RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258398.8

TTLL4-201, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene TTLL4, Length 4,730 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL4-201ENST00000258398 NBEAQ8NFP9 2946 aa5.53□□□□□ -1.52
TTLL4-201ENST00000258398 Q96NJ1 140 aa5.53□□□□□ -1.52
TTLL4-201ENST00000258398 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa5.53□□□□□ -1.52
TTLL4-201ENST00000258398 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
TTLL4-201ENST00000258398 FRYQ5TBA9 3013 aa5.52□□□□□ -1.53
TTLL4-201ENST00000258398 USP24Q9UPU5 2620 aa5.52□□□□□ -1.53
TTLL4-201ENST00000258398 LINC00483Q53H64 154 aa5.51□□□□□ -1.53
TTLL4-201ENST00000258398 SZT2Q5T011 3432 aa5.51□□□□□ -1.53
TTLL4-201ENST00000258398 ITPR3Q14573 2671 aa5.5□□□□□ -1.53
TTLL4-201ENST00000258398 VCANP13611 3396 aa5.49□□□□□ -1.53
TTLL4-201ENST00000258398 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
TTLL4-201ENST00000258398 WDFY4Q6ZS81 3184 aa5.49□□□□□ -1.53
TTLL4-201ENST00000258398 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
TTLL4-201ENST00000258398 PLAC8Q9NZF1 115 aa5.48□□□□□ -1.53
TTLL4-201ENST00000258398 LINC01554Q52M75 96 aa5.48□□□□□ -1.53
TTLL4-201ENST00000258398 ANAPC11Q9NYG5 84 aa5.48□□□□□ -1.53
TTLL4-201ENST00000258398 SPINK7P58062 85 aa5.47□□□□□ -1.53
TTLL4-201ENST00000258398 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
TTLL4-201ENST00000258398 DMAC1Q96GE9 116 aa5.46□□□□□ -1.54
TTLL4-201ENST00000258398 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa5.46□□□□□ -1.54
TTLL4-201ENST00000258398 CHD6Q8TD26 2715 aa5.46□□□□□ -1.54
TTLL4-201ENST00000258398 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
TTLL4-201ENST00000258398 CFAP46Q8IYW2 2715 aa5.45□□□□□ -1.54
TTLL4-201ENST00000258398 Q5W150 140 aa5.44□□□□□ -1.54
TTLL4-201ENST00000258398 LINC00304Q8N9R0 145 aa5.43□□□□□ -1.54
TTLL4-201ENST00000258398 XIRP2A4UGR9 3374 aa5.43□□□□□ -1.54
TTLL4-201ENST00000258398 A6NN06 94 aa5.43□□□□□ -1.54
TTLL4-201ENST00000258398 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa5.43□□□□□ -1.54
TTLL4-201ENST00000258398 IGSF10Q6WRI0 2623 aa5.43□□□□□ -1.54
TTLL4-201ENST00000258398 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa5.43□□□□□ -1.54
TTLL4-201ENST00000258398 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
TTLL4-201ENST00000258398 REV3LO60673 3130 aa5.42□□□□□ -1.54
TTLL4-201ENST00000258398 FRYLO94915 3013 aa5.39□□□□□ -1.55
TTLL4-201ENST00000258398 ZZEF1O43149 2961 aa5.39□□□□□ -1.55
TTLL4-201ENST00000258398 ATRQ13535 2644 aa5.39□□□□□ -1.55
TTLL4-201ENST00000258398 KALRNO60229 2985 aa5.39□□□□□ -1.55
TTLL4-201ENST00000258398 CENPEQ02224 2701 aa5.39□□□□□ -1.55
TTLL4-201ENST00000258398 A0A087X002 238 aa5.38□□□□□ -1.55
TTLL4-201ENST00000258398 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa5.38□□□□□ -1.55
TTLL4-201ENST00000258398 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa5.37□□□□□ -1.55
TTLL4-201ENST00000258398 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
TTLL4-201ENST00000258398 USP34Q70CQ2 3546 aa5.36□□□□□ -1.55
TTLL4-201ENST00000258398 SPATA8Q6RVD6 105 aa5.36□□□□□ -1.55
TTLL4-201ENST00000258398 Q8N1X5 172 aa5.36□□□□□ -1.55
TTLL4-201ENST00000258398 PRAC1Q96KF2 57 aa5.36□□□□□ -1.55
TTLL4-201ENST00000258398 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa5.35□□□□□ -1.55
TTLL4-201ENST00000258398 A0A1B0GU33 70 aa5.35□□□□□ -1.55
TTLL4-201ENST00000258398 A0A0A0MQY5 61 aa5.34□□□□□ -1.55
TTLL4-201ENST00000258398 TEX15Q9BXT5 2789 aa5.34□□□□□ -1.56
TTLL4-201ENST00000258398 UNC79Q9P2D8 2635 aa5.33□□□□□ -1.56
