RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465399.5

ATG4B-214, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 581 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-214ENST00000465399 HSBP1L1C9JCN9 74 aa7.58□□□□□ -1.2
ATG4B-214ENST00000465399 COPS9Q8WXC6 57 aa7.58□□□□□ -1.2
ATG4B-214ENST00000465399 A0A0G2JQZ4 141 aa7.56□□□□□ -1.2
ATG4B-214ENST00000465399 A4D1N5 150 aa7.55□□□□□ -1.2
ATG4B-214ENST00000465399 TCL1BO95988 128 aa7.55□□□□□ -1.2
ATG4B-214ENST00000465399 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
ATG4B-214ENST00000465399 SMIM11BQ8TCY0 68 aa7.54□□□□□ -1.2
ATG4B-214ENST00000465399 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
ATG4B-214ENST00000465399 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa7.52□□□□□ -1.21
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ATG4B-214ENST00000465399 C14orf144Q96I85 54 aa7.52□□□□□ -1.21
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ATG4B-214ENST00000465399 C12orf57Q99622 126 aa7.49□□□□□ -1.21
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ATG4B-214ENST00000465399 SPATA45Q537H7 98 aa7.48□□□□□ -1.21
ATG4B-214ENST00000465399 HIST1H4GQ99525 98 aa7.48□□□□□ -1.21
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ATG4B-214ENST00000465399 C2orf91Q6ZV80 131 aa7.45□□□□□ -1.22
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ATG4B-214ENST00000465399 VAMP8Q9BV40 100 aa7.44□□□□□ -1.22
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ATG4B-214ENST00000465399 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa7.43□□□□□ -1.22
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ATG4B-214ENST00000465399 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa7.42□□□□□ -1.22
ATG4B-214ENST00000465399 HIGD1BQ9P298 99 aa7.42□□□□□ -1.22
ATG4B-214ENST00000465399 Q6ZQY7 126 aa7.41□□□□□ -1.22
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ATG4B-214ENST00000465399 hADV29S1A0JD25 119 aa7.4□□□□□ -1.22
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ATG4B-214ENST00000465399 OCIAD2Q56VL3 154 aa7.37□□□□□ -1.23
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ATG4B-214ENST00000465399 RAB37Q96AX2 223 aa7.35□□□□□ -1.23
ATG4B-214ENST00000465399 A0A0B4J2C4 111 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG4B-214ENST00000465399 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
ATG4B-214ENST00000465399 PPDPFLQ8WWR9 84 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG4B-214ENST00000465399 Q96NJ1 140 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG4B-214ENST00000465399 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa7.33□□□□□ -1.24
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ATG4B-214ENST00000465399 SS18L2Q9UHA2 77 aa7.31□□□□□ -1.24
ATG4B-214ENST00000465399 H3BUT2 72 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG4B-214ENST00000465399 PRO1854Q9UHT4 67 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG4B-214ENST00000465399 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa7.29□□□□□ -1.24
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ATG4B-214ENST00000465399 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa7.1□□□□□ -1.27
ATG4B-214ENST00000465399 IGKV4-1P06312 121 aa7.1□□□□□ -1.27
ATG4B-214ENST00000465399 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa7.1□□□□□ -1.27
ATG4B-214ENST00000465399 DNAL4O96015 105 aa7.09□□□□□ -1.27
ATG4B-214ENST00000465399 SCGB1C2P0DMR2 95 aa7.09□□□□□ -1.27
ATG4B-214ENST00000465399 MT1FP04733 61 aa7.08□□□□□ -1.28
ATG4B-214ENST00000465399 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
ATG4B-214ENST00000465399 ANKRD29Q8N6D5 301 aa7.07□□□□□ -1.28
ATG4B-214ENST00000465399 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
ATG4B-214ENST00000465399 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa7.06□□□□□ -1.28
ATG4B-214ENST00000465399 LCE2BO14633 110 aa7.06□□□□□ -1.28
ATG4B-214ENST00000465399 TRACP01848 142 aa7.06□□□□□ -1.28
ATG4B-214ENST00000465399 SMIM6P0DI80 62 aa7.06□□□□□ -1.28
ATG4B-214ENST00000465399 HRES1P13985 223 aa7.06□□□□□ -1.28
ATG4B-214ENST00000465399 KRTAP10-10P60014 251 aa7.06□□□□□ -1.28
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