RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439555.2

IRF1-204, Transcript of interferon regulatory factor 1, humanhuman

TSL 5

Gene IRF1, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1-204ENST00000439555 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa6.2□□□□□ -1.42
IRF1-204ENST00000439555 hADV29S1A0JD25 119 aa6.19□□□□□ -1.42
IRF1-204ENST00000439555 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
IRF1-204ENST00000439555 F8WEM9 126 aa6.19□□□□□ -1.42
IRF1-204ENST00000439555 Q6JHZ5 121 aa6.19□□□□□ -1.42
IRF1-204ENST00000439555 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa6.18□□□□□ -1.42
IRF1-204ENST00000439555 A0A0G2JQZ4 141 aa6.18□□□□□ -1.42
IRF1-204ENST00000439555 S100A1P23297 94 aa6.18□□□□□ -1.42
IRF1-204ENST00000439555 S100A6P06703 90 aa6.17□□□□□ -1.42
IRF1-204ENST00000439555 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
IRF1-204ENST00000439555 Q6ZQY7 126 aa6.17□□□□□ -1.42
IRF1-204ENST00000439555 PPDPFLQ8WWR9 84 aa6.17□□□□□ -1.42
IRF1-204ENST00000439555 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa6.16□□□□□ -1.42
IRF1-204ENST00000439555 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
IRF1-204ENST00000439555 RPL37P61927 97 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
IRF1-204ENST00000439555 OCIAD2Q56VL3 154 aa6.15□□□□□ -1.42
IRF1-204ENST00000439555 CLEC2BQ92478 149 aa6.15□□□□□ -1.42
IRF1-204ENST00000439555 DLEU1O43261 78 aa6.14□□□□□ -1.43
IRF1-204ENST00000439555 HIST1H4GQ99525 98 aa6.14□□□□□ -1.43
IRF1-204ENST00000439555 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa6.13□□□□□ -1.43
IRF1-204ENST00000439555 COX8AP10176 69 aa6.13□□□□□ -1.43
IRF1-204ENST00000439555 IGFL1Q6UW32 110 aa6.13□□□□□ -1.43
IRF1-204ENST00000439555 SCGB1D1O95968 90 aa6.12□□□□□ -1.43
IRF1-204ENST00000439555 SNCGO76070 127 aa6.1□□□□□ -1.43
IRF1-204ENST00000439555 SNHG12Q9BXW3 62 aa6.1□□□□□ -1.43
IRF1-204ENST00000439555 C12orf57Q99622 126 aa6.09□□□□□ -1.43
IRF1-204ENST00000439555 HIGD1BQ9P298 99 aa6.09□□□□□ -1.43
IRF1-204ENST00000439555 H0YGX0 51 aa6.08□□□□□ -1.44
IRF1-204ENST00000439555 CFC1P0CG37 223 aa6.08□□□□□ -1.44
IRF1-204ENST00000439555 A0A0B4J2C4 111 aa6.07□□□□□ -1.44
IRF1-204ENST00000439555 Q6Q795 121 aa6.07□□□□□ -1.44
IRF1-204ENST00000439555 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
IRF1-204ENST00000439555 RAB37Q96AX2 223 aa6.06□□□□□ -1.44
IRF1-204ENST00000439555 LST1O00453 97 aa6.05□□□□□ -1.44
IRF1-204ENST00000439555 GHRHP01286 108 aa6.05□□□□□ -1.44
IRF1-204ENST00000439555 Q75L30 129 aa6.05□□□□□ -1.44
IRF1-204ENST00000439555 C14orf144Q96I85 54 aa6.05□□□□□ -1.44
IRF1-204ENST00000439555 A0A1B0GX51 115 aa6.04□□□□□ -1.44
IRF1-204ENST00000439555 H3BUT2 72 aa6.04□□□□□ -1.44
IRF1-204ENST00000439555 TEN1Q86WV5 123 aa6.04□□□□□ -1.44
IRF1-204ENST00000439555 SS18L2Q9UHA2 77 aa6.04□□□□□ -1.44
IRF1-204ENST00000439555 M0R2T5 61 aa6.03□□□□□ -1.44
IRF1-204ENST00000439555 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
IRF1-204ENST00000439555 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa6.03□□□□□ -1.44
IRF1-204ENST00000439555 PAM16Q9Y3D7 125 aa6.03□□□□□ -1.44
IRF1-204ENST00000439555 SPATA45Q537H7 98 aa6.02□□□□□ -1.45
IRF1-204ENST00000439555 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa6.02□□□□□ -1.45
IRF1-204ENST00000439555 C2orf91Q6ZV80 131 aa6.02□□□□□ -1.45
IRF1-204ENST00000439555 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.01□□□□□ -1.45
