 SPRR4Q96PI1 79 aa6.92□□□□□ -1.3
C9orf3-214ENST00000473778 A0A096LNI7 61 aa6.91□□□□□ -1.3
C9orf3-214ENST00000473778 PSPHP1O15172 72 aa6.91□□□□□ -1.3
C9orf3-214ENST00000473778 DSCR10P59022 87 aa6.91□□□□□ -1.3
C9orf3-214ENST00000473778 REG3GQ6UW15 175 aa6.91□□□□□ -1.3
C9orf3-214ENST00000473778 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.9□□□□□ -1.3
C9orf3-214ENST00000473778 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa6.9□□□□□ -1.31
C9orf3-214ENST00000473778 PRLHP81277 87 aa6.9□□□□□ -1.31
C9orf3-214ENST00000473778 K7EQZ3 153 aa6.89□□□□□ -1.31
C9orf3-214ENST00000473778 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa6.89□□□□□ -1.31
C9orf3-214ENST00000473778 FAM30AQ9NZY2 134 aa6.89□□□□□ -1.31
C9orf3-214ENST00000473778 TRAV22A0A0B4J277 110 aa6.89□□□□□ -1.31
C9orf3-214ENST00000473778 LINC00476Q8WZB0 136 aa6.89□□□□□ -1.31
C9orf3-214ENST00000473778 IGFL1Q6UW32 110 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf3-214ENST00000473778 A0A1B0GW54 56 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf3-214ENST00000473778 DEFB116Q30KQ4 102 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf3-214ENST00000473778 FBN3Q75N90 2809 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf3-214ENST00000473778 C16orf90A8MZG2 172 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf3-214ENST00000473778 CHTF8P0CG12 524 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf3-214ENST00000473778 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
C9orf3-214ENST00000473778 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
C9orf3-214ENST00000473778 LCE6AA0A183 80 aa6.83□□□□□ -1.32
C9orf3-214ENST00000473778 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
C9orf3-214ENST00000473778 A8MUN3 132 aa6.83□□□□□ -1.32
C9orf3-214ENST00000473778 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
C9orf3-214ENST00000473778 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa6.82□□□□□ -1.32
C9orf3-214ENST00000473778 PSCAO43653 123 aa6.82□□□□□ -1.32
C9orf3-214ENST00000473778 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
C9orf3-214ENST00000473778 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa6.81□□□□□ -1.32
C9orf3-214ENST00000473778 A0A087WSZ3 146 aa6.81□□□□□ -1.32
C9orf3-214ENST00000473778 A8MU10 97 aa6.81□□□□□ -1.32
C9orf3-214ENST00000473778 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
C9orf3-214ENST00000473778 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa6.8□□□□□ -1.32
C9orf3-214ENST00000473778 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa6.79□□□□□ -1.32
C9orf3-214ENST00000473778 PANO1I0J062 215 aa6.79□□□□□ -1.32
C9orf3-214ENST00000473778 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
C9orf3-214ENST00000473778 PRR4Q16378 134 aa6.79□□□□□ -1.32
C9orf3-214ENST00000473778 Q5VV11 94 aa6.79□□□□□ -1.32
C9orf3-214ENST00000473778 APLNQ9ULZ1 77 aa6.79□□□□□ -1.32
C9orf3-214ENST00000473778 HCG22E2RYF7 251 aa6.78□□□□□ -1.32
C9orf3-214ENST00000473778 UBE2AP49459 152 aa6.78□□□□□ -1.32
C9orf3-214ENST00000473778 WFDC13Q8IUB5 93 aa6.76□□□□□ -1.33
C9orf3-214ENST00000473778 STARD9Q9P2P6 4700 aa6.76□□□□□ -1.33
C9orf3-214ENST00000473778 FRAS1Q86XX4 4008 aa6.75□□□□□ -1.33
C9orf3-214ENST00000473778 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.75□□□□□ -1.33
C9orf3-214ENST00000473778 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa6.75□□□□□ -1.33
C9orf3-214ENST00000473778 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.74□□□□□ -1.33
C9orf3-214ENST00000473778 NDUFS5O43920 106 aa6.74□□□□□ -1.33
C9orf3-214ENST00000473778 C9orf163Q8N9P6 203 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf3-214ENST00000473778 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
C9orf3-214ENST00000473778 NDUFB1O75438 58 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf3-214ENST00000473778 SPRR1BP22528 89 aa6.72□□□□□ -1.33
C9orf3-214ENST00000473778 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
C9orf3-214ENST00000473778 LIMD2Q9BT23 127 aa6.72□□□□□ -1.33
C9orf3-214ENST00000473778 KMT2AQ03164 3969 aa6.72□□□□□ -1.33
C9orf3-214ENST00000473778 H0Y9J4 135 aa6.71□□□□□ -1.34
C9orf3-214ENST00000473778 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa6.71□□□□□ -1.34
C9orf3-214ENST00000473778 B9D2Q9BPU9 175 aa6.71□□□□□ -1.34
C9orf3-214ENST00000473778 LINC00472Q9H8W2 130 aa6.71□□□□□ -1.34
C9orf3-214ENST00000473778 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.7□□□□□ -1.34
C9orf3-214ENST00000473778 PRR15LQ9BU68 103 aa6.7□□□□□ -1.34
C9orf3-214ENST00000473778 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
C9orf3-214ENST00000473778 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa6.7□□□□□ -1.34
C9orf3-214ENST00000473778 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
C9orf3-214ENST00000473778 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6.69□□□□□ -1.34
C9orf3-214ENST00000473778 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
C9orf3-214ENST00000473778 DNAH8Q96JB1 4490 aa6.69□□□□□ -1.34
C9orf3-214ENST00000473778 C14orf177Q52M58 125 aa6.68□□□□□ -1.34
C9orf3-214ENST00000473778 DNAH2Q9P225 4427 aa6.68□□□□□ -1.34
C9orf3-214ENST00000473778 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa6.68□□□□□ -1.34
C9orf3-214ENST00000473778 A6NN06 94 aa6.68□□□□□ -1.34
C9orf3-214ENST00000473778 LCA10Q71F78 164 aa6.67□□□□□ -1.34
C9orf3-214ENST00000473778 LINC00208Q96KT6 92 aa6.66□□□□□ -1.34
C9orf3-214ENST00000473778 A6NED7 52 aa6.66□□□□□ -1.34
C9orf3-214ENST00000473778 A8MWP4 228 aa6.66□□□□□ -1.34
C9orf3-214ENST00000473778 MP68P56378 58 aa6.65□□□□□ -1.34
C9orf3-214ENST00000473778 CASC2Q6XLA1 102 aa6.65□□□□□ -1.34
C9orf3-214ENST00000473778 Q75L30 129 aa6.65□□□□□ -1.35
C9orf3-214ENST00000473778 DNAH17Q9UFH2 4485 aa6.64□□□□□ -1.35
C9orf3-214ENST00000473778 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.64□□□□□ -1.35
C9orf3-214ENST00000473778 SPACA4Q8TDM5 124 aa6.64□□□□□ -1.35
C9orf3-214ENST00000473778 Q96NJ1 140 aa6.64□□□□□ -1.35
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