RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463423.5

CTPS1-204, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTPS1, Length 457 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-204ENST00000463423 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa3.58□□□□□ -1.84
CTPS1-204ENST00000463423 OCIAD2Q56VL3 154 aa3.58□□□□□ -1.84
CTPS1-204ENST00000463423 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa3.58□□□□□ -1.84
CTPS1-204ENST00000463423 PRR26Q8N8Z3 221 aa3.58□□□□□ -1.84
CTPS1-204ENST00000463423 PPDPFLQ8WWR9 84 aa3.58□□□□□ -1.84
CTPS1-204ENST00000463423 TRIAP1O43715 76 aa3.57□□□□□ -1.84
CTPS1-204ENST00000463423 SNCGO76070 127 aa3.57□□□□□ -1.84
CTPS1-204ENST00000463423 TSPAN13O95857 204 aa3.57□□□□□ -1.84
CTPS1-204ENST00000463423 COX6CP09669 75 aa3.57□□□□□ -1.84
CTPS1-204ENST00000463423 GAGE2AQ6NT46 116 aa3.57□□□□□ -1.84
CTPS1-204ENST00000463423 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
CTPS1-204ENST00000463423 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa3.57□□□□□ -1.84
CTPS1-204ENST00000463423 ANAPC11Q9NYG5 84 aa3.57□□□□□ -1.84
CTPS1-204ENST00000463423 PCLOQ9Y6V0 5065 aa3.57□□□□□ -1.84
CTPS1-204ENST00000463423 H7C2G1 150 aa3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-204ENST00000463423 K7ERJ3 54 aa3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-204ENST00000463423 Q1RN00 199 aa3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-204ENST00000463423 SMIM29Q86T20 159 aa3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-204ENST00000463423 Q8N377 158 aa3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-204ENST00000463423 TYMSOSQ8TAI1 123 aa3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-204ENST00000463423 H3BQ85 93 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-204ENST00000463423 PSMB2P49721 201 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-204ENST00000463423 SPAG11AQ6PDA7 123 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-204ENST00000463423 Q6ZQY7 126 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-204ENST00000463423 FAM218AQ96MZ4 157 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-204ENST00000463423 FAT3Q8TDW7 4589 aa3.55□□□□□ -1.84
CTPS1-204ENST00000463423 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-204ENST00000463423 TRACP01848 142 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-204ENST00000463423 C3orf22Q8N5N4 141 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-204ENST00000463423 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-204ENST00000463423 LST1O00453 97 aa3.53□□□□□ -1.84
CTPS1-204ENST00000463423 RPS29P62273 56 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
CTPS1-204ENST00000463423 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa3.53□□□□□ -1.84
CTPS1-204ENST00000463423 DEFB105AQ8NG35 78 aa3.53□□□□□ -1.84
CTPS1-204ENST00000463423 SNHG12Q9BXW3 62 aa3.53□□□□□ -1.84
CTPS1-204ENST00000463423 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa3.52□□□□□ -1.85
CTPS1-204ENST00000463423 C9orf118A6NHY6 69 aa3.52□□□□□ -1.85
CTPS1-204ENST00000463423 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa3.52□□□□□ -1.85
CTPS1-204ENST00000463423 TAX1BP3O14907 124 aa3.52□□□□□ -1.85
CTPS1-204ENST00000463423 SPINK1P00995 79 aa3.52□□□□□ -1.85
CTPS1-204ENST00000463423 SCGB1C2P0DMR2 95 aa3.52□□□□□ -1.85
CTPS1-204ENST00000463423 CD164Q04900 197 aa3.52□□□□□ -1.85
CTPS1-204ENST00000463423 Q8NBF4 154 aa3.52□□□□□ -1.85
CTPS1-204ENST00000463423 CLEC2BQ92478 149 aa3.52□□□□□ -1.85
CTPS1-204ENST00000463423 TNXBP22105 4242 aa3.51□□□□□ -1.85
CTPS1-204ENST00000463423 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa3.51□□□□□ -1.85
