RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612839.1

CCL3L3-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 3 like 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCL3L3, Length 1,458 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L3-201ENST00000612839 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.92□□□□□ -1.3
CCL3L3-201ENST00000612839 OXTP01178 125 aa6.92□□□□□ -1.3
CCL3L3-201ENST00000612839 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CCL3L3-201ENST00000612839 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CCL3L3-201ENST00000612839 DAND5Q8N907 189 aa6.92□□□□□ -1.3
CCL3L3-201ENST00000612839 A0A0J9YXY3 114 aa6.91□□□□□ -1.3
CCL3L3-201ENST00000612839 HSD52Q0P140 79 aa6.9□□□□□ -1.31
CCL3L3-201ENST00000612839 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa6.9□□□□□ -1.31
CCL3L3-201ENST00000612839 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa6.89□□□□□ -1.31
CCL3L3-201ENST00000612839 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa6.89□□□□□ -1.31
CCL3L3-201ENST00000612839 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.89□□□□□ -1.31
CCL3L3-201ENST00000612839 IGKV2D-28P01615 120 aa6.89□□□□□ -1.31
CCL3L3-201ENST00000612839 BATFQ16520 125 aa6.89□□□□□ -1.31
CCL3L3-201ENST00000612839 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.89□□□□□ -1.31
CCL3L3-201ENST00000612839 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.88□□□□□ -1.31
CCL3L3-201ENST00000612839 SCGB1D4Q6XE38 83 aa6.88□□□□□ -1.31
CCL3L3-201ENST00000612839 TAL2Q16559 108 aa6.87□□□□□ -1.31
CCL3L3-201ENST00000612839 LITAFQ99732 161 aa6.87□□□□□ -1.31
CCL3L3-201ENST00000612839 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
CCL3L3-201ENST00000612839 M0R378 163 aa6.86□□□□□ -1.31
CCL3L3-201ENST00000612839 BCE1O60756 84 aa6.86□□□□□ -1.31
CCL3L3-201ENST00000612839 MT1HL1P0DM35 61 aa6.86□□□□□ -1.31
CCL3L3-201ENST00000612839 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
CCL3L3-201ENST00000612839 H0Y9J4 135 aa6.85□□□□□ -1.31
CCL3L3-201ENST00000612839 NCR3O14931 201 aa6.85□□□□□ -1.31
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF861PO60384 105 aa6.85□□□□□ -1.31
CCL3L3-201ENST00000612839 FXYD2P54710 66 aa6.85□□□□□ -1.31
CCL3L3-201ENST00000612839 REG3GQ6UW15 175 aa6.85□□□□□ -1.31
CCL3L3-201ENST00000612839 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.85□□□□□ -1.31
CCL3L3-201ENST00000612839 CEND1Q8N111 149 aa6.85□□□□□ -1.31
CCL3L3-201ENST00000612839 DIRC1Q969H9 104 aa6.85□□□□□ -1.31
CCL3L3-201ENST00000612839 LINC01600Q96MT4 127 aa6.85□□□□□ -1.31
CCL3L3-201ENST00000612839 HIST1H4GQ99525 98 aa6.85□□□□□ -1.31
CCL3L3-201ENST00000612839 HERC1Q15751 4861 aa6.85□□□□□ -1.31
CCL3L3-201ENST00000612839 TMEM238C9JI98 176 aa6.85□□□□□ -1.31
CCL3L3-201ENST00000612839 TIMM17BO60830 172 aa6.85□□□□□ -1.31
CCL3L3-201ENST00000612839 NPC2P61916 151 aa6.85□□□□□ -1.31
CCL3L3-201ENST00000612839 TMEM126AQ9H061 195 aa6.85□□□□□ -1.31
CCL3L3-201ENST00000612839 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.84□□□□□ -1.31
CCL3L3-201ENST00000612839 NDUFC2O95298 119 aa6.83□□□□□ -1.32
CCL3L3-201ENST00000612839 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.83□□□□□ -1.32
CCL3L3-201ENST00000612839 TNXBP22105 4242 aa6.82□□□□□ -1.32
CCL3L3-201ENST00000612839 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.82□□□□□ -1.32
CCL3L3-201ENST00000612839 RPL28P46779 137 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
CCL3L3-201ENST00000612839 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.82□□□□□ -1.32
CCL3L3-201ENST00000612839 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.81□□□□□ -1.32
CCL3L3-201ENST00000612839 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.81□□□□□ -1.32
CCL3L3-201ENST00000612839 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.81□□□□□ -1.32
