RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362899.2

SNORD3E-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 3E, humanhuman

BASIC

Gene SNORD3E, Length 217 nt, Biotype snoRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD3E-201ENST00000362899 TTC37Q6PGP7 1564 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD3E-201ENST00000362899 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD3E-201ENST00000362899 MAST1Q9Y2H9 1570 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD3E-201ENST00000362899 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD3E-201ENST00000362899 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD3E-201ENST00000362899 K7EQZ3 153 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD3E-201ENST00000362899 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
SNORD3E-201ENST00000362899 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD3E-201ENST00000362899 C14orf144Q96I85 54 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD3E-201ENST00000362899 CGREF1Q99674 301 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD3E-201ENST00000362899 ARHGAP5Q13017 1502 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD3E-201ENST00000362899 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD3E-201ENST00000362899 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP-0.1□□□□□ -2.42
SNORD3E-201ENST00000362899 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP-0.1□□□□□ -2.42
SNORD3E-201ENST00000362899 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa-0.1□□□□□ -2.42
SNORD3E-201ENST00000362899 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa-0.1□□□□□ -2.42
SNORD3E-201ENST00000362899 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP-0.1□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 SCN7AQ01118 1682 aa-0.1□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 TMEM218A2RU14 115 aa-0.1□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 C7orf77A4D0Y5 90 aa-0.1□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa-0.1□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 GNGT2O14610 69 aa-0.1□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 MT1BP07438 61 aa-0.1□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 CACFD1Q9UGQ2 172 aa-0.1□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 EFCAB5A4FU69 1503 aa-0.1□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP-0.1□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP-0.1□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 PTPN23Q9H3S7 1636 aa-0.1□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 TIAM2Q8IVF5 1701 aa-0.1□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 GAPVD1Q14C86 1478 aa-0.1□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 CCDC18Q5T9S5 1454 aa-0.1□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa-0.11□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 IQGAP1P46940 1657 aa-0.11□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 UGGT2Q9NYU1 1516 aa-0.11□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa-0.11□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 A0A087WVE0 104 aa-0.11□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 A0A0G2JND7 137 aa-0.11□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 M0R2T5 61 aa-0.11□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 SPINK4O60575 86 aa-0.11□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 MT-ATP8P03928 68 aa-0.11□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 MT1HP80294 61 aa-0.11□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 KLK9Q2XQG4 91 aa-0.11□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa-0.11□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 DEFB105AQ8NG35 78 aa-0.11□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa-0.11□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 TRGV9Q99603 122 aa-0.11□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 VAMP8Q9BV40 100 aa-0.11□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 ALS2Q96Q42 1657 aa-0.11□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 LTN1O94822 1766 aa-0.11□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 TRPM2O94759 1503 aa-0.12□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 CLTCL1P53675 1640 aa-0.12□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa-0.12□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 LRRC37AA6NMS7 1700 aa-0.12□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa-0.12□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 A0A1B0GU69 56 aa-0.12□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 H7BZZ5 65 aa-0.12□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 NDUFC1O43677 76 aa-0.12□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 COX8AP10176 69 aa-0.12□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 RBP2P50120 134 aa-0.12□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 S100A10P60903 97 aa-0.12□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 PMCHL1Q16048 86 aa-0.12□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa-0.12□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 USMG5Q96IX5 58 aa-0.12□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 TCEAL7Q9BRU2 100 aa-0.12□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 FXYD6Q9H0Q3 95 aa-0.12□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 CRIPTQ9P021 101 aa-0.12□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 APLNQ9ULZ1 77 aa-0.12□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 ABCA8O94911 1581 aa-0.12□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP-0.13□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP-0.13□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 ERICH3Q5RHP9 1530 aa-0.13□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP-0.13□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP-0.13□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 MYH4Q9Y623 1939 aa-0.13□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP-0.13□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 LOC730098B7Z3J9 87 aa-0.13□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa-0.13□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 MPC2O95563 127 aa-0.13□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 MT1HL1P0DM35 61 aa-0.13□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 PSMG4Q5JS54 123 aa-0.13□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 DEFB107AQ8IZN7 70 aa-0.13□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 ACBD7Q8N6N7 88 aa-0.13□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 SERP2Q8N6R1 65 aa-0.13□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 PMCHL2Q9BQD1 86 aa-0.13□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 AP4S1Q9Y587 144 aa-0.13□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 C4AP0C0L4 1744 aa-0.13□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 C4BP0C0L5 1744 aa-0.13□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP-0.13□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 PIK3C2BO00750 1634 aa-0.13□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 MROH2BQ7Z745 1585 aa-0.14□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 CCDC88BA6NC98 1476 aa-0.14□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 ATP10BO94823 1461 aa-0.14□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 NLRP1Q9C000 1473 aa-0.14□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 H0Y9P7 68 aa-0.14□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 H3BQF6 201 aa-0.14□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 ATOX1O00244 68 aa-0.14□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 ARMS2P0C7Q2 107 aa-0.14□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 LINC00032P0C843 101 aa-0.14□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 GNGT1P63211 74 aa-0.14□□□□□ -2.43
SNORD3E-201ENST00000362899 NCMAPQ5T1S8 102 aa-0.14□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.2 ms