CTPS1-204ENST00000463423 DNAL4O96015 105 aa3.51□□□□□ -1.85
CTPS1-204ENST00000463423 MOBPQ13875 183 aa3.51□□□□□ -1.85
CTPS1-204ENST00000463423 LYRM7Q5U5X0 104 aa3.51□□□□□ -1.85
CTPS1-204ENST00000463423 LINC00304Q8N9R0 145 aa3.51□□□□□ -1.85
CTPS1-204ENST00000463423 ORMDL1Q9P0S3 153 aa3.51□□□□□ -1.85
CTPS1-204ENST00000463423 TCL1BO95988 128 aa3.5□□□□□ -1.85
CTPS1-204ENST00000463423 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
CTPS1-204ENST00000463423 UBE2V1Q13404 147 aa3.5□□□□□ -1.85
CTPS1-204ENST00000463423 BATFQ16520 125 aa3.5□□□□□ -1.85
CTPS1-204ENST00000463423 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa3.5□□□□□ -1.85
CTPS1-204ENST00000463423 Q5XG85 94 aa3.5□□□□□ -1.85
CTPS1-204ENST00000463423 Q6JHZ5 121 aa3.5□□□□□ -1.85
CTPS1-204ENST00000463423 A0A1W2PPM0 123 aa3.49□□□□□ -1.85
CTPS1-204ENST00000463423 H3BUT2 72 aa3.49□□□□□ -1.85
CTPS1-204ENST00000463423 ATXN8Q156A1 80 aa3.49□□□□□ -1.85
CTPS1-204ENST00000463423 C9orf153Q5TBE3 101 aa3.49□□□□□ -1.85
CTPS1-204ENST00000463423 F8WEM9 126 aa3.48□□□□□ -1.85
CTPS1-204ENST00000463423 BAALC-AS2P0C853 105 aa3.48□□□□□ -1.85
CTPS1-204ENST00000463423 Q6Q795 121 aa3.48□□□□□ -1.85
CTPS1-204ENST00000463423 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa3.48□□□□□ -1.85
CTPS1-204ENST00000463423 PCP4L1A6NKN8 68 aa3.47□□□□□ -1.85
CTPS1-204ENST00000463423 H3BMG7 143 aa3.47□□□□□ -1.85
CTPS1-204ENST00000463423 FABP2P12104 132 aa3.47□□□□□ -1.85
CTPS1-204ENST00000463423 IGFL1Q6UW32 110 aa3.47□□□□□ -1.85
CTPS1-204ENST00000463423 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
CTPS1-204ENST00000463423 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa3.46□□□□□ -1.86
CTPS1-204ENST00000463423 TEN1Q86WV5 123 aa3.46□□□□□ -1.86
CTPS1-204ENST00000463423 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa3.45□□□□□ -1.86
CTPS1-204ENST00000463423 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
CTPS1-204ENST00000463423 SVIPQ8NHG7 77 aa3.45□□□□□ -1.86
CTPS1-204ENST00000463423 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa3.45□□□□□ -1.86
CTPS1-204ENST00000463423 LIMD2Q9BT23 127 aa3.45□□□□□ -1.86
CTPS1-204ENST00000463423 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa3.44□□□□□ -1.86
CTPS1-204ENST00000463423 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa3.44□□□□□ -1.86
CTPS1-204ENST00000463423 A0A1B0GW54 56 aa3.44□□□□□ -1.86
CTPS1-204ENST00000463423 C9JAW5 83 aa3.44□□□□□ -1.86
CTPS1-204ENST00000463423 H3BT86 120 aa3.44□□□□□ -1.86
CTPS1-204ENST00000463423 RBM3P98179 157 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
CTPS1-204ENST00000463423 ANKRD29Q8N6D5 301 aa3.44□□□□□ -1.86
CTPS1-204ENST00000463423 HERC1Q15751 4861 aa3.43□□□□□ -1.86
CTPS1-204ENST00000463423 A0A0G2JQZ4 141 aa3.43□□□□□ -1.86
CTPS1-204ENST00000463423 PDE6GP18545 87 aa3.43□□□□□ -1.86
CTPS1-204ENST00000463423 SPCS1Q9Y6A9 102 aa3.43□□□□□ -1.86
CTPS1-204ENST00000463423 A0A1W2PNM2 257 aa3.42□□□□□ -1.86
CTPS1-204ENST00000463423 HRCT1Q6UXD1 115 aa3.42□□□□□ -1.86
CTPS1-204ENST00000463423 DSCR8Q96T75 97 aa3.42□□□□□ -1.86
CTPS1-204ENST00000463423 CDIP1Q9H305 208 aa3.42□□□□□ -1.86
CTPS1-204ENST00000463423 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa3.41□□□□□ -1.86
CTPS1-204ENST00000463423 F8W1H4 67 aa3.41□□□□□ -1.86
CTPS1-204ENST00000463423 K7EP34 96 aa3.41□□□□□ -1.86
CTPS1-204ENST00000463423 TPRXLQ17RH7 258 aa3.41□□□□□ -1.86
CTPS1-204ENST00000463423 C1orf195Q5TG92 126 aa3.41□□□□□ -1.86
CTPS1-204ENST00000463423 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa3.41□□□□□ -1.86
CTPS1-204ENST00000463423 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa3.4□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 141.8 ms