RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345512.7

PTPRU-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 4,470 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-201ENST00000345512 A8MUN3 132 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRU-201ENST00000345512 DSCR10P59022 87 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRU-201ENST00000345512 MOBPQ13875 183 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRU-201ENST00000345512 PRR15Q8IV56 129 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRU-201ENST00000345512 BAHCC1Q9P281 2608 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRU-201ENST00000345512 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
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PTPRU-201ENST00000345512 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa9.92□□□□□ -0.82
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PTPRU-201ENST00000345512 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
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PTPRU-201ENST00000345512 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRU-201ENST00000345512 K7EIL1 84 aa9.89□□□□□ -0.83
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PTPRU-201ENST00000345512 C7orf65Q6ZTY9 151 aa9.57□□□□□ -0.88
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PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRU-201ENST00000345512 FAM229AH3BQW9 127 aa9.56□□□□□ -0.88
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PTPRU-201ENST00000345512 Q5VV11 94 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
PTPRU-201ENST00000345512 IGLV7-43P04211 117 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRU-201ENST00000345512 TENM1Q9UKZ4 2725 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRU-201ENST00000345512 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
PTPRU-201ENST00000345512 CD164Q04900 197 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRU-201ENST00000345512 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRU-201ENST00000345512 CSMD2Q7Z408 3487 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRU-201ENST00000345512 TENM3Q9P273 2699 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRU-201ENST00000345512 K7ERS5 55 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRU-201ENST00000345512 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRU-201ENST00000345512 LCE6AA0A183 80 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRU-201ENST00000345512 Q75L30 129 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRU-201ENST00000345512 TYMSOSQ8TAI1 123 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRU-201ENST00000345512 Q96NJ1 140 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRU-201ENST00000345512 PANO1I0J062 215 aa9.43□□□□□ -0.9
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PTPRU-201ENST00000345512 HRES1P13985 223 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRU-201ENST00000345512 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRU-201ENST00000345512 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRU-201ENST00000345512 TENM4Q6N022 2769 aa9.36□□□□□ -0.91
PTPRU-201ENST00000345512 MIR22HGQ0VDD5 57 aa9.35□□□□□ -0.91
PTPRU-201ENST00000345512 PDZD2O15018 2839 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRU-201ENST00000345512 PLAC8Q9NZF1 115 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRU-201ENST00000345512 SPINK7P58062 85 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRU-201ENST00000345512 VPS13CQ709C8 3753 aa9.28□□□□□ -0.92
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