RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455321.1

PGGT1BP1-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP1, Length 1,023 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HMCN2Q8NDA2 5059 aa4.89□□□□□ -1.63
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TIMM17BO60830 172 aa4.89□□□□□ -1.63
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa4.89□□□□□ -1.63
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa4.88□□□□□ -1.63
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DDTP30046 118 aa4.88□□□□□ -1.63
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RPL28P46779 137 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
PGGT1BP1-201ENST00000455321 S100A7L2Q5SY68 101 aa4.88□□□□□ -1.63
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ARL17AQ8IVW1 177 aa4.88□□□□□ -1.63
PGGT1BP1-201ENST00000455321 Q8N9L7 120 aa4.88□□□□□ -1.63
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LINC01600Q96MT4 127 aa4.88□□□□□ -1.63
PGGT1BP1-201ENST00000455321 AKR1D1P51857 326 aa4.87□□□□□ -1.63
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MUSTN1Q8IVN3 82 aa4.87□□□□□ -1.63
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ANAPC13Q9BS18 74 aa4.87□□□□□ -1.63
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HIGD2AQ9BW72 106 aa4.87□□□□□ -1.63
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPANXDQ9BXN6 97 aa4.87□□□□□ -1.63
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPANXCQ9NY87 97 aa4.87□□□□□ -1.63
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa4.86□□□□□ -1.63
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NDUFC2O95298 119 aa4.86□□□□□ -1.63
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IGLV6-57P01721 117 aa4.86□□□□□ -1.63
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SCGB1C2P0DMR2 95 aa4.86□□□□□ -1.63
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KRTAP10-8P60410 259 aa4.86□□□□□ -1.63
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPATA45Q537H7 98 aa4.86□□□□□ -1.63
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR13C6PQ8NH95 151 aa4.86□□□□□ -1.63
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C14orf144Q96I85 54 aa4.86□□□□□ -1.63
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KCNQ1DNQ9H478 68 aa4.86□□□□□ -1.63
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa4.85□□□□□ -1.63
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa4.85□□□□□ -1.63
PGGT1BP1-201ENST00000455321 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C8orf87E5RJ46 101 aa4.84□□□□□ -1.63
PGGT1BP1-201ENST00000455321 COX8AP10176 69 aa4.84□□□□□ -1.63
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPRR1AP35321 89 aa4.84□□□□□ -1.63
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PYY3Q5JQD4 70 aa4.84□□□□□ -1.63
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C12orf57Q99622 126 aa4.84□□□□□ -1.63
PGGT1BP1-201ENST00000455321 VAMP8Q9BV40 100 aa4.84□□□□□ -1.63
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ERC2-IT1O76042 136 aa4.83□□□□□ -1.64
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C4orf26Q17RF5 130 aa4.83□□□□□ -1.64
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa4.83□□□□□ -1.64
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SMCR5Q8TEV8 140 aa4.83□□□□□ -1.64
PGGT1BP1-201ENST00000455321 Q9BRP9 147 aa4.83□□□□□ -1.64
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IFITM1P13164 125 aa4.82□□□□□ -1.64
PGGT1BP1-201ENST00000455321 S100A12P80511 92 aa4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C2orf91Q6ZV80 131 aa4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C3orf22Q8N5N4 141 aa4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPRR4Q96PI1 79 aa4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LINC00483Q53H64 154 aa4.8□□□□□ -1.64
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LCE3CQ5T5A8 94 aa4.8□□□□□ -1.64
PGGT1BP1-201ENST00000455321 Q6ZRX8 168 aa4.8□□□□□ -1.64
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa4.8□□□□□ -1.64
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CRYGAP11844 174 aa4.79□□□□□ -1.64
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC25A34Q6PIV7 304 aa4.79□□□□□ -1.64
PGGT1BP1-201ENST00000455321 COPS9Q8WXC6 57 aa4.79□□□□□ -1.64
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DLEU1O43261 78 aa4.78□□□□□ -1.64
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 SMIM11BQ8TCY0 68 aa4.78□□□□□ -1.64
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LPAP08519 4548 aa4.78□□□□□ -1.64
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 UBR4Q5T4S7 5183 aa4.76□□□□□ -1.65
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa4.76□□□□□ -1.65
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM229BQ4G0N7 80 aa4.76□□□□□ -1.65
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LRP2P98164 4655 aa4.76□□□□□ -1.65
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MP68P56378 58 aa4.75□□□□□ -1.65
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CTAG1AP78358 180 aa4.75□□□□□ -1.65
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DEFB105AQ8NG35 78 aa4.75□□□□□ -1.65
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRO1933Q9H354 126 aa4.75□□□□□ -1.65
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HIGD1BQ9P298 99 aa4.75□□□□□ -1.65
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FXYD2P54710 66 aa4.74□□□□□ -1.65
PGGT1BP1-201ENST00000455321 K7ERJ3 54 aa4.73□□□□□ -1.65
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MOBPQ13875 183 aa4.73□□□□□ -1.65
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LINC00304Q8N9R0 145 aa4.73□□□□□ -1.65
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 RETNLBQ9BQ08 111 aa4.72□□□□□ -1.65
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa4.71□□□□□ -1.66
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C9orf153Q5TBE3 101 aa4.71□□□□□ -1.66
PGGT1BP1-201ENST00000455321 UQCR10Q9UDW1 63 aa4.71□□□□□ -1.66
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa4.7□□□□□ -1.66
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HSD52Q0P140 79 aa4.7□□□□□ -1.66
PGGT1BP1-201ENST00000455321 A0A0B4J2C4 111 aa4.69□□□□□ -1.66
PGGT1BP1-201ENST00000455321 A0A0G2JQZ4 141 aa4.69□□□□□ -1.66
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LINC00575Q6W349 94 aa4.69□□□□□ -1.66
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RNF213Q63HN8 5207 aa4.69□□□□□ -1.66
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SMIM6P0DI80 62 aa4.68□□□□□ -1.66
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HRCT1Q6UXD1 115 aa4.68□□□□□ -1.66
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPRR1BP22528 89 aa4.67□□□□□ -1.66
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa4.67□□□□□ -1.66
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRO1854Q9UHT4 67 aa4.67□□□□□ -1.66
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP1-201ENST00000455321 hADV29S1A0JD25 119 aa4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP1-201ENST00000455321 K7ERS5 55 aa4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC25A20O43772 301 aa4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP1-201ENST00000455321 Q6ZQY7 126 aa4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa4.65□□□□□ -1.67
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CLEC2BQ92478 149 aa4.65□□□□□ -1.67
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa4.65□□□□□ -1.67
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa4.64□□□□□ -1.67
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