TTLL4-201ENST00000258398 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
TTLL4-201ENST00000258398 LRBAP50851 2863 aa5.33□□□□□ -1.56
TTLL4-201ENST00000258398 COL6A3P12111 3177 aa5.32□□□□□ -1.56
TTLL4-201ENST00000258398 CRIPTQ9P021 101 aa5.31□□□□□ -1.56
TTLL4-201ENST00000258398 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa5.3□□□□□ -1.56
TTLL4-201ENST00000258398 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
TTLL4-201ENST00000258398 CSAG1Q6PB30 78 aa5.29□□□□□ -1.56
TTLL4-201ENST00000258398 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa5.28□□□□□ -1.56
TTLL4-201ENST00000258398 PANO1I0J062 215 aa5.28□□□□□ -1.56
TTLL4-201ENST00000258398 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa5.28□□□□□ -1.56
TTLL4-201ENST00000258398 TACC2O95359 2948 aa5.27□□□□□ -1.57
TTLL4-201ENST00000258398 C9orf92A6NGG3 77 aa5.27□□□□□ -1.57
TTLL4-201ENST00000258398 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa5.27□□□□□ -1.57
TTLL4-201ENST00000258398 FREM2Q5SZK8 3169 aa5.27□□□□□ -1.57
TTLL4-201ENST00000258398 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
TTLL4-201ENST00000258398 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa5.26□□□□□ -1.57
TTLL4-201ENST00000258398 MAST4O15021 2626 aa5.25□□□□□ -1.57
TTLL4-201ENST00000258398 LUZP6Q538Z0 58 aa5.25□□□□□ -1.57
TTLL4-201ENST00000258398 A8MU10 97 aa5.25□□□□□ -1.57
TTLL4-201ENST00000258398 ITPR1Q14643 2758 aa5.24□□□□□ -1.57
TTLL4-201ENST00000258398 FLNCQ14315 2725 aa5.23□□□□□ -1.57
TTLL4-201ENST00000258398 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
TTLL4-201ENST00000258398 ATMQ13315 3056 aa5.23□□□□□ -1.57
TTLL4-201ENST00000258398 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa5.23□□□□□ -1.57
TTLL4-201ENST00000258398 SPEGQ15772 3267 aa5.22□□□□□ -1.57
TTLL4-201ENST00000258398 MGAM2Q2M2H8 2515 aa5.22□□□□□ -1.57
TTLL4-201ENST00000258398 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
TTLL4-201ENST00000258398 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
TTLL4-201ENST00000258398 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
TTLL4-201ENST00000258398 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa5.21□□□□□ -1.58
TTLL4-201ENST00000258398 RPS29P62273 56 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
TTLL4-201ENST00000258398 EYSQ5T1H1 3165 aa5.19□□□□□ -1.58
TTLL4-201ENST00000258398 DMXL1Q9Y485 3027 aa5.17□□□□□ -1.58
TTLL4-201ENST00000258398 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
TTLL4-201ENST00000258398 ROMO1P60602 79 aa5.15□□□□□ -1.58
TTLL4-201ENST00000258398 A0A0D9SG42 100 aa5.15□□□□□ -1.59
TTLL4-201ENST00000258398 RPL37P61927 97 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
TTLL4-201ENST00000258398 LOC400499M0QZD8 3231 aa5.13□□□□□ -1.59
TTLL4-201ENST00000258398 BAHCC1Q9P281 2608 aa5.13□□□□□ -1.59
TTLL4-201ENST00000258398 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa5.12□□□□□ -1.59
TTLL4-201ENST00000258398 COL12A1Q99715 3063 aa5.12□□□□□ -1.59
TTLL4-201ENST00000258398 COX6B2Q6YFQ2 88 aa5.12□□□□□ -1.59
TTLL4-201ENST00000258398 COL6A5A8TX70 2615 aa5.11□□□□□ -1.59
TTLL4-201ENST00000258398 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
TTLL4-201ENST00000258398 KRTAP10-1P60331 282 aa5.11□□□□□ -1.59
TTLL4-201ENST00000258398 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
TTLL4-201ENST00000258398 S4R3F8 94 aa5.1□□□□□ -1.59
TTLL4-201ENST00000258398 KRTAP10-2P60368 255 aa5.09□□□□□ -1.59
TTLL4-201ENST00000258398 ZANQ9Y493 2812 aa5.09□□□□□ -1.59
TTLL4-201ENST00000258398 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa5.09□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 92.8 ms