RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419606.5

ATG4B-208, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 4

Gene ATG4B, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-208ENST00000419606 LYRM7Q5U5X0 104 aa7.56□□□□□ -1.2
ATG4B-208ENST00000419606 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa7.55□□□□□ -1.2
ATG4B-208ENST00000419606 MT1HL1P0DM35 61 aa7.55□□□□□ -1.2
ATG4B-208ENST00000419606 CRYGAP11844 174 aa7.55□□□□□ -1.2
ATG4B-208ENST00000419606 KRTAP10-8P60410 259 aa7.55□□□□□ -1.2
ATG4B-208ENST00000419606 SPCS1Q9Y6A9 102 aa7.55□□□□□ -1.2
ATG4B-208ENST00000419606 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
ATG4B-208ENST00000419606 H3BMG7 143 aa7.54□□□□□ -1.2
ATG4B-208ENST00000419606 OXTP01178 125 aa7.53□□□□□ -1.2
ATG4B-208ENST00000419606 MOBPQ13875 183 aa7.53□□□□□ -1.2
ATG4B-208ENST00000419606 OCIAD2Q56VL3 154 aa7.53□□□□□ -1.2
ATG4B-208ENST00000419606 MTURNQ8N3F0 131 aa7.53□□□□□ -1.2
ATG4B-208ENST00000419606 ORMDL1Q9P0S3 153 aa7.53□□□□□ -1.2
ATG4B-208ENST00000419606 TYMSOSQ8TAI1 123 aa7.52□□□□□ -1.21
ATG4B-208ENST00000419606 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa7.52□□□□□ -1.21
ATG4B-208ENST00000419606 TNXBP22105 4242 aa7.52□□□□□ -1.21
ATG4B-208ENST00000419606 A0A0G2JQZ4 141 aa7.51□□□□□ -1.21
ATG4B-208ENST00000419606 C9JAW5 83 aa7.51□□□□□ -1.21
ATG4B-208ENST00000419606 K7EP34 96 aa7.51□□□□□ -1.21
ATG4B-208ENST00000419606 BAALC-AS2P0C853 105 aa7.51□□□□□ -1.21
ATG4B-208ENST00000419606 C9orf153Q5TBE3 101 aa7.51□□□□□ -1.21
ATG4B-208ENST00000419606 PPDPFLQ8WWR9 84 aa7.5□□□□□ -1.21
ATG4B-208ENST00000419606 A0A1B0GV72 72 aa7.49□□□□□ -1.21
ATG4B-208ENST00000419606 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
ATG4B-208ENST00000419606 A0A1B0GV90 55 aa7.47□□□□□ -1.21
ATG4B-208ENST00000419606 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa7.47□□□□□ -1.21
ATG4B-208ENST00000419606 Q8NBF4 154 aa7.47□□□□□ -1.21
ATG4B-208ENST00000419606 J3QL48 77 aa7.46□□□□□ -1.22
ATG4B-208ENST00000419606 F8WEM9 126 aa7.45□□□□□ -1.22
ATG4B-208ENST00000419606 GHRHP01286 108 aa7.45□□□□□ -1.22
ATG4B-208ENST00000419606 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
ATG4B-208ENST00000419606 UBE2V1Q13404 147 aa7.45□□□□□ -1.22
ATG4B-208ENST00000419606 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa7.45□□□□□ -1.22
ATG4B-208ENST00000419606 PRO0461Q9UI25 63 aa7.45□□□□□ -1.22
ATG4B-208ENST00000419606 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa7.44□□□□□ -1.22
ATG4B-208ENST00000419606 H3BQ85 93 aa7.44□□□□□ -1.22
ATG4B-208ENST00000419606 ANKRD29Q8N6D5 301 aa7.44□□□□□ -1.22
ATG4B-208ENST00000419606 IGFL1Q6UW32 110 aa7.43□□□□□ -1.22
ATG4B-208ENST00000419606 HRCT1Q6UXD1 115 aa7.43□□□□□ -1.22
ATG4B-208ENST00000419606 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa7.43□□□□□ -1.22
ATG4B-208ENST00000419606 LINC00304Q8N9R0 145 aa7.43□□□□□ -1.22
ATG4B-208ENST00000419606 H3BT86 120 aa7.42□□□□□ -1.22
ATG4B-208ENST00000419606 Q6JHZ5 121 aa7.38□□□□□ -1.23
ATG4B-208ENST00000419606 RBM3P98179 157 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
ATG4B-208ENST00000419606 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
ATG4B-208ENST00000419606 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa7.36□□□□□ -1.23
ATG4B-208ENST00000419606 A0A1W2PNM2 257 aa7.36□□□□□ -1.23
ATG4B-208ENST00000419606 C4orf48Q5BLP8 95 aa7.36□□□□□ -1.23
ATG4B-208ENST00000419606 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa7.36□□□□□ -1.23
ATG4B-208ENST00000419606 C14orf132Q9NPU4 83 aa7.35□□□□□ -1.23
