RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439106.5

PRAME-209, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 891 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-209ENST00000439106 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa7.64□□□□□ -1.19
PRAME-209ENST00000439106 HSD52Q0P140 79 aa7.64□□□□□ -1.19
PRAME-209ENST00000439106 XP32Q5T750 250 aa7.64□□□□□ -1.19
PRAME-209ENST00000439106 LIMD2Q9BT23 127 aa7.64□□□□□ -1.19
PRAME-209ENST00000439106 C9orf92A6NGG3 77 aa7.61□□□□□ -1.19
PRAME-209ENST00000439106 CEND1Q8N111 149 aa7.61□□□□□ -1.19
PRAME-209ENST00000439106 PCP4L1A6NKN8 68 aa7.6□□□□□ -1.19
PRAME-209ENST00000439106 FXYD2P54710 66 aa7.6□□□□□ -1.19
PRAME-209ENST00000439106 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
PRAME-209ENST00000439106 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
PRAME-209ENST00000439106 CD164Q04900 197 aa7.58□□□□□ -1.2
PRAME-209ENST00000439106 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa7.58□□□□□ -1.2
PRAME-209ENST00000439106 LINC00575Q6W349 94 aa7.57□□□□□ -1.2
PRAME-209ENST00000439106 Q6ZQY7 126 aa7.57□□□□□ -1.2
PRAME-209ENST00000439106 M0R143 59 aa7.56□□□□□ -1.2
PRAME-209ENST00000439106 VAMP3Q15836 100 aa7.56□□□□□ -1.2
PRAME-209ENST00000439106 hADV29S1A0JD25 119 aa7.55□□□□□ -1.2
PRAME-209ENST00000439106 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa7.54□□□□□ -1.2
PRAME-209ENST00000439106 A6NJY4 79 aa7.54□□□□□ -1.2
PRAME-209ENST00000439106 CFC1BP0CG36 223 aa7.54□□□□□ -1.2
PRAME-209ENST00000439106 CFC1P0CG37 223 aa7.54□□□□□ -1.2
PRAME-209ENST00000439106 C1orf195Q5TG92 126 aa7.54□□□□□ -1.2
PRAME-209ENST00000439106 F8WEM9 126 aa7.53□□□□□ -1.2
PRAME-209ENST00000439106 K7ERJ3 54 aa7.52□□□□□ -1.21
PRAME-209ENST00000439106 BATFQ16520 125 aa7.52□□□□□ -1.21
PRAME-209ENST00000439106 Q5XG85 94 aa7.52□□□□□ -1.21
PRAME-209ENST00000439106 SNHG12Q9BXW3 62 aa7.52□□□□□ -1.21
PRAME-209ENST00000439106 A0A0B4J2C4 111 aa7.51□□□□□ -1.21
PRAME-209ENST00000439106 PCOTHQ58A44 107 aa7.51□□□□□ -1.21
PRAME-209ENST00000439106 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa7.5□□□□□ -1.21
PRAME-209ENST00000439106 IGFL1Q6UW32 110 aa7.49□□□□□ -1.21
PRAME-209ENST00000439106 RAB37Q96AX2 223 aa7.49□□□□□ -1.21
PRAME-209ENST00000439106 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
PRAME-209ENST00000439106 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa7.47□□□□□ -1.21
PRAME-209ENST00000439106 CLEC2BQ92478 149 aa7.47□□□□□ -1.21
PRAME-209ENST00000439106 PRO1854Q9UHT4 67 aa7.47□□□□□ -1.21
PRAME-209ENST00000439106 H3BUT2 72 aa7.46□□□□□ -1.22
PRAME-209ENST00000439106 TCL1BO95988 128 aa7.46□□□□□ -1.22
PRAME-209ENST00000439106 OCIAD2Q56VL3 154 aa7.45□□□□□ -1.22
PRAME-209ENST00000439106 Q6JHZ5 121 aa7.45□□□□□ -1.22
PRAME-209ENST00000439106 FAM218AQ96MZ4 157 aa7.45□□□□□ -1.22
PRAME-209ENST00000439106 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa7.44□□□□□ -1.22
PRAME-209ENST00000439106 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa7.43□□□□□ -1.22
PRAME-209ENST00000439106 LCE2CQ5TA81 110 aa7.43□□□□□ -1.22
PRAME-209ENST00000439106 TAX1BP3O14907 124 aa7.42□□□□□ -1.22
PRAME-209ENST00000439106 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa7.42□□□□□ -1.22
PRAME-209ENST00000439106 RPL37P61927 97 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
PRAME-209ENST00000439106 PPDPFLQ8WWR9 84 aa7.4□□□□□ -1.22
PRAME-209ENST00000439106 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
