RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272638.13

UBXN4-201, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBXN4, Length 4,006 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-201ENST00000272638 LINC00474Q9P2X8 69 aa7.97□□□□□ -1.13
UBXN4-201ENST00000272638 APLNQ9ULZ1 77 aa7.97□□□□□ -1.13
UBXN4-201ENST00000272638 CASC2Q6XLA1 102 aa7.96□□□□□ -1.13
UBXN4-201ENST00000272638 TGP01266 2768 aa7.96□□□□□ -1.14
UBXN4-201ENST00000272638 MOBPQ13875 183 aa7.95□□□□□ -1.14
UBXN4-201ENST00000272638 PCOTHQ58A44 107 aa7.95□□□□□ -1.14
UBXN4-201ENST00000272638 NDUFC1O43677 76 aa7.93□□□□□ -1.14
UBXN4-201ENST00000272638 C1orf134Q5TEV5 83 aa7.93□□□□□ -1.14
UBXN4-201ENST00000272638 RETNLBQ9BQ08 111 aa7.93□□□□□ -1.14
UBXN4-201ENST00000272638 H7BZZ5 65 aa7.93□□□□□ -1.14
UBXN4-201ENST00000272638 RTL8CO15255 209 aa7.93□□□□□ -1.14
UBXN4-201ENST00000272638 C9orf163Q8N9P6 203 aa7.92□□□□□ -1.14
UBXN4-201ENST00000272638 SERP1Q9Y6X1 66 aa7.92□□□□□ -1.14
UBXN4-201ENST00000272638 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
UBXN4-201ENST00000272638 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa7.91□□□□□ -1.14
UBXN4-201ENST00000272638 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa7.89□□□□□ -1.15
UBXN4-201ENST00000272638 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
UBXN4-201ENST00000272638 H0Y9P7 68 aa7.89□□□□□ -1.15
UBXN4-201ENST00000272638 CSMD3Q7Z407 3707 aa7.88□□□□□ -1.15
UBXN4-201ENST00000272638 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa7.88□□□□□ -1.15
UBXN4-201ENST00000272638 SMIM26A0A096LP01 95 aa7.87□□□□□ -1.15
UBXN4-201ENST00000272638 PANO1I0J062 215 aa7.87□□□□□ -1.15
UBXN4-201ENST00000272638 BCE1O60756 84 aa7.87□□□□□ -1.15
UBXN4-201ENST00000272638 PSPHP1O15172 72 aa7.87□□□□□ -1.15
UBXN4-201ENST00000272638 A0A087WTM6 91 aa7.86□□□□□ -1.15
UBXN4-201ENST00000272638 CNBPP62633 177 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
UBXN4-201ENST00000272638 SPTSSBQ8NFR3 76 aa7.86□□□□□ -1.15
UBXN4-201ENST00000272638 DSCR10P59022 87 aa7.85□□□□□ -1.15
UBXN4-201ENST00000272638 KLKP1Q107X0 134 aa7.85□□□□□ -1.15
UBXN4-201ENST00000272638 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa7.84□□□□□ -1.15
UBXN4-201ENST00000272638 SPRR1AP35321 89 aa7.84□□□□□ -1.15
UBXN4-201ENST00000272638 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa7.84□□□□□ -1.15
UBXN4-201ENST00000272638 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
UBXN4-201ENST00000272638 C4orf48Q5BLP8 95 aa7.82□□□□□ -1.16
UBXN4-201ENST00000272638 C1orf64Q8NEQ6 169 aa7.82□□□□□ -1.16
UBXN4-201ENST00000272638 RPS28P62857 69 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
UBXN4-201ENST00000272638 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa7.82□□□□□ -1.16
UBXN4-201ENST00000272638 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
UBXN4-201ENST00000272638 hDV103S1A0JD37 113 aa7.8□□□□□ -1.16
UBXN4-201ENST00000272638 OXTP01178 125 aa7.8□□□□□ -1.16
UBXN4-201ENST00000272638 OCR1Q9BZK8 76 aa7.8□□□□□ -1.16
UBXN4-201ENST00000272638 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
UBXN4-201ENST00000272638 LINC00336Q6ZUF6 198 aa7.79□□□□□ -1.16
UBXN4-201ENST00000272638 SPRR4Q96PI1 79 aa7.77□□□□□ -1.17
UBXN4-201ENST00000272638 TNP2Q05952 138 aa7.76□□□□□ -1.17
UBXN4-201ENST00000272638 A0A1B0GW54 56 aa7.76□□□□□ -1.17
UBXN4-201ENST00000272638 PRR15Q8IV56 129 aa7.76□□□□□ -1.17
UBXN4-201ENST00000272638 COL7A1Q02388 2944 aa7.76□□□□□ -1.17
UBXN4-201ENST00000272638 A8MWP4 228 aa7.75□□□□□ -1.17
UBXN4-201ENST00000272638 SPACA4Q8TDM5 124 aa7.74□□□□□ -1.17