ATG4B-208ENST00000419606 F8W1H4 67 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG4B-208ENST00000419606 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG4B-208ENST00000419606 SPAG11AQ6PDA7 123 aa7.34□□□□□ -1.23
ATG4B-208ENST00000419606 SPINK1P00995 79 aa7.33□□□□□ -1.24
ATG4B-208ENST00000419606 DSCR8Q96T75 97 aa7.33□□□□□ -1.24
ATG4B-208ENST00000419606 CD164Q04900 197 aa7.32□□□□□ -1.24
ATG4B-208ENST00000419606 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa7.31□□□□□ -1.24
ATG4B-208ENST00000419606 CCKP06307 115 aa7.31□□□□□ -1.24
ATG4B-208ENST00000419606 Q6ZQT0 140 aa7.31□□□□□ -1.24
ATG4B-208ENST00000419606 TEN1Q86WV5 123 aa7.31□□□□□ -1.24
ATG4B-208ENST00000419606 RETNLBQ9BQ08 111 aa7.31□□□□□ -1.24
ATG4B-208ENST00000419606 VPS25Q9BRG1 176 aa7.31□□□□□ -1.24
ATG4B-208ENST00000419606 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG4B-208ENST00000419606 ETDBQ3ZM63 59 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG4B-208ENST00000419606 Q6Q795 121 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG4B-208ENST00000419606 A0A087WSZ3 146 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG4B-208ENST00000419606 RPS29P62273 56 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
ATG4B-208ENST00000419606 LIMD2Q9BT23 127 aa7.25□□□□□ -1.25
ATG4B-208ENST00000419606 HERC1Q15751 4861 aa7.24□□□□□ -1.25
ATG4B-208ENST00000419606 PDE6GP18545 87 aa7.24□□□□□ -1.25
ATG4B-208ENST00000419606 Q5XG85 94 aa7.24□□□□□ -1.25
ATG4B-208ENST00000419606 C1orf195Q5TG92 126 aa7.23□□□□□ -1.25
ATG4B-208ENST00000419606 PRR4Q16378 134 aa7.2□□□□□ -1.26
ATG4B-208ENST00000419606 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa7.2□□□□□ -1.26
ATG4B-208ENST00000419606 Q96NJ1 140 aa7.2□□□□□ -1.26
ATG4B-208ENST00000419606 SS18L2Q9UHA2 77 aa7.19□□□□□ -1.26
ATG4B-208ENST00000419606 DEFB116Q30KQ4 102 aa7.18□□□□□ -1.26
ATG4B-208ENST00000419606 LINC00472Q9H8W2 130 aa7.16□□□□□ -1.26
ATG4B-208ENST00000419606 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa7.15□□□□□ -1.26
ATG4B-208ENST00000419606 A0A1B0GW54 56 aa7.15□□□□□ -1.26
ATG4B-208ENST00000419606 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa7.14□□□□□ -1.27
ATG4B-208ENST00000419606 LINC00846Q9NV44 126 aa7.14□□□□□ -1.27
ATG4B-208ENST00000419606 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
ATG4B-208ENST00000419606 NREPQ16612 68 aa7.12□□□□□ -1.27
ATG4B-208ENST00000419606 IGKV4-1P06312 121 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG4B-208ENST00000419606 LPAP08519 4548 aa7.1□□□□□ -1.27
ATG4B-208ENST00000419606 Q6ZVQ6 151 aa7.1□□□□□ -1.27
ATG4B-208ENST00000419606 SIGMAR1Q99720 223 aa7.1□□□□□ -1.27
ATG4B-208ENST00000419606 C9orf92A6NGG3 77 aa7.08□□□□□ -1.28
ATG4B-208ENST00000419606 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa7.08□□□□□ -1.28
ATG4B-208ENST00000419606 HMCN2Q8NDA2 5059 aa7.08□□□□□ -1.28
ATG4B-208ENST00000419606 TPRXLQ17RH7 258 aa7.05□□□□□ -1.28
ATG4B-208ENST00000419606 UBL5Q9BZL1 73 aa7.05□□□□□ -1.28
ATG4B-208ENST00000419606 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa7.04□□□□□ -1.28
ATG4B-208ENST00000419606 DSCR10P59022 87 aa7.04□□□□□ -1.28
ATG4B-208ENST00000419606 J3KT08 172 aa7.03□□□□□ -1.28
ATG4B-208ENST00000419606 ACYP1P07311 99 aa7.03□□□□□ -1.28
ATG4B-208ENST00000419606 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa7.03□□□□□ -1.28
ATG4B-208ENST00000419606 UBR4Q5T4S7 5183 aa7.03□□□□□ -1.28
ATG4B-208ENST00000419606 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa7.02□□□□□ -1.29
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