RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412806.1

SH3BP5-204, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP5, Length 1,900 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-204ENST00000412806 FAM30AQ9NZY2 134 aa13.25□□□□□ -0.29
SH3BP5-204ENST00000412806 Q6ZVQ6 151 aa13.25□□□□□ -0.29
SH3BP5-204ENST00000412806 SPRR1BP22528 89 aa13.23□□□□□ -0.29
SH3BP5-204ENST00000412806 F8WEM9 126 aa13.22□□□□□ -0.29
SH3BP5-204ENST00000412806 A0A1W2PNM2 257 aa13.21□□□□□ -0.29
SH3BP5-204ENST00000412806 KRTAP10-1P60331 282 aa13.2□□□□□ -0.3
SH3BP5-204ENST00000412806 LCE6AA0A183 80 aa13.19□□□□□ -0.3
SH3BP5-204ENST00000412806 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa13.19□□□□□ -0.3
SH3BP5-204ENST00000412806 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa13.19□□□□□ -0.3
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SH3BP5-204ENST00000412806 IGFL1Q6UW32 110 aa13.16□□□□□ -0.3
SH3BP5-204ENST00000412806 Q6ZSA8 131 aa13.16□□□□□ -0.3
SH3BP5-204ENST00000412806 HAMPP81172 84 aa13.15□□□□□ -0.3
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SH3BP5-204ENST00000412806 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa13.14□□□□□ -0.31
SH3BP5-204ENST00000412806 SCXQ7RTU7 201 aa13.14□□□□□ -0.31
SH3BP5-204ENST00000412806 SPRR4Q96PI1 79 aa13.13□□□□□ -0.31
SH3BP5-204ENST00000412806 A0A087WVE0 104 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF861PO60384 105 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP5-204ENST00000412806 A0A1B0GW54 56 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP5-204ENST00000412806 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
SH3BP5-204ENST00000412806 NREPQ16612 68 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP5-204ENST00000412806 ANAPC13Q9BS18 74 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP5-204ENST00000412806 IGLV7-43P04211 117 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP5-204ENST00000412806 CRYGAP11844 174 aa13.07□□□□□ -0.32
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SH3BP5-204ENST00000412806 LINC00483Q53H64 154 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
SH3BP5-204ENST00000412806 LINC00336Q6ZUF6 198 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP5-204ENST00000412806 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa13□□□□□ -0.33
SH3BP5-204ENST00000412806 ANAPC11Q9NYG5 84 aa12.99□□□□□ -0.33
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SH3BP5-204ENST00000412806 C9orf153Q5TBE3 101 aa12.98□□□□□ -0.33
SH3BP5-204ENST00000412806 A0A087WSZ3 146 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP5-204ENST00000412806 LRP1BQ9NZR2 4599 aa12.95□□□□□ -0.34
SH3BP5-204ENST00000412806 RYR2Q92736 4967 aa12.95□□□□□ -0.34
SH3BP5-204ENST00000412806 PKHD1P08F94 4074 aa12.95□□□□□ -0.34
SH3BP5-204ENST00000412806 A0A1B0GVY2 172 aa12.95□□□□□ -0.34
SH3BP5-204ENST00000412806 Q8N9L7 120 aa12.94□□□□□ -0.34
SH3BP5-204ENST00000412806 ATOX1O00244 68 aa12.92□□□□□ -0.34
SH3BP5-204ENST00000412806 IGKV4-1P06312 121 aa12.91□□□□□ -0.34
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SH3BP5-204ENST00000412806 CCDC179H3BU77 68 aa12.87□□□□□ -0.35
SH3BP5-204ENST00000412806 DSCR10P59022 87 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP5-204ENST00000412806 DEFB116Q30KQ4 102 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP5-204ENST00000412806 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
SH3BP5-204ENST00000412806 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.35
SH3BP5-204ENST00000412806 HRCT1Q6UXD1 115 aa12.82□□□□□ -0.36
SH3BP5-204ENST00000412806 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa12.82□□□□□ -0.36
SH3BP5-204ENST00000412806 K7EQZ3 153 aa12.8□□□□□ -0.36
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SH3BP5-204ENST00000412806 LINC00472Q9H8W2 130 aa12.78□□□□□ -0.36
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SH3BP5-204ENST00000412806 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP5-204ENST00000412806 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP5-204ENST00000412806 Q96NJ1 140 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP5-204ENST00000412806 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP5-204ENST00000412806 FAM229BQ4G0N7 80 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP5-204ENST00000412806 SS18L2Q9UHA2 77 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP5-204ENST00000412806 TRAV7A0A075B6U4 112 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP5-204ENST00000412806 SMIM20Q8N5G0 67 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP5-204ENST00000412806 A8MWP4 228 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP5-204ENST00000412806 HCG22E2RYF7 251 aa12.63□□□□□ -0.39
SH3BP5-204ENST00000412806 J3KT08 172 aa12.63□□□□□ -0.39
SH3BP5-204ENST00000412806 CD164Q04900 197 aa12.63□□□□□ -0.39
SH3BP5-204ENST00000412806 SPINK6Q6UWN8 80 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP5-204ENST00000412806 PRR15Q8IV56 129 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP5-204ENST00000412806 OCR1Q9BZK8 76 aa12.59□□□□□ -0.39
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SH3BP5-204ENST00000412806 WFDC13Q8IUB5 93 aa12.58□□□□□ -0.4
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SH3BP5-204ENST00000412806 RYR3Q15413 4870 aa12.56□□□□□ -0.4
SH3BP5-204ENST00000412806 CYSTM1Q9H1C7 97 aa12.56□□□□□ -0.4
SH3BP5-204ENST00000412806 NDUFB1O75438 58 aa12.54□□□□□ -0.4
SH3BP5-204ENST00000412806 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP12.53□□□□□ -0.4
SH3BP5-204ENST00000412806 C20orf197Q8N268 126 aa12.53□□□□□ -0.4
SH3BP5-204ENST00000412806 FAT1Q14517 4588 aa12.52□□□□□ -0.4
SH3BP5-204ENST00000412806 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa12.5□□□□□ -0.41
SH3BP5-204ENST00000412806 CASC2Q6XLA1 102 aa12.5□□□□□ -0.41
SH3BP5-204ENST00000412806 TYMSOSQ8TAI1 123 aa12.5□□□□□ -0.41
SH3BP5-204ENST00000412806 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa12.48□□□□□ -0.41
SH3BP5-204ENST00000412806 A0A1B0GVX0 72 aa12.47□□□□□ -0.41
SH3BP5-204ENST00000412806 CDK2AP2O75956 126 aa12.46□□□□□ -0.42
SH3BP5-204ENST00000412806 PRR26Q8N8Z3 221 aa12.46□□□□□ -0.42
SH3BP5-204ENST00000412806 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa12.45□□□□□ -0.42
SH3BP5-204ENST00000412806 Q5XG85 94 aa12.44□□□□□ -0.42
SH3BP5-204ENST00000412806 C8orf17Q9NRJ1 99 aa12.43□□□□□ -0.42
SH3BP5-204ENST00000412806 SNURFQ9Y675 71 aa12.43□□□□□ -0.42
SH3BP5-204ENST00000412806 KLKP1Q107X0 134 aa12.42□□□□□ -0.42
SH3BP5-204ENST00000412806 hDV103S1A0JD37 113 aa12.41□□□□□ -0.42
SH3BP5-204ENST00000412806 TMEM254Q8TBM7 123 aa12.41□□□□□ -0.42
SH3BP5-204ENST00000412806 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa12.4□□□□□ -0.42
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