RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623495.1

LETMD1-238, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

Gene LETMD1, Length 2,948 nt, Biotype TEC.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-238	ENST00000623495	CXCL6	P80162	114 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LETMD1-238	ENST00000623495		Q9H8V8	135 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LETMD1-238	ENST00000623495	PRY	O14603	147 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LETMD1-238	ENST00000623495	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LETMD1-238	ENST00000623495	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LETMD1-238	ENST00000623495	LECT2	O14960	151 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LETMD1-238	ENST00000623495		Q6ZVQ6	151 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LETMD1-238	ENST00000623495	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A087WZ39	114 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LETMD1-238	ENST00000623495		K7EQD1	137 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM104A	Q969W3	186 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LETMD1-238	ENST00000623495	LINC00167	Q96N53	147 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LETMD1-238	ENST00000623495	RYR3	Q15413	4870 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LETMD1-238	ENST00000623495	hDV103S1	A0JD37	113 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LETMD1-238	ENST00000623495		M0R378	163 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LETMD1-238	ENST00000623495	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LETMD1-238	ENST00000623495	NREP	Q16612	68 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LETMD1-238	ENST00000623495	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LETMD1-238	ENST00000623495	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LETMD1-238	ENST00000623495	SMIM11B	Q8TCY0	68 aa		4.9	□□□□□ -1.62
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM256-PLSCR3	K7ERE1	68 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LETMD1-238	ENST00000623495	APLN	Q9ULZ1	77 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LETMD1-238	ENST00000623495		Q6ZRP5	223 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LETMD1-238	ENST00000623495	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-238	ENST00000623495	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-238	ENST00000623495	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-238	ENST00000623495	UBE2L6	O14933	153 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-238	ENST00000623495	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-238	ENST00000623495	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-238	ENST00000623495	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-238	ENST00000623495	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-238	ENST00000623495	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LETMD1-238	ENST00000623495	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LETMD1-238	ENST00000623495	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LETMD1-238	ENST00000623495	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LETMD1-238	ENST00000623495	LOC110117498	A0A087WWA1	95 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LETMD1-238	ENST00000623495	KMT2A	Q03164	3969 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LETMD1-238	ENST00000623495	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LETMD1-238	ENST00000623495	IGKV2D-28	P01615	120 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LETMD1-238	ENST00000623495	SND1-IT1	Q9HBX3	110 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LETMD1-238	ENST00000623495	KLK12	Q9UKR0	248 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LETMD1-238	ENST00000623495	PSCA	O43653	123 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LETMD1-238	ENST00000623495	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LETMD1-238	ENST00000623495	TRAV22	A0A0B4J277	110 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LETMD1-238	ENST00000623495	LCE6A	A0A183	80 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LETMD1-238	ENST00000623495	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LETMD1-238	ENST00000623495	UBE2A	P49459	152 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LETMD1-238	ENST00000623495	HAMP	P81172	84 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LETMD1-238	ENST00000623495	C8orf87	E5RJ46	101 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LETMD1-238	ENST00000623495	BPY2	O14599	106 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LETMD1-238	ENST00000623495	PDE6G	P18545	87 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LETMD1-238	ENST00000623495	SYCN	Q0VAF6	134 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LETMD1-238	ENST00000623495		Q6ZQT0	140 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LETMD1-238	ENST00000623495	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LETMD1-238	ENST00000623495	SLPI	P03973	132 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LETMD1-238	ENST00000623495	ATP11AUN	Q6ZP68	121 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LETMD1-238	ENST00000623495	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LETMD1-238	ENST00000623495	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LETMD1-238	ENST00000623495	PSPHP1	O15172	72 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LETMD1-238	ENST00000623495	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LETMD1-238	ENST00000623495	IGLV2-33	A0A075B6J2	118 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LETMD1-238	ENST00000623495	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LETMD1-238	ENST00000623495	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LETMD1-238	ENST00000623495	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A0A0MQY5	61 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LETMD1-238	ENST00000623495	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LETMD1-238	ENST00000623495		Q8N814	137 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LETMD1-238	ENST00000623495	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LETMD1-238	ENST00000623495	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LETMD1-238	ENST00000623495	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LETMD1-238	ENST00000623495	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LETMD1-238	ENST00000623495	C7orf65	Q6ZTY9	151 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LETMD1-238	ENST00000623495	LCA10	Q71F78	164 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LETMD1-238	ENST00000623495	C1orf64	Q8NEQ6	169 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LETMD1-238	ENST00000623495	OCR1	Q9BZK8	76 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LETMD1-238	ENST00000623495	COX6A2	Q02221	97 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LETMD1-238	ENST00000623495	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LETMD1-238	ENST00000623495	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LETMD1-238	ENST00000623495		A6NN06	94 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LETMD1-238	ENST00000623495		H3BQ85	93 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LETMD1-238	ENST00000623495	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LETMD1-238	ENST00000623495	DIRC1	Q969H9	104 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LETMD1-238	ENST00000623495	CYP4F30P	Q9H0H9	118 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LETMD1-238	ENST00000623495	TRBV6-8	A0A0A6YYG3	113 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LETMD1-238	ENST00000623495	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LETMD1-238	ENST00000623495		Q5VV11	94 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LETMD1-238	ENST00000623495	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LETMD1-238	ENST00000623495		A8MUN3	132 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LETMD1-238	ENST00000623495	C16orf90	A8MZG2	172 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LETMD1-238	ENST00000623495	LELP1	Q5T871	98 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LETMD1-238	ENST00000623495	HIGD2A	Q9BW72	106 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LETMD1-238	ENST00000623495	RYR2	Q92736	4967 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LETMD1-238	ENST00000623495	LIMD2	Q9BT23	127 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LETMD1-238	ENST00000623495	DNAH10	Q8IVF4	4471 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LETMD1-238	ENST00000623495	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LETMD1-238	ENST00000623495	VPREB1	P12018	145 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LETMD1-238	ENST00000623495	LINC00158	P58513	81 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LETMD1-238	ENST00000623495	EPPK1	P58107	5090 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64

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