RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635893.1

SCN1A-211, Transcript of sodium voltage-gated channel alpha subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene SCN1A, Length 168 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1A-211ENST00000635893 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP-2.59□□□□□ -2.82
SCN1A-211ENST00000635893 A0A1B0GWA3 101 aa-2.59□□□□□ -2.82
SCN1A-211ENST00000635893 IL5P05113 134 aa-2.59□□□□□ -2.82
SCN1A-211ENST00000635893 SCTP09683 121 aa-2.59□□□□□ -2.82
SCN1A-211ENST00000635893 IFI6P09912 130 aa-2.59□□□□□ -2.82
SCN1A-211ENST00000635893 ARMS2P0C7Q2 107 aa-2.59□□□□□ -2.82
SCN1A-211ENST00000635893 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP-2.59□□□□□ -2.82
SCN1A-211ENST00000635893 TSLPQ969D9 159 aa-2.59□□□□□ -2.82
SCN1A-211ENST00000635893 SAR1AQ9NR31 198 aa-2.59□□□□□ -2.82
SCN1A-211ENST00000635893 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa-2.6□□□□□ -2.83
SCN1A-211ENST00000635893 GNG10P50151 68 aa-2.6□□□□□ -2.83
SCN1A-211ENST00000635893 NCS1P62166 190 aa-2.6□□□□□ -2.83
SCN1A-211ENST00000635893 TAC4Q86UU9 113 aa-2.6□□□□□ -2.83
SCN1A-211ENST00000635893 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP-2.6□□□□□ -2.83
SCN1A-211ENST00000635893 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa-2.61□□□□□ -2.83
SCN1A-211ENST00000635893 MON2Q7Z3U7 1717 aa-2.61□□□□□ -2.83
SCN1A-211ENST00000635893 CENPFP49454 3210 aa-2.61□□□□□ -2.83
SCN1A-211ENST00000635893 A0A1B0GX51 115 aa-2.61□□□□□ -2.83
SCN1A-211ENST00000635893 S100PP25815 95 aa-2.61□□□□□ -2.83
SCN1A-211ENST00000635893 GNGT1P63211 74 aa-2.61□□□□□ -2.83
SCN1A-211ENST00000635893 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP-2.61□□□□□ -2.83
SCN1A-211ENST00000635893 PSMG4Q5JS54 123 aa-2.61□□□□□ -2.83
SCN1A-211ENST00000635893 COMMD6Q7Z4G1 85 aa-2.61□□□□□ -2.83
SCN1A-211ENST00000635893 ERVK-7P63135 1459 aa-2.61□□□□□ -2.83
SCN1A-211ENST00000635893 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP-2.61□□□□□ -2.83
SCN1A-211ENST00000635893 SHPRHQ149N8 1683 aa-2.62□□□□□ -2.83
SCN1A-211ENST00000635893 H0Y9P7 68 aa-2.62□□□□□ -2.83
SCN1A-211ENST00000635893 S100GP29377 79 aa-2.62□□□□□ -2.83
SCN1A-211ENST00000635893 WT1-ASQ06250 92 aa-2.62□□□□□ -2.83
SCN1A-211ENST00000635893 DEFB107AQ8IZN7 70 aa-2.62□□□□□ -2.83
SCN1A-211ENST00000635893 DNAH12Q6ZR08 3092 aa-2.62□□□□□ -2.83
SCN1A-211ENST00000635893 ITSN2Q9NZM3 1697 aa-2.63□□□□□ -2.83
SCN1A-211ENST00000635893 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa-2.63□□□□□ -2.83
SCN1A-211ENST00000635893 KIF21BO75037 1637 aa-2.63□□□□□ -2.83
SCN1A-211ENST00000635893 NESP48681 1621 aa-2.63□□□□□ -2.83
SCN1A-211ENST00000635893 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa-2.63□□□□□ -2.83
SCN1A-211ENST00000635893 M0QY20 66 aa-2.63□□□□□ -2.83
SCN1A-211ENST00000635893 SNCGO76070 127 aa-2.63□□□□□ -2.83
SCN1A-211ENST00000635893 CTAGE3PQ8IX95 158 aa-2.63□□□□□ -2.83
SCN1A-211ENST00000635893 ASPMQ8IZT6 3477 aa-2.63□□□□□ -2.83
SCN1A-211ENST00000635893 GRIN2AQ12879 1464 aa-2.64□□□□□ -2.83
SCN1A-211ENST00000635893 H3BQF6 201 aa-2.64□□□□□ -2.83
SCN1A-211ENST00000635893 SPTSSAQ969W0 71 aa-2.64□□□□□ -2.83
SCN1A-211ENST00000635893 C5P01031 1676 aa-2.64□□□□□ -2.83
SCN1A-211ENST00000635893 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa-2.64□□□□□ -2.83
SCN1A-211ENST00000635893 UBR1Q8IWV7 1749 aa-2.65□□□□□ -2.83
SCN1A-211ENST00000635893 SAMD9Q5K651 1589 aa-2.65□□□□□ -2.83
SCN1A-211ENST00000635893 SPEF2Q9C093 1822 aa-2.65□□□□□ -2.83
SCN1A-211ENST00000635893 KIF1AQ12756 1690 aa-2.65□□□□□ -2.83
SCN1A-211ENST00000635893 E5RI56 91 aa-2.65□□□□□ -2.83
