RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390394.3

TRBV20-1-201, Transcript of T cell receptor beta variable 20-1, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene TRBV20-1, Length 413 nt, Biotype TR V gene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20-1-201ENST00000390394 PRR26Q8N8Z3 221 aa5.75□□□□□ -1.49
TRBV20-1-201ENST00000390394 CLEC2BQ92478 149 aa5.75□□□□□ -1.49
TRBV20-1-201ENST00000390394 FAM218AQ96MZ4 157 aa5.75□□□□□ -1.49
TRBV20-1-201ENST00000390394 ORMDL1Q9P0S3 153 aa5.75□□□□□ -1.49
TRBV20-1-201ENST00000390394 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa5.74□□□□□ -1.49
TRBV20-1-201ENST00000390394 TAX1BP3O14907 124 aa5.74□□□□□ -1.49
TRBV20-1-201ENST00000390394 ANAPC11Q9NYG5 84 aa5.74□□□□□ -1.49
TRBV20-1-201ENST00000390394 A0A087X002 238 aa5.73□□□□□ -1.49
TRBV20-1-201ENST00000390394 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa5.73□□□□□ -1.49
TRBV20-1-201ENST00000390394 KRTAP10-8P60410 259 aa5.73□□□□□ -1.49
TRBV20-1-201ENST00000390394 C4orf48Q5BLP8 95 aa5.73□□□□□ -1.49
TRBV20-1-201ENST00000390394 C9orf153Q5TBE3 101 aa5.73□□□□□ -1.49
TRBV20-1-201ENST00000390394 Q8NBF4 154 aa5.73□□□□□ -1.49
TRBV20-1-201ENST00000390394 A0A1W2PPM0 123 aa5.72□□□□□ -1.49
TRBV20-1-201ENST00000390394 SPAG11AQ6PDA7 123 aa5.72□□□□□ -1.49
TRBV20-1-201ENST00000390394 Q8N377 158 aa5.72□□□□□ -1.49
TRBV20-1-201ENST00000390394 FAT3Q8TDW7 4589 aa5.71□□□□□ -1.49
TRBV20-1-201ENST00000390394 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
TRBV20-1-201ENST00000390394 MOBPQ13875 183 aa5.71□□□□□ -1.5
TRBV20-1-201ENST00000390394 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
TRBV20-1-201ENST00000390394 TCL1BO95988 128 aa5.7□□□□□ -1.5
TRBV20-1-201ENST00000390394 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa5.7□□□□□ -1.5
TRBV20-1-201ENST00000390394 Q6JHZ5 121 aa5.7□□□□□ -1.5
TRBV20-1-201ENST00000390394 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
TRBV20-1-201ENST00000390394 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
TRBV20-1-201ENST00000390394 UBE2V1Q13404 147 aa5.69□□□□□ -1.5
TRBV20-1-201ENST00000390394 C3orf22Q8N5N4 141 aa5.69□□□□□ -1.5
TRBV20-1-201ENST00000390394 LINC00304Q8N9R0 145 aa5.69□□□□□ -1.5
TRBV20-1-201ENST00000390394 RNF213Q63HN8 5207 aa5.68□□□□□ -1.5
TRBV20-1-201ENST00000390394 MT1HL1P0DM35 61 aa5.68□□□□□ -1.5
TRBV20-1-201ENST00000390394 SMIM29Q86T20 159 aa5.68□□□□□ -1.5
TRBV20-1-201ENST00000390394 SPCS1Q9Y6A9 102 aa5.68□□□□□ -1.5
TRBV20-1-201ENST00000390394 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa5.67□□□□□ -1.5
TRBV20-1-201ENST00000390394 SPINK1P00995 79 aa5.67□□□□□ -1.5
TRBV20-1-201ENST00000390394 BAALC-AS2P0C853 105 aa5.67□□□□□ -1.5
TRBV20-1-201ENST00000390394 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa5.67□□□□□ -1.5
TRBV20-1-201ENST00000390394 H3BMG7 143 aa5.66□□□□□ -1.5
TRBV20-1-201ENST00000390394 CD164Q04900 197 aa5.66□□□□□ -1.5
TRBV20-1-201ENST00000390394 C9JAW5 83 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV20-1-201ENST00000390394 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV20-1-201ENST00000390394 H3BT86 120 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV20-1-201ENST00000390394 RPS29P62273 56 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
TRBV20-1-201ENST00000390394 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV20-1-201ENST00000390394 ANKRD29Q8N6D5 301 aa5.65□□□□□ -1.5
TRBV20-1-201ENST00000390394 LIMD2Q9BT23 127 aa5.64□□□□□ -1.51
TRBV20-1-201ENST00000390394 K7EP34 96 aa5.63□□□□□ -1.51
TRBV20-1-201ENST00000390394 RBM3P98179 157 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
TRBV20-1-201ENST00000390394 DSCR8Q96T75 97 aa5.63□□□□□ -1.51