PRAME-209ENST00000439106 TRIAP1O43715 76 aa7.38□□□□□ -1.23
PRAME-209ENST00000439106 C9orf118A6NHY6 69 aa7.37□□□□□ -1.23
PRAME-209ENST00000439106 H0YGX0 51 aa7.37□□□□□ -1.23
PRAME-209ENST00000439106 PSMB2P49721 201 aa7.36□□□□□ -1.23
PRAME-209ENST00000439106 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PRAME-209ENST00000439106 MT1HP80294 61 aa7.34□□□□□ -1.23
PRAME-209ENST00000439106 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa7.34□□□□□ -1.23
PRAME-209ENST00000439106 LST1O00453 97 aa7.33□□□□□ -1.24
PRAME-209ENST00000439106 SNCGO76070 127 aa7.33□□□□□ -1.24
PRAME-209ENST00000439106 A0A1B0GV72 72 aa7.32□□□□□ -1.24
PRAME-209ENST00000439106 A0A1W2PPM0 123 aa7.32□□□□□ -1.24
PRAME-209ENST00000439106 FABP2P12104 132 aa7.32□□□□□ -1.24
PRAME-209ENST00000439106 A0A087WSZ3 146 aa7.31□□□□□ -1.24
PRAME-209ENST00000439106 H3BMG7 143 aa7.31□□□□□ -1.24
PRAME-209ENST00000439106 COX6CP09669 75 aa7.31□□□□□ -1.24
PRAME-209ENST00000439106 SCGB1C2P0DMR2 95 aa7.31□□□□□ -1.24
PRAME-209ENST00000439106 Q6Q795 121 aa7.3□□□□□ -1.24
PRAME-209ENST00000439106 TEN1Q86WV5 123 aa7.3□□□□□ -1.24
PRAME-209ENST00000439106 A0A1B0GX51 115 aa7.29□□□□□ -1.24
PRAME-209ENST00000439106 SS18L2Q9UHA2 77 aa7.29□□□□□ -1.24
PRAME-209ENST00000439106 LYRM7Q5U5X0 104 aa7.28□□□□□ -1.24
PRAME-209ENST00000439106 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PRAME-209ENST00000439106 A0A1W2PNM2 257 aa7.27□□□□□ -1.25
PRAME-209ENST00000439106 Q96NJ1 140 aa7.27□□□□□ -1.25
PRAME-209ENST00000439106 DNAL4O96015 105 aa7.25□□□□□ -1.25
PRAME-209ENST00000439106 Q75L30 129 aa7.25□□□□□ -1.25
PRAME-209ENST00000439106 ORMDL1Q9P0S3 153 aa7.25□□□□□ -1.25
PRAME-209ENST00000439106 SPCS1Q9Y6A9 102 aa7.25□□□□□ -1.25
PRAME-209ENST00000439106 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa7.24□□□□□ -1.25
PRAME-209ENST00000439106 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa7.24□□□□□ -1.25
PRAME-209ENST00000439106 TRACP01848 142 aa7.24□□□□□ -1.25
PRAME-209ENST00000439106 ATXN8Q156A1 80 aa7.24□□□□□ -1.25
PRAME-209ENST00000439106 COX6B2Q6YFQ2 88 aa7.24□□□□□ -1.25
PRAME-209ENST00000439106 A0A1B0GV90 55 aa7.23□□□□□ -1.25
PRAME-209ENST00000439106 K7EP34 96 aa7.23□□□□□ -1.25
PRAME-209ENST00000439106 GHRHP01286 108 aa7.23□□□□□ -1.25
PRAME-209ENST00000439106 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa7.23□□□□□ -1.25
PRAME-209ENST00000439106 DSCR10P59022 87 aa7.22□□□□□ -1.25
PRAME-209ENST00000439106 SIGMAR1Q99720 223 aa7.22□□□□□ -1.25
PRAME-209ENST00000439106 ANKRD29Q8N6D5 301 aa7.21□□□□□ -1.26
PRAME-209ENST00000439106 FSIP2Q5CZC0 6907 aa7.2□□□□□ -1.26
PRAME-209ENST00000439106 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
PRAME-209ENST00000439106 M0R2T5 61 aa7.19□□□□□ -1.26
PRAME-209ENST00000439106 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa7.19□□□□□ -1.26
PRAME-209ENST00000439106 LORP23490 312 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PRAME-209ENST00000439106 DEFB116Q30KQ4 102 aa7.18□□□□□ -1.26
PRAME-209ENST00000439106 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa7.18□□□□□ -1.26
PRAME-209ENST00000439106 A8MUU9 505 aa7.17□□□□□ -1.26
PRAME-209ENST00000439106 C9JAW5 83 aa7.17□□□□□ -1.26
PRAME-209ENST00000439106 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa7.16□□□□□ -1.26
PRAME-209ENST00000439106 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa7.16□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.6 ms