RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455134.1

GAPDHP28-201, Transcript of glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene GAPDHP28, Length 1,003 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHP28-201ENST00000455134 PCOTHQ58A44 107 aa4.57□□□□□ -1.68
GAPDHP28-201ENST00000455134 HRCT1Q6UXD1 115 aa4.57□□□□□ -1.68
GAPDHP28-201ENST00000455134 SMIM29Q86T20 159 aa4.57□□□□□ -1.68
GAPDHP28-201ENST00000455134 VPS25Q9BRG1 176 aa4.57□□□□□ -1.68
GAPDHP28-201ENST00000455134 C9orf92A6NGG3 77 aa4.56□□□□□ -1.68
GAPDHP28-201ENST00000455134 C6orf99Q4VX62 202 aa4.56□□□□□ -1.68
GAPDHP28-201ENST00000455134 SPANXDQ9BXN6 97 aa4.56□□□□□ -1.68
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF815PA8K554 130 aa4.55□□□□□ -1.68
GAPDHP28-201ENST00000455134 Q1RN00 199 aa4.55□□□□□ -1.68
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR13C6PQ8NH95 151 aa4.55□□□□□ -1.68
GAPDHP28-201ENST00000455134 LIMD2Q9BT23 127 aa4.55□□□□□ -1.68
GAPDHP28-201ENST00000455134 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa4.55□□□□□ -1.68
GAPDHP28-201ENST00000455134 CRCT1Q9UGL9 99 aa4.55□□□□□ -1.68
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa4.54□□□□□ -1.68
GAPDHP28-201ENST00000455134 A0A0G2JQZ4 141 aa4.54□□□□□ -1.68
GAPDHP28-201ENST00000455134 C3orf79P0CE67 100 aa4.54□□□□□ -1.68
GAPDHP28-201ENST00000455134 COX7BP24311 80 aa4.54□□□□□ -1.68
GAPDHP28-201ENST00000455134 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
GAPDHP28-201ENST00000455134 CD164Q04900 197 aa4.54□□□□□ -1.68
GAPDHP28-201ENST00000455134 Q5XG85 94 aa4.54□□□□□ -1.68
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa4.53□□□□□ -1.68
GAPDHP28-201ENST00000455134 K7ERU9 68 aa4.53□□□□□ -1.68
GAPDHP28-201ENST00000455134 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa4.53□□□□□ -1.68
GAPDHP28-201ENST00000455134 H7C2G1 150 aa4.52□□□□□ -1.69
GAPDHP28-201ENST00000455134 C1orf195Q5TG92 126 aa4.52□□□□□ -1.69
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC25A34Q6PIV7 304 aa4.52□□□□□ -1.69
GAPDHP28-201ENST00000455134 FSIP2Q5CZC0 6907 aa4.51□□□□□ -1.69
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa4.51□□□□□ -1.69
GAPDHP28-201ENST00000455134 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa4.51□□□□□ -1.69
GAPDHP28-201ENST00000455134 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
GAPDHP28-201ENST00000455134 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
GAPDHP28-201ENST00000455134 TAL2Q16559 108 aa4.51□□□□□ -1.69
GAPDHP28-201ENST00000455134 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
GAPDHP28-201ENST00000455134 DEFB105AQ8NG35 78 aa4.51□□□□□ -1.69
GAPDHP28-201ENST00000455134 PRO1933Q9H354 126 aa4.51□□□□□ -1.69
GAPDHP28-201ENST00000455134 A0A1B0GWB2 263 aa4.5□□□□□ -1.69
GAPDHP28-201ENST00000455134 RPL37P61927 97 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
GAPDHP28-201ENST00000455134 PCP2Q8IVA1 136 aa4.49□□□□□ -1.69
GAPDHP28-201ENST00000455134 MUSTN1Q8IVN3 82 aa4.48□□□□□ -1.69
GAPDHP28-201ENST00000455134 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa4.48□□□□□ -1.69
GAPDHP28-201ENST00000455134 C20orf202A1L168 122 aa4.47□□□□□ -1.69
GAPDHP28-201ENST00000455134 M0R143 59 aa4.47□□□□□ -1.69
GAPDHP28-201ENST00000455134 CFC1BP0CG36 223 aa4.47□□□□□ -1.69
GAPDHP28-201ENST00000455134 IFITM1P13164 125 aa4.47□□□□□ -1.69
GAPDHP28-201ENST00000455134 KRTDAPP60985 99 aa4.47□□□□□ -1.69
GAPDHP28-201ENST00000455134 SCGB1D4Q6XE38 83 aa4.47□□□□□ -1.69
GAPDHP28-201ENST00000455134 ATOH7Q8N100 152 aa4.47□□□□□ -1.69
GAPDHP28-201ENST00000455134 SMIM20Q8N5G0 67 aa4.47□□□□□ -1.69
GAPDHP28-201ENST00000455134 SMIM11BQ8TCY0 68 aa4.47□□□□□ -1.69
GAPDHP28-201ENST00000455134 A6NDN8 102 aa4.46□□□□□ -1.7