CCL3L3-201ENST00000612839 SPANXCQ9NY87 97 aa6.81□□□□□ -1.32
CCL3L3-201ENST00000612839 UBE2AP49459 152 aa6.8□□□□□ -1.32
CCL3L3-201ENST00000612839 PRLHP81277 87 aa6.8□□□□□ -1.32
CCL3L3-201ENST00000612839 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa6.8□□□□□ -1.32
CCL3L3-201ENST00000612839 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.8□□□□□ -1.32
CCL3L3-201ENST00000612839 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.8□□□□□ -1.32
CCL3L3-201ENST00000612839 A6NDN8 102 aa6.79□□□□□ -1.32
CCL3L3-201ENST00000612839 PRYO14603 147 aa6.79□□□□□ -1.32
CCL3L3-201ENST00000612839 TAX1BP3O14907 124 aa6.79□□□□□ -1.32
CCL3L3-201ENST00000612839 SPRR1AP35321 89 aa6.79□□□□□ -1.32
CCL3L3-201ENST00000612839 KRTAP10-8P60410 259 aa6.79□□□□□ -1.32
CCL3L3-201ENST00000612839 Q6ZVH6 145 aa6.79□□□□□ -1.32
CCL3L3-201ENST00000612839 A0A1B0GWB2 263 aa6.79□□□□□ -1.32
CCL3L3-201ENST00000612839 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CCL3L3-201ENST00000612839 A0A1B0GV90 55 aa6.78□□□□□ -1.32
CCL3L3-201ENST00000612839 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
CCL3L3-201ENST00000612839 K7ERJ3 54 aa6.78□□□□□ -1.32
CCL3L3-201ENST00000612839 IGLV6-57P01721 117 aa6.78□□□□□ -1.32
CCL3L3-201ENST00000612839 A4D1N5 150 aa6.77□□□□□ -1.33
CCL3L3-201ENST00000612839 IFITM1P13164 125 aa6.77□□□□□ -1.33
CCL3L3-201ENST00000612839 S100A7L2Q5SY68 101 aa6.77□□□□□ -1.33
CCL3L3-201ENST00000612839 LINC00337Q8N6G1 96 aa6.77□□□□□ -1.33
CCL3L3-201ENST00000612839 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.77□□□□□ -1.33
CCL3L3-201ENST00000612839 CFC1BP0CG36 223 aa6.75□□□□□ -1.33
CCL3L3-201ENST00000612839 CFC1P0CG37 223 aa6.75□□□□□ -1.33
CCL3L3-201ENST00000612839 RAB37Q96AX2 223 aa6.75□□□□□ -1.33
CCL3L3-201ENST00000612839 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.75□□□□□ -1.33
CCL3L3-201ENST00000612839 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.74□□□□□ -1.33
CCL3L3-201ENST00000612839 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.73□□□□□ -1.33
CCL3L3-201ENST00000612839 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa6.73□□□□□ -1.33
CCL3L3-201ENST00000612839 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.73□□□□□ -1.33
CCL3L3-201ENST00000612839 COPS9Q8WXC6 57 aa6.73□□□□□ -1.33
CCL3L3-201ENST00000612839 A0A087X002 238 aa6.73□□□□□ -1.33
CCL3L3-201ENST00000612839 A0A0B4J2C4 111 aa6.73□□□□□ -1.33
CCL3L3-201ENST00000612839 C9orf118A6NHY6 69 aa6.73□□□□□ -1.33
CCL3L3-201ENST00000612839 B5MCH6 92 aa6.73□□□□□ -1.33
CCL3L3-201ENST00000612839 OR13C6PQ8NH95 151 aa6.73□□□□□ -1.33
CCL3L3-201ENST00000612839 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CCL3L3-201ENST00000612839 ANAPC11Q9NYG5 84 aa6.73□□□□□ -1.33
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CCL3L3-201ENST00000612839 Q6ZRX8 168 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL3L3-201ENST00000612839 SMCR5Q8TEV8 140 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL3L3-201ENST00000612839 H3BUT2 72 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL3L3-201ENST00000612839 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CCL3L3-201ENST00000612839 Q9BRP9 147 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL3L3-201ENST00000612839 PRO1854Q9UHT4 67 aa6.7□□□□□ -1.34
CCL3L3-201ENST00000612839 TSPAN13O95857 204 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL3L3-201ENST00000612839 CRYGAP11844 174 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL3L3-201ENST00000612839 CBY1Q9Y3M2 126 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL3L3-201ENST00000612839 ERC2-IT1O76042 136 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL3L3-201ENST00000612839 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL3L3-201ENST00000612839 SPRR4Q96PI1 79 aa6.68□□□□□ -1.34
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