RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 SPRR4Q96PI1 79 aa4.69□□□□□ -1.66
CTPS1-201ENST00000372616 PMAIP1Q13794 54 aa4.68□□□□□ -1.66
CTPS1-201ENST00000372616 Q8N9L7 120 aa4.68□□□□□ -1.66
CTPS1-201ENST00000372616 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
CTPS1-201ENST00000372616 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.68□□□□□ -1.66
CTPS1-201ENST00000372616 MP68P56378 58 aa4.68□□□□□ -1.66
CTPS1-201ENST00000372616 TLX1NBP0CAT3 122 aa4.67□□□□□ -1.66
CTPS1-201ENST00000372616 C1orf137Q5JT78 98 aa4.67□□□□□ -1.66
CTPS1-201ENST00000372616 Q8N377 158 aa4.67□□□□□ -1.66
CTPS1-201ENST00000372616 C1orf64Q8NEQ6 169 aa4.67□□□□□ -1.66
CTPS1-201ENST00000372616 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa4.67□□□□□ -1.66
CTPS1-201ENST00000372616 DEFB4AO15263 64 aa4.67□□□□□ -1.66
CTPS1-201ENST00000372616 Q6ZRX8 168 aa4.67□□□□□ -1.66
CTPS1-201ENST00000372616 CMYA5Q8N3K9 4069 aa4.66□□□□□ -1.66
CTPS1-201ENST00000372616 MGAM2Q2M2H8 2515 aa4.66□□□□□ -1.66
CTPS1-201ENST00000372616 HCG22E2RYF7 251 aa4.66□□□□□ -1.66
CTPS1-201ENST00000372616 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
CTPS1-201ENST00000372616 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
CTPS1-201ENST00000372616 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa4.66□□□□□ -1.66
CTPS1-201ENST00000372616 B9D2Q9BPU9 175 aa4.66□□□□□ -1.66
CTPS1-201ENST00000372616 RETNQ9HD89 108 aa4.66□□□□□ -1.66
CTPS1-201ENST00000372616 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa4.66□□□□□ -1.66
CTPS1-201ENST00000372616 SYCNQ0VAF6 134 aa4.65□□□□□ -1.66
CTPS1-201ENST00000372616 LCE4AQ5TA78 99 aa4.65□□□□□ -1.66
CTPS1-201ENST00000372616 C11orf45Q8TAV5 145 aa4.65□□□□□ -1.66
CTPS1-201ENST00000372616 LIMD2Q9BT23 127 aa4.65□□□□□ -1.66
CTPS1-201ENST00000372616 DNAH3Q8TD57 4116 aa4.65□□□□□ -1.67
CTPS1-201ENST00000372616 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa4.64□□□□□ -1.67
CTPS1-201ENST00000372616 UBE2BP63146 152 aa4.64□□□□□ -1.67
CTPS1-201ENST00000372616 Q6ZRP5 223 aa4.64□□□□□ -1.67
CTPS1-201ENST00000372616 C15orf56Q8N910 161 aa4.64□□□□□ -1.67
CTPS1-201ENST00000372616 DEFB105AQ8NG35 78 aa4.64□□□□□ -1.67
CTPS1-201ENST00000372616 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
CTPS1-201ENST00000372616 A0A1W2PNM2 257 aa4.63□□□□□ -1.67
CTPS1-201ENST00000372616 RPL37AP8A6NKH3 93 aa4.63□□□□□ -1.67
CTPS1-201ENST00000372616 HTN3P15516 51 aa4.63□□□□□ -1.67
CTPS1-201ENST00000372616 SPRR1AP35321 89 aa4.63□□□□□ -1.67
CTPS1-201ENST00000372616 PRAC1Q96KF2 57 aa4.63□□□□□ -1.67
CTPS1-201ENST00000372616 TRAV22A0A0B4J277 110 aa4.63□□□□□ -1.67
CTPS1-201ENST00000372616 PSCAO43653 123 aa4.63□□□□□ -1.67
CTPS1-201ENST00000372616 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa4.63□□□□□ -1.67
CTPS1-201ENST00000372616 C7orf33Q8WU49 177 aa4.63□□□□□ -1.67
CTPS1-201ENST00000372616 UBE2AP49459 152 aa4.62□□□□□ -1.67
CTPS1-201ENST00000372616 DSCR10P59022 87 aa4.62□□□□□ -1.67
CTPS1-201ENST00000372616 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa4.62□□□□□ -1.67
CTPS1-201ENST00000372616 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
CTPS1-201ENST00000372616 LINC01556Q5JQF7 62 aa4.62□□□□□ -1.67
CTPS1-201ENST00000372616 Q9BRP9 147 aa4.62□□□□□ -1.67
CTPS1-201ENST00000372616 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa4.61□□□□□ -1.67
CTPS1-201ENST00000372616 CD164Q04900 197 aa4.61□□□□□ -1.67
CTPS1-201ENST00000372616 LCE1DQ5T752 114 aa4.61□□□□□ -1.67