GAPDHP28-201ENST00000455134 Q6ZVH6 145 aa4.46□□□□□ -1.7
GAPDHP28-201ENST00000455134 SIGMAR1Q99720 223 aa4.46□□□□□ -1.7
GAPDHP28-201ENST00000455134 OCIAD2Q56VL3 154 aa4.44□□□□□ -1.7
GAPDHP28-201ENST00000455134 PRO0628Q9UI54 55 aa4.44□□□□□ -1.7
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa4.42□□□□□ -1.7
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGFL1Q6UW32 110 aa4.42□□□□□ -1.7
GAPDHP28-201ENST00000455134 LINC00575Q6W349 94 aa4.42□□□□□ -1.7
GAPDHP28-201ENST00000455134 COPS9Q8WXC6 57 aa4.42□□□□□ -1.7
GAPDHP28-201ENST00000455134 UBE2V1Q13404 147 aa4.41□□□□□ -1.7
GAPDHP28-201ENST00000455134 Q6ZQY7 126 aa4.41□□□□□ -1.7
GAPDHP28-201ENST00000455134 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP4.41□□□□□ -1.7
GAPDHP28-201ENST00000455134 SS18L2Q9UHA2 77 aa4.41□□□□□ -1.7
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa4.4□□□□□ -1.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 TCL1BO95988 128 aa4.39□□□□□ -1.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 RPS28P62857 69 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 CLEC2BQ92478 149 aa4.39□□□□□ -1.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 hADV29S1A0JD25 119 aa4.38□□□□□ -1.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 M0R2T5 61 aa4.38□□□□□ -1.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa4.38□□□□□ -1.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 COX6B2Q6YFQ2 88 aa4.38□□□□□ -1.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 HIST3H2BBQ8N257 126 aa4.38□□□□□ -1.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 A0A1B0GX51 115 aa4.37□□□□□ -1.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 F8WEM9 126 aa4.37□□□□□ -1.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 Q6JHZ5 121 aa4.37□□□□□ -1.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 Q75L30 129 aa4.37□□□□□ -1.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 HIST1H2BLQ99880 126 aa4.37□□□□□ -1.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 S100A2P29034 98 aa4.36□□□□□ -1.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa4.36□□□□□ -1.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 SNHG12Q9BXW3 62 aa4.36□□□□□ -1.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 C4orf26Q17RF5 130 aa4.35□□□□□ -1.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 A0A0A0MQY5 61 aa4.34□□□□□ -1.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 H3BUT2 72 aa4.34□□□□□ -1.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRIAP1O43715 76 aa4.34□□□□□ -1.71
GAPDHP28-201ENST00000455134 PPDPFLQ8WWR9 84 aa4.33□□□□□ -1.72
GAPDHP28-201ENST00000455134 Q96NJ1 140 aa4.33□□□□□ -1.72
GAPDHP28-201ENST00000455134 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa4.33□□□□□ -1.72
GAPDHP28-201ENST00000455134 A8MUU9 505 aa4.32□□□□□ -1.72
GAPDHP28-201ENST00000455134 J3KT08 172 aa4.32□□□□□ -1.72
GAPDHP28-201ENST00000455134 PYY3Q5JQD4 70 aa4.32□□□□□ -1.72
GAPDHP28-201ENST00000455134 Q6Q795 121 aa4.32□□□□□ -1.72
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM218AQ96MZ4 157 aa4.32□□□□□ -1.72
GAPDHP28-201ENST00000455134 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa4.31□□□□□ -1.72
GAPDHP28-201ENST00000455134 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa4.31□□□□□ -1.72
GAPDHP28-201ENST00000455134 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa4.31□□□□□ -1.72
GAPDHP28-201ENST00000455134 J3QR89 54 aa4.3□□□□□ -1.72
GAPDHP28-201ENST00000455134 LST1O00453 97 aa4.3□□□□□ -1.72
GAPDHP28-201ENST00000455134 CFC1P0CG37 223 aa4.3□□□□□ -1.72
GAPDHP28-201ENST00000455134 COX8AP10176 69 aa4.3□□□□□ -1.72
GAPDHP28-201ENST00000455134 HIST1H4GQ99525 98 aa4.29□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms