RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233336.6

TTL-201, Transcript of tubulin tyrosine ligase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTL, Length 14,269 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTL-201ENST00000233336 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
TTL-201ENST00000233336 Q5VV11 94 aa6.54□□□□□ -1.36
TTL-201ENST00000233336 NBEAQ8NFP9 2946 aa6.54□□□□□ -1.36
TTL-201ENST00000233336 WDFY4Q6ZS81 3184 aa6.54□□□□□ -1.36
TTL-201ENST00000233336 FREM2Q5SZK8 3169 aa6.54□□□□□ -1.36
TTL-201ENST00000233336 KALRNO60229 2985 aa6.54□□□□□ -1.36
TTL-201ENST00000233336 DNAH14Q0VDD8 3507 aa6.53□□□□□ -1.36
TTL-201ENST00000233336 ANAPC11Q9NYG5 84 aa6.53□□□□□ -1.36
TTL-201ENST00000233336 C9orf163Q8N9P6 203 aa6.53□□□□□ -1.36
TTL-201ENST00000233336 BAHCC1Q9P281 2608 aa6.53□□□□□ -1.36
TTL-201ENST00000233336 KRTAP10-11P60412 298 aa6.53□□□□□ -1.36
TTL-201ENST00000233336 Q8N1X5 172 aa6.53□□□□□ -1.36
TTL-201ENST00000233336 SPRR4Q96PI1 79 aa6.52□□□□□ -1.37
TTL-201ENST00000233336 HTTP42858 3142 aa6.52□□□□□ -1.37
TTL-201ENST00000233336 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa6.51□□□□□ -1.37
TTL-201ENST00000233336 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
TTL-201ENST00000233336 CASC10Q5T4H9 136 aa6.5□□□□□ -1.37
TTL-201ENST00000233336 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.5□□□□□ -1.37
TTL-201ENST00000233336 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa6.5□□□□□ -1.37
TTL-201ENST00000233336 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.48□□□□□ -1.37
TTL-201ENST00000233336 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa6.48□□□□□ -1.37
TTL-201ENST00000233336 C9orf92A6NGG3 77 aa6.48□□□□□ -1.37
TTL-201ENST00000233336 LINC00304Q8N9R0 145 aa6.47□□□□□ -1.37
TTL-201ENST00000233336 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.47□□□□□ -1.37
TTL-201ENST00000233336 SPINK7P58062 85 aa6.46□□□□□ -1.37
TTL-201ENST00000233336 KRTAP10-3P60369 221 aa6.46□□□□□ -1.38
TTL-201ENST00000233336 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
TTL-201ENST00000233336 LRBAP50851 2863 aa6.46□□□□□ -1.38
TTL-201ENST00000233336 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
TTL-201ENST00000233336 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa6.45□□□□□ -1.38
TTL-201ENST00000233336 TACC2O95359 2948 aa6.45□□□□□ -1.38
TTL-201ENST00000233336 A0A1B0GU33 70 aa6.45□□□□□ -1.38
TTL-201ENST00000233336 A0A0A0MQY5 61 aa6.44□□□□□ -1.38
TTL-201ENST00000233336 DMAC1Q96GE9 116 aa6.44□□□□□ -1.38
TTL-201ENST00000233336 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
TTL-201ENST00000233336 IGLV7-43P04211 117 aa6.43□□□□□ -1.38
TTL-201ENST00000233336 Q8NDZ9 215 aa6.43□□□□□ -1.38
TTL-201ENST00000233336 K7EIL1 84 aa6.42□□□□□ -1.38
TTL-201ENST00000233336 A0A087WTM6 91 aa6.42□□□□□ -1.38
TTL-201ENST00000233336 CDH23Q9H251 3354 aa6.41□□□□□ -1.38
TTL-201ENST00000233336 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
TTL-201ENST00000233336 LAMA1P25391 3075 aa6.41□□□□□ -1.38
TTL-201ENST00000233336 HRES1P13985 223 aa6.4□□□□□ -1.39
TTL-201ENST00000233336 FRYLO94915 3013 aa6.38□□□□□ -1.39
TTL-201ENST00000233336 FLNCQ14315 2725 aa6.38□□□□□ -1.39
TTL-201ENST00000233336 IGSF10Q6WRI0 2623 aa6.37□□□□□ -1.39
TTL-201ENST00000233336 UNC80Q8N2C7 3258 aa6.37□□□□□ -1.39
TTL-201ENST00000233336 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa6.36□□□□□ -1.39
TTL-201ENST00000233336 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
TTL-201ENST00000233336 LINC00483Q53H64 154 aa6.32□□□□□ -1.4
