RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 F8WEM9 126 aa11.21□□□□□ -0.61
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LIMS1-208ENST00000428064 SCGB1D1O95968 90 aa11.19□□□□□ -0.62
LIMS1-208ENST00000428064 Q6JHZ5 121 aa11.16□□□□□ -0.62
LIMS1-208ENST00000428064 CRCT1Q9UGL9 99 aa11.16□□□□□ -0.62
LIMS1-208ENST00000428064 hADV29S1A0JD25 119 aa11.15□□□□□ -0.62
LIMS1-208ENST00000428064 Q6ZQY7 126 aa11.15□□□□□ -0.62
LIMS1-208ENST00000428064 CLEC2BQ92478 149 aa11.15□□□□□ -0.62
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LIMS1-208ENST00000428064 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
LIMS1-208ENST00000428064 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
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LIMS1-208ENST00000428064 SS18L2Q9UHA2 77 aa10.94□□□□□ -0.66
LIMS1-208ENST00000428064 H3BUT2 72 aa10.93□□□□□ -0.66
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LIMS1-208ENST00000428064 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP10.85□□□□□ -0.67
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LIMS1-208ENST00000428064 A6NJY4 79 aa10.83□□□□□ -0.68
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LIMS1-208ENST00000428064 H3BQ85 93 aa10.66□□□□□ -0.7
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LIMS1-208ENST00000428064 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa10.66□□□□□ -0.7
LIMS1-208ENST00000428064 A0A1B0GV72 72 aa10.65□□□□□ -0.7
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LIMS1-208ENST00000428064 LINC00472Q9H8W2 130 aa10.57□□□□□ -0.72
LIMS1-208ENST00000428064 USH2AO75445 5202 aa10.55□□□□□ -0.72
LIMS1-208ENST00000428064 MPLKIPQ8TAP9 179 aa10.54□□□□□ -0.72
LIMS1-208ENST00000428064 CCKP06307 115 aa10.53□□□□□ -0.72
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LIMS1-208ENST00000428064 HRES1P13985 223 aa10.5□□□□□ -0.73
LIMS1-208ENST00000428064 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa10.5□□□□□ -0.73
LIMS1-208ENST00000428064 DEFB116Q30KQ4 102 aa10.49□□□□□ -0.73
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LIMS1-208ENST00000428064 C8orf87E5RJ46 101 aa10.46□□□□□ -0.73
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