SCN1A-211ENST00000635893 NDUFB6O95139 128 aa-2.65□□□□□ -2.83
SCN1A-211ENST00000635893 ACYP1P07311 99 aa-2.65□□□□□ -2.83
SCN1A-211ENST00000635893 RPL38P63173 70 aaKnown RBP-2.65□□□□□ -2.83
SCN1A-211ENST00000635893 A2ML1A8K2U0 1454 aa-2.65□□□□□ -2.83
SCN1A-211ENST00000635893 ATP10BO94823 1461 aa-2.65□□□□□ -2.83
SCN1A-211ENST00000635893 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa-2.65□□□□□ -2.83
SCN1A-211ENST00000635893 MLH3Q9UHC1 1453 aa-2.65□□□□□ -2.83
SCN1A-211ENST00000635893 CROCC2H7BZ55 1655 aa-2.66□□□□□ -2.83
SCN1A-211ENST00000635893 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP-2.66□□□□□ -2.84
SCN1A-211ENST00000635893 AP4S1Q9Y587 144 aa-2.66□□□□□ -2.84
SCN1A-211ENST00000635893 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa-2.67□□□□□ -2.84
SCN1A-211ENST00000635893 A0A1B0GV72 72 aa-2.67□□□□□ -2.84
SCN1A-211ENST00000635893 HSD52Q0P140 79 aa-2.67□□□□□ -2.84
SCN1A-211ENST00000635893 UQCR10Q9UDW1 63 aa-2.67□□□□□ -2.84
SCN1A-211ENST00000635893 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa-2.67□□□□□ -2.84
SCN1A-211ENST00000635893 MRC2Q9UBG0 1479 aa-2.68□□□□□ -2.84
SCN1A-211ENST00000635893 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP-2.68□□□□□ -2.84
SCN1A-211ENST00000635893 TTTY10Q9BZA0 68 aa-2.68□□□□□ -2.84
SCN1A-211ENST00000635893 SERP1Q9Y6X1 66 aa-2.68□□□□□ -2.84
SCN1A-211ENST00000635893 FAM135AQ9P2D6 1515 aa-2.68□□□□□ -2.84
SCN1A-211ENST00000635893 SFTA2Q6UW10 78 aa-2.69□□□□□ -2.84
SCN1A-211ENST00000635893 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa-2.7□□□□□ -2.84
SCN1A-211ENST00000635893 IGLC6P0CF74 106 aa-2.7□□□□□ -2.84
SCN1A-211ENST00000635893 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP-2.7□□□□□ -2.84
SCN1A-211ENST00000635893 NWD1Q149M9 1564 aa-2.7□□□□□ -2.84
SCN1A-211ENST00000635893 TOP2BQ02880 1626 aa-2.71□□□□□ -2.84
SCN1A-211ENST00000635893 PLIN4Q96Q06 1357 aa-2.71□□□□□ -2.84
SCN1A-211ENST00000635893 LRRC7Q96NW7 1537 aa-2.71□□□□□ -2.84
SCN1A-211ENST00000635893 MYH4Q9Y623 1939 aa-2.71□□□□□ -2.84
SCN1A-211ENST00000635893 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa-2.71□□□□□ -2.84
SCN1A-211ENST00000635893 C7orf77A4D0Y5 90 aa-2.71□□□□□ -2.84
SCN1A-211ENST00000635893 RPS27P42677 84 aaKnown RBP-2.71□□□□□ -2.84
SCN1A-211ENST00000635893 SMIM21Q3B7S5 101 aa-2.71□□□□□ -2.84
SCN1A-211ENST00000635893 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa-2.71□□□□□ -2.84
SCN1A-211ENST00000635893 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP-2.71□□□□□ -2.84
SCN1A-211ENST00000635893 H3BUA1 57 aa-2.72□□□□□ -2.84
SCN1A-211ENST00000635893 LEPROTL1O95214 131 aa-2.72□□□□□ -2.84
SCN1A-211ENST00000635893 TRAPPC2P0DI81 140 aa-2.72□□□□□ -2.84
SCN1A-211ENST00000635893 TRAPPC2BP0DI82 140 aa-2.72□□□□□ -2.84
SCN1A-211ENST00000635893 IGLC2P0DOY2 106 aa-2.72□□□□□ -2.84
SCN1A-211ENST00000635893 IGLC3P0DOY3 106 aa-2.72□□□□□ -2.84
SCN1A-211ENST00000635893 MED14O60244 1454 aa-2.72□□□□□ -2.85
SCN1A-211ENST00000635893 NCOA2Q15596 1464 aa-2.72□□□□□ -2.85
SCN1A-211ENST00000635893 CDH23Q9H251 3354 aa-2.72□□□□□ -2.85
SCN1A-211ENST00000635893 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa-2.73□□□□□ -2.85
SCN1A-211ENST00000635893 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa-2.73□□□□□ -2.85
SCN1A-211ENST00000635893 ARL11Q969Q4 196 aa-2.73□□□□□ -2.85
SCN1A-211ENST00000635893 TCEAL4Q96EI5 215 aa-2.73□□□□□ -2.85
SCN1A-211ENST00000635893 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP-2.73□□□□□ -2.85
SCN1A-211ENST00000635893 EEA1Q15075 1411 aa-2.74□□□□□ -2.85
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