TRBV20-1-201ENST00000390394 PDE6GP18545 87 aa5.61□□□□□ -1.51
TRBV20-1-201ENST00000390394 TNXBP22105 4242 aa5.61□□□□□ -1.51
TRBV20-1-201ENST00000390394 IGFL1Q6UW32 110 aa5.61□□□□□ -1.51
TRBV20-1-201ENST00000390394 LRP2P98164 4655 aa5.61□□□□□ -1.51
TRBV20-1-201ENST00000390394 Q6Q795 121 aa5.6□□□□□ -1.51
TRBV20-1-201ENST00000390394 TEN1Q86WV5 123 aa5.6□□□□□ -1.51
TRBV20-1-201ENST00000390394 SS18L2Q9UHA2 77 aa5.59□□□□□ -1.51
TRBV20-1-201ENST00000390394 F8W1H4 67 aa5.58□□□□□ -1.52
TRBV20-1-201ENST00000390394 Q5XG85 94 aa5.58□□□□□ -1.52
TRBV20-1-201ENST00000390394 HRCT1Q6UXD1 115 aa5.58□□□□□ -1.52
TRBV20-1-201ENST00000390394 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa5.57□□□□□ -1.52
TRBV20-1-201ENST00000390394 A0A1B0GW54 56 aa5.57□□□□□ -1.52
TRBV20-1-201ENST00000390394 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa5.56□□□□□ -1.52
TRBV20-1-201ENST00000390394 A0A1B0GV72 72 aa5.55□□□□□ -1.52
TRBV20-1-201ENST00000390394 CCKP06307 115 aa5.55□□□□□ -1.52
TRBV20-1-201ENST00000390394 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa5.54□□□□□ -1.52
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TRBV20-1-201ENST00000390394 MTURNQ8N3F0 131 aa5.54□□□□□ -1.52
TRBV20-1-201ENST00000390394 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa5.54□□□□□ -1.52
TRBV20-1-201ENST00000390394 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa5.53□□□□□ -1.52
TRBV20-1-201ENST00000390394 VPS25Q9BRG1 176 aa5.53□□□□□ -1.52
TRBV20-1-201ENST00000390394 A0A0G2JQZ4 141 aa5.52□□□□□ -1.53
TRBV20-1-201ENST00000390394 C14orf132Q9NPU4 83 aa5.52□□□□□ -1.53
TRBV20-1-201ENST00000390394 PRO0461Q9UI25 63 aa5.52□□□□□ -1.53
TRBV20-1-201ENST00000390394 A0A087WSZ3 146 aa5.51□□□□□ -1.53
TRBV20-1-201ENST00000390394 A0A1W2PNM2 257 aa5.51□□□□□ -1.53
TRBV20-1-201ENST00000390394 PRR4Q16378 134 aa5.51□□□□□ -1.53
TRBV20-1-201ENST00000390394 Q6ZQT0 140 aa5.51□□□□□ -1.53
TRBV20-1-201ENST00000390394 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
TRBV20-1-201ENST00000390394 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa5.48□□□□□ -1.53
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TRBV20-1-201ENST00000390394 RETNLBQ9BQ08 111 aa5.48□□□□□ -1.53
TRBV20-1-201ENST00000390394 ETDBQ3ZM63 59 aa5.46□□□□□ -1.54
TRBV20-1-201ENST00000390394 C1orf195Q5TG92 126 aa5.46□□□□□ -1.54
TRBV20-1-201ENST00000390394 J3KT08 172 aa5.44□□□□□ -1.54
TRBV20-1-201ENST00000390394 NREPQ16612 68 aa5.44□□□□□ -1.54
TRBV20-1-201ENST00000390394 TPRXLQ17RH7 258 aa5.44□□□□□ -1.54
TRBV20-1-201ENST00000390394 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa5.42□□□□□ -1.54
TRBV20-1-201ENST00000390394 IGKV4-1P06312 121 aa5.41□□□□□ -1.54
TRBV20-1-201ENST00000390394 ACYP1P07311 99 aa5.41□□□□□ -1.54
TRBV20-1-201ENST00000390394 UBL5Q9BZL1 73 aa5.41□□□□□ -1.54
TRBV20-1-201ENST00000390394 CDIP1Q9H305 208 aa5.41□□□□□ -1.54
TRBV20-1-201ENST00000390394 LINC00472Q9H8W2 130 aa5.41□□□□□ -1.54
TRBV20-1-201ENST00000390394 NDUFB1O75438 58 aa5.4□□□□□ -1.54
TRBV20-1-201ENST00000390394 SIGMAR1Q99720 223 aa5.4□□□□□ -1.54
TRBV20-1-201ENST00000390394 FAT4Q6V0I7 4981 aa5.4□□□□□ -1.55
TRBV20-1-201ENST00000390394 J3QR89 54 aa5.39□□□□□ -1.55
TRBV20-1-201ENST00000390394 Q96NJ1 140 aa5.39□□□□□ -1.55
TRBV20-1-201ENST00000390394 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa5.37□□□□□ -1.55
TRBV20-1-201ENST00000390394 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa5.37□□□□□ -1.55
TRBV20-1-201ENST00000390394 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa5.37□□□□□ -1.55
TRBV20-1-201ENST00000390394 BPY2O14599 106 aa5.35□□□□□ -1.55
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