UBXN4-201ENST00000272638 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa7.74□□□□□ -1.17
UBXN4-201ENST00000272638 C1orf195Q5TG92 126 aa7.73□□□□□ -1.17
UBXN4-201ENST00000272638 TRAV22A0A0B4J277 110 aa7.71□□□□□ -1.17
UBXN4-201ENST00000272638 ZNF861PO60384 105 aa7.71□□□□□ -1.17
UBXN4-201ENST00000272638 FAM229BQ4G0N7 80 aa7.69□□□□□ -1.18
UBXN4-201ENST00000272638 PRR15LQ9BU68 103 aa7.69□□□□□ -1.18
UBXN4-201ENST00000272638 V9GYY9 64 aa7.68□□□□□ -1.18
UBXN4-201ENST00000272638 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
UBXN4-201ENST00000272638 C8orf17Q9NRJ1 99 aa7.65□□□□□ -1.18
UBXN4-201ENST00000272638 A6NED7 52 aa7.65□□□□□ -1.18
UBXN4-201ENST00000272638 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa7.64□□□□□ -1.19
UBXN4-201ENST00000272638 IGKV2-30P06310 120 aa7.64□□□□□ -1.19
UBXN4-201ENST00000272638 FBN3Q75N90 2809 aa7.64□□□□□ -1.19
UBXN4-201ENST00000272638 SPAG11AQ6PDA7 123 aa7.63□□□□□ -1.19
UBXN4-201ENST00000272638 IGLV7-43P04211 117 aa7.63□□□□□ -1.19
UBXN4-201ENST00000272638 A8MUN3 132 aa7.62□□□□□ -1.19
UBXN4-201ENST00000272638 Q5XG85 94 aa7.62□□□□□ -1.19
UBXN4-201ENST00000272638 PRO0628Q9UI54 55 aa7.62□□□□□ -1.19
UBXN4-201ENST00000272638 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
UBXN4-201ENST00000272638 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa7.62□□□□□ -1.19
UBXN4-201ENST00000272638 A0A1B0GVX0 72 aa7.61□□□□□ -1.19
UBXN4-201ENST00000272638 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
UBXN4-201ENST00000272638 SPINK1P00995 79 aa7.6□□□□□ -1.19
UBXN4-201ENST00000272638 KRTAP10-2P60368 255 aa7.6□□□□□ -1.19
UBXN4-201ENST00000272638 PMAIP1Q13794 54 aa7.6□□□□□ -1.19
UBXN4-201ENST00000272638 LINC00472Q9H8W2 130 aa7.6□□□□□ -1.19
UBXN4-201ENST00000272638 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
UBXN4-201ENST00000272638 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
UBXN4-201ENST00000272638 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
UBXN4-201ENST00000272638 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa7.56□□□□□ -1.2
UBXN4-201ENST00000272638 LINC00313P59037 77 aa7.56□□□□□ -1.2
UBXN4-201ENST00000272638 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN4-201ENST00000272638 TYMSOSQ8TAI1 123 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN4-201ENST00000272638 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN4-201ENST00000272638 SPRR1BP22528 89 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN4-201ENST00000272638 COA5Q86WW8 74 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN4-201ENST00000272638 A0A087X002 238 aa7.53□□□□□ -1.2
UBXN4-201ENST00000272638 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa7.53□□□□□ -1.2
UBXN4-201ENST00000272638 PLAC8Q9NZF1 115 aa7.53□□□□□ -1.2
UBXN4-201ENST00000272638 SEC61GP60059 68 aa7.51□□□□□ -1.21
UBXN4-201ENST00000272638 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa7.51□□□□□ -1.21
UBXN4-201ENST00000272638 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
UBXN4-201ENST00000272638 Q96NJ1 140 aa7.49□□□□□ -1.21
UBXN4-201ENST00000272638 H3BPC8 53 aa7.49□□□□□ -1.21
UBXN4-201ENST00000272638 KRTAP10-1P60331 282 aa7.49□□□□□ -1.21
UBXN4-201ENST00000272638 Q6ZR54 194 aa7.49□□□□□ -1.21
UBXN4-201ENST00000272638 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa7.47□□□□□ -1.21
UBXN4-201ENST00000272638 PRR26Q8N8Z3 221 aa7.47□□□□□ -1.21
UBXN4-201ENST00000272638 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.21
UBXN4-201ENST00000272638 C9orf92A6NGG3 77 aa7.46□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 90.3 ms