RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610468.4

MUC1-222, Transcript of mucin 1, cell surface associated, human

TSL 1 (best)

Gene MUC1, Length 1,162 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MUC1-222	ENST00000610468		M0R143	59 aa		8.05	□□□□□ -1.12
MUC1-222	ENST00000610468	IGKV2D-28	P01615	120 aa		8.05	□□□□□ -1.12
MUC1-222	ENST00000610468	RETNLB	Q9BQ08	111 aa		8.05	□□□□□ -1.12
MUC1-222	ENST00000610468		A0A0U1RRA0	63 aa		8.04	□□□□□ -1.12
MUC1-222	ENST00000610468	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		8.04	□□□□□ -1.12
MUC1-222	ENST00000610468	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		8.04	□□□□□ -1.12
MUC1-222	ENST00000610468	C14orf144	Q96I85	54 aa		8.04	□□□□□ -1.12
MUC1-222	ENST00000610468	LINC00158	P58513	81 aa		8.03	□□□□□ -1.12
MUC1-222	ENST00000610468	PRLH	P81277	87 aa		8.03	□□□□□ -1.12
MUC1-222	ENST00000610468	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		8.03	□□□□□ -1.12
MUC1-222	ENST00000610468	TMEM126A	Q9H061	195 aa		8.03	□□□□□ -1.12
MUC1-222	ENST00000610468	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	8.02	□□□□□ -1.13
MUC1-222	ENST00000610468	DAND5	Q8N907	189 aa		8.02	□□□□□ -1.13
MUC1-222	ENST00000610468	HIGD1B	Q9P298	99 aa		8.02	□□□□□ -1.13
MUC1-222	ENST00000610468	TMEM238	C9JI98	176 aa		8.01	□□□□□ -1.13
MUC1-222	ENST00000610468	PCP2	Q8IVA1	136 aa		8.01	□□□□□ -1.13
MUC1-222	ENST00000610468	MUC17	Q685J3	4493 aa		8.01	□□□□□ -1.13
MUC1-222	ENST00000610468	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		8	□□□□□ -1.13
MUC1-222	ENST00000610468		M0R378	163 aa		8	□□□□□ -1.13
MUC1-222	ENST00000610468	CDIP1	Q9H305	208 aa		8	□□□□□ -1.13
MUC1-222	ENST00000610468	TIMM17B	O60830	172 aa		7.99	□□□□□ -1.13
MUC1-222	ENST00000610468	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		7.99	□□□□□ -1.13
MUC1-222	ENST00000610468	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		7.99	□□□□□ -1.13
MUC1-222	ENST00000610468	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	7.98	□□□□□ -1.13
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF815P	A8K554	130 aa		7.97	□□□□□ -1.13
MUC1-222	ENST00000610468	HSD52	Q0P140	79 aa		7.97	□□□□□ -1.13
MUC1-222	ENST00000610468	TAL2	Q16559	108 aa		7.97	□□□□□ -1.13
MUC1-222	ENST00000610468	COL5A1-AS1	Q5SY13	56 aa		7.97	□□□□□ -1.13
MUC1-222	ENST00000610468	C3orf22	Q8N5N4	141 aa		7.96	□□□□□ -1.14
MUC1-222	ENST00000610468	SNHG12	Q9BXW3	62 aa		7.95	□□□□□ -1.14
MUC1-222	ENST00000610468	SPAG11A	Q6PDA7	123 aa		7.94	□□□□□ -1.14
MUC1-222	ENST00000610468	C2orf91	Q6ZV80	131 aa		7.94	□□□□□ -1.14
MUC1-222	ENST00000610468	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		7.94	□□□□□ -1.14
MUC1-222	ENST00000610468	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		7.94	□□□□□ -1.14
MUC1-222	ENST00000610468		A6NDN8	102 aa		7.93	□□□□□ -1.14
MUC1-222	ENST00000610468	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	7.93	□□□□□ -1.14
MUC1-222	ENST00000610468	NDUFC2	O95298	119 aa		7.93	□□□□□ -1.14
MUC1-222	ENST00000610468	SPRR4	Q96PI1	79 aa		7.93	□□□□□ -1.14
MUC1-222	ENST00000610468	HIGD2A	Q9BW72	106 aa		7.93	□□□□□ -1.14
MUC1-222	ENST00000610468	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		7.93	□□□□□ -1.14
MUC1-222	ENST00000610468	SPANXC	Q9NY87	97 aa		7.93	□□□□□ -1.14
MUC1-222	ENST00000610468	SPRR1A	P35321	89 aa		7.92	□□□□□ -1.14
MUC1-222	ENST00000610468	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	7.92	□□□□□ -1.14
MUC1-222	ENST00000610468	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		7.91	□□□□□ -1.14
MUC1-222	ENST00000610468	BVES-AS1	Q5T3Y7	98 aa		7.91	□□□□□ -1.14
MUC1-222	ENST00000610468	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		7.91	□□□□□ -1.14
MUC1-222	ENST00000610468	KCNQ1DN	Q9H478	68 aa		7.91	□□□□□ -1.14
MUC1-222	ENST00000610468	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		7.9	□□□□□ -1.14
