RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411000.1

RNU6-172P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 172, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-172P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-172P-201ENST00000411000 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP-4.28□□□□□ -3.09
RNU6-172P-201ENST00000411000 ALKAL2Q6UX46 152 aa-4.28□□□□□ -3.09
RNU6-172P-201ENST00000411000 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa-4.29□□□□□ -3.1
RNU6-172P-201ENST00000411000 TPM1P09493 284 aa-4.29□□□□□ -3.1
RNU6-172P-201ENST00000411000 TOMM20LQ6UXN7 152 aa-4.29□□□□□ -3.1
RNU6-172P-201ENST00000411000 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP-4.29□□□□□ -3.1
RNU6-172P-201ENST00000411000 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP-4.29□□□□□ -3.1
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RNU6-172P-201ENST00000411000 TPM2P07951 284 aa-4.3□□□□□ -3.1
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RNU6-172P-201ENST00000411000 OVOS2Q6IE36 1432 aa-4.3□□□□□ -3.1
RNU6-172P-201ENST00000411000 CFTRP13569 1480 aa-4.3□□□□□ -3.1
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RNU6-172P-201ENST00000411000 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa-4.31□□□□□ -3.1
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RNU6-172P-201ENST00000411000 MUSTN1Q8IVN3 82 aa-4.32□□□□□ -3.1
RNU6-172P-201ENST00000411000 ATPIF1Q9UII2 106 aa-4.32□□□□□ -3.1
RNU6-172P-201ENST00000411000 CENPFP49454 3210 aa-4.33□□□□□ -3.1
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa-4.33□□□□□ -3.1
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RNU6-172P-201ENST00000411000 SAMD13Q5VXD3 122 aa-4.33□□□□□ -3.1
RNU6-172P-201ENST00000411000 RGPD1P0DJD0 1748 aa-4.34□□□□□ -3.1
RNU6-172P-201ENST00000411000 NAP1L6A6NFF2 107 aa-4.34□□□□□ -3.1
RNU6-172P-201ENST00000411000 PMCHL1Q16048 86 aa-4.34□□□□□ -3.1
RNU6-172P-201ENST00000411000 MORN2Q502X0 79 aa-4.34□□□□□ -3.1
RNU6-172P-201ENST00000411000 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa-4.34□□□□□ -3.1
RNU6-172P-201ENST00000411000 DOT1LQ8TEK3 1739 aa-4.35□□□□□ -3.11
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCNB3Q8WWL7 1395 aa-4.35□□□□□ -3.11
RNU6-172P-201ENST00000411000 J3QR89 54 aa-4.35□□□□□ -3.11
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RNU6-172P-201ENST00000411000 GINS2Q9Y248 185 aa-4.35□□□□□ -3.11
RNU6-172P-201ENST00000411000 ABCC2Q92887 1545 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-172P-201ENST00000411000 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRAV21A0A0B4J279 112 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-172P-201ENST00000411000 HMGN3Q15651 99 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-172P-201ENST00000411000 CHD1O14646 1710 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-172P-201ENST00000411000 ITSN1Q15811 1721 aa-4.36□□□□□ -3.11
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RNU6-172P-201ENST00000411000 ACBD7Q8N6N7 88 aa-4.37□□□□□ -3.11
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RNU6-172P-201ENST00000411000 FCER1GP30273 86 aa-4.38□□□□□ -3.11
RNU6-172P-201ENST00000411000 PPP1R14BQ96C90 147 aa-4.38□□□□□ -3.11
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RNU6-172P-201ENST00000411000 ASPMQ8IZT6 3477 aa-4.39□□□□□ -3.11
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RNU6-172P-201ENST00000411000 CATR1Q13166 79 aa-4.4□□□□□ -3.11
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RNU6-172P-201ENST00000411000 M0QX08 132 aa-4.42□□□□□ -3.12
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RNU6-172P-201ENST00000411000 CCDC153Q494R4 210 aa-4.42□□□□□ -3.12
RNU6-172P-201ENST00000411000 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP-4.42□□□□□ -3.12
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RNU6-172P-201ENST00000411000 LTN1O94822 1766 aa-4.44□□□□□ -3.12
RNU6-172P-201ENST00000411000 APOC2P02655 101 aa-4.44□□□□□ -3.12
RNU6-172P-201ENST00000411000 CRIP1P50238 77 aa-4.44□□□□□ -3.12
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRIQKQ629K1 86 aa-4.44□□□□□ -3.12
RNU6-172P-201ENST00000411000 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP-4.44□□□□□ -3.12
RNU6-172P-201ENST00000411000 M0R2Z0 102 aa-4.45□□□□□ -3.12
RNU6-172P-201ENST00000411000 UQCRHP07919 91 aa-4.45□□□□□ -3.12
RNU6-172P-201ENST00000411000 SMIM3Q9BZL3 60 aa-4.45□□□□□ -3.12
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RNU6-172P-201ENST00000411000 S100GP29377 79 aa-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-172P-201ENST00000411000 COPZ1P61923 177 aa-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-172P-201ENST00000411000 ETDBQ3ZM63 59 aa-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-172P-201ENST00000411000 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-172P-201ENST00000411000 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-172P-201ENST00000411000 KIF14Q15058 1648 aa-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-172P-201ENST00000411000 OOSP1A8MZH6 123 aa-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-172P-201ENST00000411000 CYB5AP00167 134 aa-4.47□□□□□ -3.13
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