TTL-201ENST00000233336 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa6.31□□□□□ -1.4
TTL-201ENST00000233336 SPRR1AP35321 89 aa6.29□□□□□ -1.4
TTL-201ENST00000233336 LINC00472Q9H8W2 130 aa6.29□□□□□ -1.4
TTL-201ENST00000233336 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa6.28□□□□□ -1.4
TTL-201ENST00000233336 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
TTL-201ENST00000233336 VCANP13611 3396 aa6.28□□□□□ -1.4
TTL-201ENST00000233336 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa6.28□□□□□ -1.4
TTL-201ENST00000233336 HIVEP1P15822 2718 aa6.27□□□□□ -1.41
TTL-201ENST00000233336 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
TTL-201ENST00000233336 KRTAP1-1Q07627 177 aa6.26□□□□□ -1.41
TTL-201ENST00000233336 REV3LO60673 3130 aa6.26□□□□□ -1.41
TTL-201ENST00000233336 COX6B2Q6YFQ2 88 aa6.26□□□□□ -1.41
TTL-201ENST00000233336 COL6A3P12111 3177 aa6.25□□□□□ -1.41
TTL-201ENST00000233336 Q5W150 140 aa6.25□□□□□ -1.41
TTL-201ENST00000233336 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa6.25□□□□□ -1.41
TTL-201ENST00000233336 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.24□□□□□ -1.41
TTL-201ENST00000233336 ROMO1P60602 79 aa6.24□□□□□ -1.41
TTL-201ENST00000233336 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa6.23□□□□□ -1.41
TTL-201ENST00000233336 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa6.22□□□□□ -1.41
TTL-201ENST00000233336 CELSR2Q9HCU4 2923 aa6.21□□□□□ -1.41
TTL-201ENST00000233336 A6NN06 94 aa6.21□□□□□ -1.41
TTL-201ENST00000233336 USP34Q70CQ2 3546 aa6.21□□□□□ -1.42
TTL-201ENST00000233336 COL12A1Q99715 3063 aa6.2□□□□□ -1.42
TTL-201ENST00000233336 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
TTL-201ENST00000233336 ZZEF1O43149 2961 aa6.19□□□□□ -1.42
TTL-201ENST00000233336 SPRR1BP22528 89 aa6.18□□□□□ -1.42
TTL-201ENST00000233336 ZANQ9Y493 2812 aa6.16□□□□□ -1.42
TTL-201ENST00000233336 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.16□□□□□ -1.42
TTL-201ENST00000233336 J3QL48 77 aa6.15□□□□□ -1.42
TTL-201ENST00000233336 TNP2Q05952 138 aa6.15□□□□□ -1.42
TTL-201ENST00000233336 SZT2Q5T011 3432 aa6.15□□□□□ -1.42
TTL-201ENST00000233336 Q6ZR54 194 aa6.14□□□□□ -1.43
TTL-201ENST00000233336 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa6.14□□□□□ -1.43
TTL-201ENST00000233336 PLAC8Q9NZF1 115 aa6.13□□□□□ -1.43
TTL-201ENST00000233336 RPL37P61927 97 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
TTL-201ENST00000233336 ADM2Q7Z4H4 148 aa6.13□□□□□ -1.43
TTL-201ENST00000233336 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa6.12□□□□□ -1.43
TTL-201ENST00000233336 S4R3F8 94 aa6.11□□□□□ -1.43
TTL-201ENST00000233336 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
TTL-201ENST00000233336 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
TTL-201ENST00000233336 NDUFAF8A1L188 74 aa6.1□□□□□ -1.43
TTL-201ENST00000233336 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
TTL-201ENST00000233336 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.1□□□□□ -1.43
TTL-201ENST00000233336 SPATA8Q6RVD6 105 aa6.1□□□□□ -1.43
TTL-201ENST00000233336 NF1P21359 2839 aa6.09□□□□□ -1.43
TTL-201ENST00000233336 DMXL1Q9Y485 3027 aa6.09□□□□□ -1.43
TTL-201ENST00000233336 A8MU10 97 aa6.09□□□□□ -1.43
TTL-201ENST00000233336 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP6.09□□□□□ -1.43
TTL-201ENST00000233336 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
TTL-201ENST00000233336 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.08□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.2 ms