IRF1-204ENST00000439555 A6NJY4 79 aa6.01□□□□□ -1.45
IRF1-204ENST00000439555 COX6B2Q6YFQ2 88 aa6.01□□□□□ -1.45
IRF1-204ENST00000439555 FAM218AQ96MZ4 157 aa6.01□□□□□ -1.45
IRF1-204ENST00000439555 VAMP8Q9BV40 100 aa6.01□□□□□ -1.45
IRF1-204ENST00000439555 PRO1854Q9UHT4 67 aa6.01□□□□□ -1.45
IRF1-204ENST00000439555 CEND1Q8N111 149 aa6□□□□□ -1.45
IRF1-204ENST00000439555 H3BMG7 143 aa5.98□□□□□ -1.45
IRF1-204ENST00000439555 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa5.98□□□□□ -1.45
IRF1-204ENST00000439555 H3BQ85 93 aa5.97□□□□□ -1.45
IRF1-204ENST00000439555 Q96NJ1 140 aa5.97□□□□□ -1.45
IRF1-204ENST00000439555 A0A087WSZ3 146 aa5.96□□□□□ -1.46
IRF1-204ENST00000439555 FABP2P12104 132 aa5.96□□□□□ -1.46
IRF1-204ENST00000439555 SSPOA2VEC9 5147 aa5.96□□□□□ -1.46
IRF1-204ENST00000439555 A8MUU9 505 aa5.95□□□□□ -1.46
IRF1-204ENST00000439555 FXYD2P54710 66 aa5.95□□□□□ -1.46
IRF1-204ENST00000439555 TRIAP1O43715 76 aa5.94□□□□□ -1.46
IRF1-204ENST00000439555 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa5.92□□□□□ -1.46
IRF1-204ENST00000439555 A0A1W2PNM2 257 aa5.92□□□□□ -1.46
IRF1-204ENST00000439555 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa5.91□□□□□ -1.46
IRF1-204ENST00000439555 DNAL4O96015 105 aa5.91□□□□□ -1.46
IRF1-204ENST00000439555 HSD52Q0P140 79 aa5.91□□□□□ -1.46
IRF1-204ENST00000439555 ANKRD29Q8N6D5 301 aa5.91□□□□□ -1.46
IRF1-204ENST00000439555 ORMDL1Q9P0S3 153 aa5.91□□□□□ -1.46
IRF1-204ENST00000439555 USH2AO75445 5202 aa5.9□□□□□ -1.46
IRF1-204ENST00000439555 COX6CP09669 75 aa5.9□□□□□ -1.46
IRF1-204ENST00000439555 PSMB2P49721 201 aa5.89□□□□□ -1.47
IRF1-204ENST00000439555 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
IRF1-204ENST00000439555 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa5.88□□□□□ -1.47
IRF1-204ENST00000439555 LINC00313P59037 77 aa5.88□□□□□ -1.47
IRF1-204ENST00000439555 PYY3Q5JQD4 70 aa5.88□□□□□ -1.47
IRF1-204ENST00000439555 DSCR10P59022 87 aa5.87□□□□□ -1.47
IRF1-204ENST00000439555 UBE2V1Q13404 147 aa5.87□□□□□ -1.47
IRF1-204ENST00000439555 SIGMAR1Q99720 223 aa5.87□□□□□ -1.47
IRF1-204ENST00000439555 IGKV4-1P06312 121 aa5.86□□□□□ -1.47
IRF1-204ENST00000439555 K7ERJ3 54 aa5.85□□□□□ -1.47
IRF1-204ENST00000439555 LINC00472Q9H8W2 130 aa5.85□□□□□ -1.47
IRF1-204ENST00000439555 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa5.84□□□□□ -1.47
IRF1-204ENST00000439555 TRACP01848 142 aa5.84□□□□□ -1.47
IRF1-204ENST00000439555 CCKP06307 115 aa5.84□□□□□ -1.47
IRF1-204ENST00000439555 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.84□□□□□ -1.47
IRF1-204ENST00000439555 UQCR10Q9UDW1 63 aa5.84□□□□□ -1.47
IRF1-204ENST00000439555 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa5.81□□□□□ -1.48
IRF1-204ENST00000439555 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa5.81□□□□□ -1.48
IRF1-204ENST00000439555 RBM3P98179 157 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
IRF1-204ENST00000439555 A0A1B0GV72 72 aa5.79□□□□□ -1.48
IRF1-204ENST00000439555 SCGB1C2P0DMR2 95 aa5.79□□□□□ -1.48
IRF1-204ENST00000439555 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa5.79□□□□□ -1.48
IRF1-204ENST00000439555 DSCR8Q96T75 97 aa5.79□□□□□ -1.48
IRF1-204ENST00000439555 C8orf87E5RJ46 101 aa5.78□□□□□ -1.48
IRF1-204ENST00000439555 DEFB116Q30KQ4 102 aa5.78□□□□□ -1.48
IRF1-204ENST00000439555 MPLKIPQ8TAP9 179 aa5.78□□□□□ -1.48
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