CTPS1-201ENST00000372616 K7EQZ3 153 aa4.6□□□□□ -1.67
CTPS1-201ENST00000372616 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa4.59□□□□□ -1.67
CTPS1-201ENST00000372616 WFDC10BQ8IUB3 73 aa4.59□□□□□ -1.67
CTPS1-201ENST00000372616 LINC00208Q96KT6 92 aa4.59□□□□□ -1.67
CTPS1-201ENST00000372616 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa4.58□□□□□ -1.68
CTPS1-201ENST00000372616 PSPHP1O15172 72 aa4.58□□□□□ -1.68
CTPS1-201ENST00000372616 LINC00588Q9Y4M8 146 aa4.57□□□□□ -1.68
CTPS1-201ENST00000372616 TENM3Q9P273 2699 aa4.57□□□□□ -1.68
CTPS1-201ENST00000372616 NDUFS5O43920 106 aa4.56□□□□□ -1.68
CTPS1-201ENST00000372616 REG3GQ6UW15 175 aa4.56□□□□□ -1.68
CTPS1-201ENST00000372616 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa4.56□□□□□ -1.68
CTPS1-201ENST00000372616 DNAH10OSP0CZ25 163 aa4.56□□□□□ -1.68
CTPS1-201ENST00000372616 LRCOL1A6NCL2 159 aa4.55□□□□□ -1.68
CTPS1-201ENST00000372616 H0Y9P7 68 aa4.55□□□□□ -1.68
CTPS1-201ENST00000372616 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa4.55□□□□□ -1.68
CTPS1-201ENST00000372616 NUPR2A6NF83 97 aa4.55□□□□□ -1.68
CTPS1-201ENST00000372616 A8MUN3 132 aa4.55□□□□□ -1.68
CTPS1-201ENST00000372616 Q5VV11 94 aa4.55□□□□□ -1.68
CTPS1-201ENST00000372616 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.55□□□□□ -1.68
CTPS1-201ENST00000372616 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa4.54□□□□□ -1.68
CTPS1-201ENST00000372616 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa4.54□□□□□ -1.68
CTPS1-201ENST00000372616 CASC2Q6XLA1 102 aa4.54□□□□□ -1.68
CTPS1-201ENST00000372616 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
CTPS1-201ENST00000372616 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
CTPS1-201ENST00000372616 IGFL1Q6UW32 110 aa4.53□□□□□ -1.68
CTPS1-201ENST00000372616 A8MWP4 228 aa4.53□□□□□ -1.68
CTPS1-201ENST00000372616 WFDC13Q8IUB5 93 aa4.53□□□□□ -1.68
CTPS1-201ENST00000372616 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.53□□□□□ -1.68
CTPS1-201ENST00000372616 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa4.53□□□□□ -1.68
CTPS1-201ENST00000372616 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa4.51□□□□□ -1.69
CTPS1-201ENST00000372616 A0A087WSZ3 146 aa4.51□□□□□ -1.69
CTPS1-201ENST00000372616 C9orf163Q8N9P6 203 aa4.51□□□□□ -1.69
CTPS1-201ENST00000372616 PRR15LQ9BU68 103 aa4.51□□□□□ -1.69
CTPS1-201ENST00000372616 COL7A1Q02388 2944 aa4.51□□□□□ -1.69
CTPS1-201ENST00000372616 H0Y9J4 135 aa4.51□□□□□ -1.69
CTPS1-201ENST00000372616 PRR4Q16378 134 aa4.51□□□□□ -1.69
CTPS1-201ENST00000372616 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
CTPS1-201ENST00000372616 STAB2Q8WWQ8 2551 aa4.5□□□□□ -1.69
CTPS1-201ENST00000372616 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
CTPS1-201ENST00000372616 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.5□□□□□ -1.69
CTPS1-201ENST00000372616 A6NED7 52 aa4.5□□□□□ -1.69
CTPS1-201ENST00000372616 SPRR1BP22528 89 aa4.5□□□□□ -1.69
CTPS1-201ENST00000372616 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa4.5□□□□□ -1.69
CTPS1-201ENST00000372616 APLNQ9ULZ1 77 aa4.5□□□□□ -1.69
CTPS1-201ENST00000372616 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa4.49□□□□□ -1.69
CTPS1-201ENST00000372616 DNAH9Q9NYC9 4486 aa4.49□□□□□ -1.69
CTPS1-201ENST00000372616 MOBPQ13875 183 aa4.48□□□□□ -1.69
CTPS1-201ENST00000372616 COA5Q86WW8 74 aa4.48□□□□□ -1.69
CTPS1-201ENST00000372616 FAM168BA1KXE4 195 aa4.48□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.9 ms