MUC1-222	ENST00000610468	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		7.9	□□□□□ -1.14
MUC1-222	ENST00000610468		A6NJY4	79 aa		7.9	□□□□□ -1.14
MUC1-222	ENST00000610468	NCR3	O14931	201 aa		7.9	□□□□□ -1.14
MUC1-222	ENST00000610468	IGLV6-57	P01721	117 aa		7.9	□□□□□ -1.14
MUC1-222	ENST00000610468	NPC2	P61916	151 aa		7.9	□□□□□ -1.14
MUC1-222	ENST00000610468	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		7.89	□□□□□ -1.15
MUC1-222	ENST00000610468		Q6ZVH6	145 aa		7.89	□□□□□ -1.15
MUC1-222	ENST00000610468	COPS9	Q8WXC6	57 aa		7.89	□□□□□ -1.15
MUC1-222	ENST00000610468	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	7.89	□□□□□ -1.15
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF706	Q9Y5V0	76 aa	Predicted RBP	7.89	□□□□□ -1.15
MUC1-222	ENST00000610468	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	7.88	□□□□□ -1.15
MUC1-222	ENST00000610468	BATF	Q16520	125 aa		7.88	□□□□□ -1.15
MUC1-222	ENST00000610468	KRTAP13-3	Q3SY46	172 aa		7.88	□□□□□ -1.15
MUC1-222	ENST00000610468	PRY	O14603	147 aa		7.87	□□□□□ -1.15
MUC1-222	ENST00000610468	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		7.87	□□□□□ -1.15
MUC1-222	ENST00000610468	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		7.86	□□□□□ -1.15
MUC1-222	ENST00000610468		Q8NBF4	154 aa		7.86	□□□□□ -1.15
MUC1-222	ENST00000610468	HIST1H4G	Q99525	98 aa		7.86	□□□□□ -1.15
MUC1-222	ENST00000610468	IFITM1	P13164	125 aa		7.85	□□□□□ -1.15
MUC1-222	ENST00000610468	ASB16-AS1	Q495Z4	193 aa		7.85	□□□□□ -1.15
MUC1-222	ENST00000610468	LINC00483	Q53H64	154 aa		7.85	□□□□□ -1.15
MUC1-222	ENST00000610468	C4orf48	Q5BLP8	95 aa		7.85	□□□□□ -1.15
MUC1-222	ENST00000610468	CEND1	Q8N111	149 aa		7.85	□□□□□ -1.15
MUC1-222	ENST00000610468	SPINK1	P00995	79 aa		7.84	□□□□□ -1.15
MUC1-222	ENST00000610468	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		7.82	□□□□□ -1.16
MUC1-222	ENST00000610468		A0A1B0GWB2	263 aa		7.81	□□□□□ -1.16
MUC1-222	ENST00000610468		B5MCH6	92 aa		7.81	□□□□□ -1.16
MUC1-222	ENST00000610468	ETDC	A0A1B0GVM5	59 aa		7.8	□□□□□ -1.16
MUC1-222	ENST00000610468	RPS29	P62273	56 aa	Known RBP	7.8	□□□□□ -1.16
MUC1-222	ENST00000610468		Q9BRP9	147 aa		7.79	□□□□□ -1.16
MUC1-222	ENST00000610468	KRTAP4-1	Q9BYQ7	146 aa		7.79	□□□□□ -1.16
MUC1-222	ENST00000610468	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		7.78	□□□□□ -1.16
MUC1-222	ENST00000610468	ERC2-IT1	O76042	136 aa		7.78	□□□□□ -1.16
MUC1-222	ENST00000610468	TAX1BP3	O14907	124 aa		7.77	□□□□□ -1.17
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	7.77	□□□□□ -1.17
MUC1-222	ENST00000610468	FXYD2	P54710	66 aa		7.77	□□□□□ -1.17
MUC1-222	ENST00000610468	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	7.77	□□□□□ -1.17
MUC1-222	ENST00000610468	LYRM7	Q5U5X0	104 aa		7.77	□□□□□ -1.17
MUC1-222	ENST00000610468		Q8N377	158 aa		7.77	□□□□□ -1.17
MUC1-222	ENST00000610468		A0A1B0GV90	55 aa		7.76	□□□□□ -1.17
MUC1-222	ENST00000610468		A4D1N5	150 aa		7.76	□□□□□ -1.17
MUC1-222	ENST00000610468	C9orf118	A6NHY6	69 aa		7.76	□□□□□ -1.17
MUC1-222	ENST00000610468	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	7.76	□□□□□ -1.17
MUC1-222	ENST00000610468	MOBP	Q13875	183 aa		7.76	□□□□□ -1.17
MUC1-222	ENST00000610468	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		7.76	□□□□□ -1.17
MUC1-222	ENST00000610468	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	7.76	□□□□□ -1.17
MUC1-222	ENST00000610468		A0A0B4J2C4	111 aa		7.75	□□□□□ -1.17
MUC1-222	ENST00000610468	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		7.75	□□□□□ -1.17
MUC1-222	ENST00000610468		Q6ZRX8	168 aa		7.75	□□□□□ -1.17
MUC1-222	ENST00000610468	SSBP3-AS1	Q7Z2R9	100 aa		7.75	□□□□□ -1.17
MUC1-222	ENST00000610468	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		7.73	□□□□□ -1.17
MUC1-222	ENST00000610468	SLC25A20	O43772	301 aa		7.73	□□□□□ -1.17

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